Projects / Programmes
HIGH-THROUGHPUT SENSING OF PROTEINS BY NANOPORES
| Code |
Science |
Field |
Subfield |
| 4.06.00 |
Biotechnical sciences |
Biotechnology |
|
| Code |
Science |
Field |
| 3.04 |
Medical and Health Sciences |
Medical biotechnology |
protein nanopores, high-throughput sensing, detection, histones
Researchers (8)
| no. |
Code |
Name and surname |
Research area |
Role |
Period |
No. of publicationsNo. of publications |
| 1. |
15686 |
PhD Gregor Anderluh |
Biochemistry and molecular biology |
Head |
2020 - 2023 |
981 |
| 2. |
31814 |
Urška Dečko |
|
Technical associate |
2020 - 2021 |
3 |
| 3. |
35382 |
PhD Matic Kisovec |
Biochemistry and molecular biology |
Researcher |
2020 - 2023 |
87 |
| 4. |
13627 |
PhD Franci Merzel |
Computer intensive methods and applications |
Researcher |
2020 - 2023 |
220 |
| 5. |
12048 |
PhD Marjetka Podobnik |
Biochemistry and molecular biology |
Researcher |
2020 - 2023 |
333 |
| 6. |
53732 |
Marija Srnko |
Biochemistry and molecular biology |
Researcher |
2020 - 2023 |
23 |
| 7. |
38479 |
PhD Aleksandra Šakanović |
Neurobiology |
Researcher |
2021 - 2022 |
28 |
| 8. |
50369 |
Gašper Šolinc |
|
Technical associate |
2020 - 2023 |
23 |
Organisations (1)
| no. |
Code |
Research organisation |
City |
Registration number |
No. of publicationsNo. of publications |
| 1. |
0104 |
National Institute of Chemistry |
Ljubljana |
5051592000 |
21,436 |
Abstract
Biološke nanopore so zaradi velike uporabnosti pri zaznavanju analitov vse bolj priljubljene v molekularni biotehnologiji, sinteznii biologiji in medicinskih aplikacijah. Nanopore so zelo stabilne strukture. Nastanejo na površini lipidnih membran in imajo dobro definirane lastnosti, kot je npr. premer pore, ki je v razponu nekaj nanometrov. Zaradi visoke stabilnosti jih je mogoče uporabljati pri aplikacijah, kjer lahko merimo ionske tokove, ki prehajajo skozi posamično poro. Metoda lahko zazna interakcijo različnih analitov z notranjostjo pore. Vezava analita ali zamašitev pore z analitom vodi do sprememb v ionskih tokovih in te blokade se razlikujejo pri različnih analitih. Metoda je izjemno občutljiva in se v zadnjem času precej uporablja za detekcijo različnih analitov, kot so majhne molekule, peptidi, beljakovine, RNA in DNA. V zadnjih letih je dobila še dodaten zagon in najlepši primer uporabe nanopor je določanje zaporedja DNA. Zaenkrat obstaja le peščica nanopor in nove pore s spremenjenimi lastnostmi so nujno potrebne za nadaljnje aplikacije. V tem projektu se bomo osredotočili na razvoj novih nanopor, ki jih tvorijo porotvorni proteini iz koral. V projektu bomo zasledovali naslednje cilje: i) pripravili bomo nanopore za stabilno vgradnjo v sistem z umetnimi membranami, ki bo omogočal učinkovito zaznavanje; ii) pripravili bomo nanopore za zaznavanje medicinsko pomembnih proteinov in iii) razvili bomo aplikacije na osnovi nanopor, ki bodo sposobne razločiti zelo podobne peptide in proteine. Nanopore, ki jih bomo pripravili v okviru projekta bodo bistveno izboljšale zmožnosti detekcije. Zagotovili bomo nove pore, ki bodo na voljo za učinkovito zaznavanje različnih drugih analitov. Takšnih pristopov primanjkuje, so pa nujno potrebni za učinkovito identifikacijo medicinsko pomembnih proteinov na hiter in enostaven način.
