Projekti / Programi
Napredne genomske analize slovenskih otrok z motnjami avtističnega sprektra
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 3.09.00 |
Medicina |
Psihiatrija |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| B220 |
Biomedicinske vede |
Genetika, citogenetika |
| Koda |
Veda |
Področje |
| 3.02 |
Medicinske in zdravstvene vede |
Klinična medicina |
motnje avtističnega spektra (MAS), sekvenciranje nove generacije (NGS), napredne genetske analize
Raziskovalci (1)
| št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
| 1. |
30811 |
dr. Danijela Krgović |
Onkologija |
Vodja |
2018 - 2020 |
79 |
Organizacije (1)
Povzetek
Motnje avtističnega spektra (MAS) so ena najbolj kompleksnih vedenjskih motenj, katerih prevalenca se v populaciji z leti konstantno zvišuje. Motnje so rezultat kompleksne interakcije genov in okolja, z močnim jasnim genetskim vplivom. V zadnjih nekaj letih je na področju genetike MAS dosežen viden napredek. V preteklosti so družinske študije in študije dvojčkov pokazale velik vpliv genetskih dejavnikov na razvoj te bolezni. Tehnični preboji na področju genetike pa so omogočili iskanje teh genetskih faktorjev. Tako danes vemo, da genetski dejavniki, njihov prispevek se ocenjuje na več kot 50%, ki prispevajo k MAS obsegajo različne mutacijske mehanizme, vključno z redkimi spremembami enega nukleotida (SNV), strukturnimi genomskimi variabilnostmi (SGV), kromosomskimi spremembami in pogostimi polimorfnimi različicami (SNP). Čeprav SNV pojasnijo nastanek motnje le v približno 1% primerov, so ravno te redke podedovane ali na novo nastale različice z visoko penetranco, ki motijo normalno izražanje enega samega gena, ključne za razumevanje etiologije MAS in razvoj metod zdravljenja.
Cilji naše raziskave slonijo na proučevanju prisotnosti redkih genetskih različic (SNV) pri slovenskih otrocih z idiopatskim MAS z uporabo najnovejše tehnologije, sekvenciranje nove generacije (metoda NGS). Pri tem se bomo predvsem osredotočili določevanju vpliva analizirane različice na razvoj motnje pri posamezniku in postavitve genotip–fenotip povezave. Raziskava nam bo prav tako omogočila oceno učinkovitosti (diagnostični izplen) uporabe metode NGS, kot diagnostične metode pri slovenski otrocih. S pomočjo te študije bomo lahko določili genetski vzrok za MAS pri znatno večjem številu pacientov, kar bo bistveno pripomoglo k boljši napovedi bolezni pri otroku, zmanjšanju sekundarnih kliničnih znakov ter boljših možnosti zdravljenja. Boljša genetska obravnava otroka bo posledično pripomogla tudi k dobrobiti celotne družine, v smislu genetskega svetovanja za sorojence ali načrtovanje naslednje nosečnosti.
Pomen za razvoj znanosti
Vsebina te raziskave je pomembna tako za medicinski kot družbeni razvoj Slovenije:
Določitev genetskega vzroka nastanka MAS pri otrocih, ki so že bili genetsko testirani a zaradi omejitev uporabljenih metod genetskih nepravilnosti do sedaj nismo mogli določiti.
Odkritje vzroka bolezni pomeni cenejšo obravnavo bolnikov, saj se izognemo številnim nepotrebnim dodatnim preiskavam.
Z opredelitvijo genetskega vzroka nastanka motnje pri bolniku bomo pripomogli k boljši genetski obravnavi otroka in njegove družine, boljši napovedi bolezni pri otroku ter možnosti usmeritve k tarčnem zdravljenju (Expert Opin Pharmacother. 2012;13:1615-29).
Vpeljava metode NGS v diagnostiko motenj MAS v LMG, UKC MB bo pripomogla k vpeljavi že prej omenjene metode tudi na druga področja, kot so uporabe metode v diagnostiko širšega razpona razvojno-nevroloških bolezni, tumorske genetike ipd.
V anonimni obliki bodo pridobljeni rezultati vključeni v podatkovne baze mednarodnih konzorcijev, ki so v svetovnem merilu vodilni na področju genetike razvojno-nevroloških motenj (Decipher, CliVar) in so ključni za interpretacijo in klasifikacijo sprememb določenih z metodo NGS v diagnostiki le-teh.
Pomen za razvoj Slovenije
The content of this research is important both for the medical and social development of Slovenia:
Determining the genetic cause of ASD in children who have already been genetically tested, but due to limitations of the methods used, genetic abnormalities could not be determined so far.
Finding the cause of disease means more economical treatment of patients, as we avoid many unnecessary additional investigations.
By defining the genetic cause of a patient's disorder, we will contribute to a better genetic treatment of the child and his family, better predictions of the disease in the child, and the possibility of focusing on targeted treatment (Expert Opin Pharmacother. 2012;13:1615-29).
The introduction of the NGS methodology in the diagnostic of ASD disorders in LMG, UKC MB will help introduce the aforementioned method to other areas, such as the use of the method in the diagnosis of a wider range of neurodevelopmental disorders, tumour genetics, etc.
In anonymous form, the results obtained in this study will be included in the databases of globally leading international consortium which are crucial in the field of genetics of neurodevelopmental disorders (Decipher, ClinVar) and are key in the interpretation and classification of mutations identified by the NGS method in this disorders.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
Zaključno poročilo
