Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Biološka zdravila: detektor tvorbe proteinskih delcev na osnovi tekočih kristalov

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.02.01  Naravoslovje  Fizika  Fizika kondenzirane materije 

Koda Veda Področje
P002  Naravoslovno-matematične vede  Fizika 

Koda Veda Področje
1.03  Naravoslovne vede  Fizika 
Ključne besede
mehka snov, senzor, tekoči kristali, biološka zdravila, proteini
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (24)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  38008  dr. Jure Aplinc  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2018  24 
2.  33694  dr. Dejan Arzenšek  Fizika  Raziskovalec  2017 
3.  33760  dr. Lamprini Athanasopoulou  Fizika  Raziskovalec  2019 - 2020 
4.  33197  dr. Simon Čopar  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  160 
5.  29523  dr. Anton Gradišek  Fizika  Raziskovalec  2018  435 
6.  37473  dr. Uroš Jagodič  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  26 
7.  34670  dr. Biljana Janković  Farmacija  Raziskovalec  2018 - 2020  137 
8.  12942  dr. Janez Kerč  Farmacija  Raziskovalec  2018 - 2020  240 
9.  16408  dr. Klemen Kočevar  Fizika  Raziskovalec  2018 - 2020  63 
10.  37526  dr. Žiga Kos  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2019  75 
11.  18355  dr. Drago Kuzman  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  64 
12.  03321  Ivan Kvasić  Fizika  Tehnični sodelavec  2017 - 2020  22 
13.  37364  dr. Jaka Marušič  Kemija  Raziskovalec  2017 
14.  36351  dr. Maruša Mur  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  21 
15.  09089  dr. Igor Muševič  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  750 
16.  35477  dr. Gregor Posnjak  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  34 
17.  25670  dr. Miha Ravnik  Fizika  Vodja  2017 - 2020  435 
18.  12338  dr. Miha Škarabot  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2020  253 
19.  37811  Mitja Štimulak  Mehanika  Raziskovalec  2019  28 
20.  38041  Ana Šušterič  Fizika  Raziskovalec  2017 
21.  26467  dr. Uroš Tkalec  Fizika  Raziskovalec  2018 - 2020  213 
22.  11035  dr. Aleksander Zidanšek  Fizika  Raziskovalec  2018  360 
23.  39544  Mitja Zidar  Fizika  Raziskovalec  2017 - 2018  12 
24.  07110  dr. Slobodan Žumer  Fizika  Raziskovalec  2017  1.026 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0106  Institut "Jožef Stefan"  Ljubljana  5051606000  90.649 
2.  0258  Lek farmacevtska družba d.d.  Ljubljana  1732811  8.424 
3.  1554  Univerza v Ljubljani, Fakulteta za matematiko in fiziko  Ljubljana  1627007  34.066 
Povzetek
Nadzor in razumevanje agregacije proteinov je danes odprt temeljni in aplikativni izziv pri razvoju in proizvodnji proteinov kot bioloških zdravil, saj vpliva na njihovo funkcionalnost, varnost, čistost, stabilnost njihovih raztopin, pakiranje in transportne metode. Agregacija proteinov tipično ni odvisna le od specifične molekularne strukture proteinov, ampak tudi od številnih (mikro-) okoljskih parametrov, vključno s temperaturo, pH-jem, pufri, surfaktanti, stabilizatorji in tonicifatorji, kar zahteva, gledano z biofarmacevtske perspektive, številne preiskave različnih proteinskih sistemov preden so lahko končne raztopine – biološka zdravila – razvita in poslana na tržišče. Vendar za določanje agregacijskega obnašanja danes obstaja le malo robustnih in učinkovitih metod, ki bi omogočale študije širokega razpona proteinskih molekul in to preko širokega razpona velikosti agregatov, pri čemer je poseben izziv detekcija sub-vidnih proteinskih agregatov. Zato bi razvoj tovrstne tehnologije in novo temeljno znanje v tej smeri pomenilo velik napredek na področju biofarmacevtike. V tem projektu s področja aplikativne fizike mehkih snovi je osrednji cilj razviti konceptualno novo linijo senzorjev za detekcijo vidne in subvidne agregacije proteinov na osnovi tekočekristalnih tekočin in hkrati raziskati vlogo površin na agregacijo proteinov, vse neposredno koristno v biofarmacevtski industriji. Osrednji mehanizem v tem projektu bo izraba tekočekristalnih tekočin kot materialov za optično detekcijo, pri čemer bo zaznavanje temeljilo na selektivni adsorpciji proteinov in/ali njihovih agregatov na stik med raztopino proteinov in tekočih kristalov. Kot posledica prisotnosti agregatov na stičnih površinah se bo spremenila molekularna urejenost tekočekristalnih tekočin, kar pa bomo lahko učinkovito detektirali z različnimi brezkontaktnimi optičnimi metodami. S takim pristopom bomo ustvarili visoko občutljive in hitro odzivne (~ms) optične senzorje agregacije, ki bodo imeli predvideno okno za detekcijo agregatov v območju od vidnih do globoko sub-vidnih velikosti. Osrednja znanstvena vprašanja projekta bodo usmerjena v določitev: (i) vloge geometrije in topologije površin na agregacijo proteinov, (ii) vpliva površin na velikost in lastnosti agregatov, kot tudi na dinamiko agregacije na površini, in (iii) uporabo svetlobe in/ali plazmonike kot mogočih mehanizmov za nadzor agregacije in celo razbitje agregatov. Metodološko bomo v okviru projekta razvili nove pristope za detekcijo proteinskih agregatov na površinah, ki bodo temeljili na polarizacijski, fluorescenčni, in STED mikroskopiji kot tudi optični spektroskopiji. Naštete tehnike so na svetovnem nivoju najsodobnejši pristopi k temeljnim in aplikativnim izzivom moderne biotehnologije in znanosti v splošnem. Projekt bosta izvedli ljubljanska skupina za mehko snov in biofarmacevtska skupina podjetja Lek d.d., del skupine Novartis, ki je industrijski partner tega projekta. Obe skupini sta na svojih področjih svetovno prepoznavni in odlikovani s svojim teoretičnim in eksperimentalnim delom in visokimi znanstvenimi standardi; članki povezani s tem predlogom vključujejo npr. PNAS 2016, Nature Comm. 2016, Sci. Rep. 2016 in Nature Phys. 2015. Socialno-ekonomski rezultati tega projekta bodo omogočili široko razširjanje rezultatov opravljenih raziskav, prispevali k odličnosti Slovenije in mednarodno, ter ustvarili novo temeljno in aplikativno znanju neposredno koristno za slovensko (bio)farmacevtsko industrijo. Splošneje je projekt prispevek k samemu vrh sodobne temeljne in aplikativne biofarmacevtike, z osrednjim ciljem ustvariti nove znanstvene in tehnološke pristope za nadzor organizacije bio-relevantnih makromolekul na mikroskopskem in makroskopskem nivoju.
Pomen za razvoj znanosti
Enaindvajseto stoletje se pogosto označuje kot stoletje biotehnologije, pri čemer je ključen cilj in izziv nadzirati življenje in življenjske mehanizme s pomočjo znanosti in tehnologije. Pri tem lahko že majhni uspehi v tej smeri povzdignejo znanost na nov nivo in služijo v dobrobit človeštva. Predlagani aplikativni raziskovalni projekt je ambiciozen in v vrhu znanosti mehke snovi in biofarmacevtike, ki ustvarja novo pot za prenos znanja in tehnologije med dvema področjema na fundamentalnem in aplikativnem nivoju. Glavni znanstveni doprinos tega predloga bo raziskovanje agregacije proteinov pod vplivom površin, kar je rezultat, ki lahko opazno vpliva na bazične kot tudi aplikativne koncepte v biotehnologiji, farmaciji, medicini in znanosti kondenzirane snovi. Pričakovani rezultati bodo imeli še poseben znanstveni doprinos na področjih: (i) vpliva geometrije in topologije površin na agregacijo proteinov, (ii) vpliva površin na velikost in lastnosti agregatov ter njihovo dinamiko in (iii) uporabi svetlobe in/ali plazmonike kot možnih mehanizmov nadzora agregacije. Glavni metodološki doprinos projekta bo razvoj novih tehnik detekcije agregacije proteinov na površinah, ki bodo osnovane na polarizacijski, fluorescenčni in STED mikroskopiji ter optični spektroskopiji. V projektni skupini je zbrano vrhunsko znanje za izvedbo tega projekta – tako eksperimentalno, kot tudi teoretično – in združuje najnaprednejšo uporabo kompleksnih tekočin ter aplikativno uporabo proteinov v biofarmacevtskih sredstvih. Če posplošimo, je predlagani projekt usmerjen v špico današnje in bodoče biotehnologije, natančneje biofarmacevtike, z namenom razviti nove znanstvene in tehnološke pristope za kontrolo organizacije biorelevantnih makromolekul na mikroskopskem in makroskopskem nivoju.
Pomen za razvoj Slovenije
Slovenija je biofarmacevtiko, področje, znotraj katerega se bodo odvijale aktivnosti projekta, identificirala kot enega od fokusnih področij in tehnologij znotraj prioritetnega področja pametne specializacije Zdravje-medicina, kar se je nedavno samo še potrdilo z odločitvijo o sofinanciranju štiriletnega programa »Nova generacija bioloških zdravil - BioPharm.SI« v vrednosti 6.0 milijonov EUR, ki bo vključeval SMEs, veliko farmacevtsko podjetje Lek in novoustanovljena podjetja, kar skupaj z raziskovalnimi organizacijami ustvarja izjemno kritično maso odličnih deležnikov ter s tem Slovenijo postavlja kot enega globalnih stebrov na področju proizvodnje bioloških zdravil. Za razliko od Biopharm.SI pa je predlagani projekt usmerjen na razvoj inovativnega senzorja/metode za proučevanje stabilnosti biološkega zdravila, kar je ključno v fazah, ki sledijo bioprocesu – čiščenje zdravila, shranjevanje ter formuliranje v končni produkt – vse osrednji procesi pri pripravi bioloških zdravil za na trg. V Sloveniji imamo vrhunsko znanje in tehnologijo na na prvi pogled nepovezanih področjih – biofarmacija, fizika tekočih kristalov ter znanost mehkih snovi. Utemeljeno verjamemo, da z njihovo integracijo lahko kot eni prvih na svetu izkoristimo nišno priložnost za Slovenijo in da biofarmacevtski panogi ponudimo visoko tehnološko orodje, ki bo omogočalo hitrejši razvoj stabilnega biološkega zdravila. Glede na to, da je lahko vrednost razvoja biološkega zdravila nekaj 100 milijonov EUR, predstavljajo predlagani senzorji možnost za velike prihranke oziroma poslovno priložnost za novo ustanovljeno podjetje na področju senzorike za spremljanje agregacije biološkega zdravila.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Vmesno poročilo, zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Vmesno poročilo, zaključno poročilo
Zgodovina ogledov
Priljubljeno