Loading...
Projekti / Programi vir: ARRS

Odkrivanje dinamike omrežja v interakciji krompirjev virus Y-rastlinska celica

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.03.04  Naravoslovje  Biologija  Rastlinska fiziologija 

Koda Veda Področje
1.06  Naravoslovne vede  Biologija 
Ključne besede
krompir, krompirjev virus Y, interakcija PVY-rastlina, prostorsko-časovna analiza, sistemska biologija, strukturna analiza
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
6.346,39
A''
1.576,56
A'
4.021,1
A1/2
4.843,34
CI10
12.073
CImax
273
h10
49
A1
23,69
A3
24,32
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 01. februar 2023; A3 za obdobje 2016-2020
Podatki za razpise ARRS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  645  16.915  13.739  21,3 
Scopus  680  18.896  15.390  22,63 
Raziskovalci (20)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacij
1.  55978  Primož Bembič    Tehnični sodelavec  2021 - 2023 
2.  24290  dr. Matej Butala  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  224 
3.  34130  dr. Anna Coll Rius  Biokemija in molekularna biologija  Vodja projekta  2020 - 2023  138 
4.  12688  dr. Kristina Gruden  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2023  930 
5.  27827  dr. Jon Gutierrez Aguirre  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2023  337 
6.  53283  Maja Hostnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  11 
7.  51987  Mojca Juteršek  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2020 - 2023  36 
8.  50722  Luka Kavčič    Tehnični sodelavec  2021 - 2023  23 
9.  38255  dr. Andreja Kežar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  31 
10.  35382  dr. Matic Kisovec  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  67 
11.  36323  dr. Tjaša Lukan  Biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  86 
12.  55449  Martina Mravinec  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2023 
13.  39090  dr. Anastasija Panevska  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2020  45 
14.  12048  dr. Marjetka Podobnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  288 
15.  05229  dr. Maja Ravnikar  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2023  1.321 
16.  15328  dr. Kristina Sepčić  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2023  695 
17.  29635  Katja Stare  Biologija  Tehnični sodelavec  2020 - 2023  77 
18.  50566  dr. Špela Tomaž  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2023  22 
19.  09864  dr. Magda Tušek Žnidarič  Biologija  Tehnični sodelavec  2020 - 2023  395 
20.  27522  dr. Anže Županič  Sistemi in kibernetika  Raziskovalec  2020 - 2023  160 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacij
1.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  20.371 
2.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.166 
3.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  64.100 
Povzetek
Krompirjev virus Y je rastlinski virus, ki povzroča največje ekonomske izgube, saj negativno vpliva na pridelavo krompirja po vsem svetu. Da izpolni svoj infekcijski cikel, ki vključuje vstop v gostiteljsko celico, translacijo, replikacijo, prehajanje med celicami in enkapsidacijo, PVY ugrabi molekularne mehanizme okužene gostiteljske celice. Vsak korak vključuje številne virusne faktorje (nukleinsko kislino in/ali proteine) ter rastlinske proteine, ki prispevajo k razvoju optimalne virusne okužbe. Tako se tekom infekcijskega cikla vzpostavi kompleksno interakcijsko omrežje, ki je dinamično v času in prostoru ter vključuje tako virusne kot rastlinske komponente. Za študij dinamične narave interakcij potrebujemo inovativne in interdisciplinarne pristope, zato bomo v projektu združili strukturne analize ter in planta funkcijske študije na osnovi testov ''pull-down'' in mikroskopije v realnem času. Z naštetimi metodami bomo raziskali interakcijsko omrežje virusnih in gostiteljskih komponent vključenih v različnih stopnjah okužbe s PVY. Pridobljene podatke - novoodkrite molekulske interakcije in kinetične ter strukturne podatke, bomo vnesli v model rastlinske obrambne signalizacije. Predlagani projekt bo prispeval preboj v razumevanju proteinskih interakcij, ki se vzpostavijo med okužbo s PVY. To nam bo omogočilo pojasniti mehanizem delovanja virusa PVY, na podlagi katerega se lahko razvijejo nove strategije obvladovanja virusnih okužb in določijo potencialne tarče za žlahtnjenje poljščin. Poleg tega bo projekt prispeval nova raziskovalna orodja namenjena spremljanju sprememb v interaktomu tudi pri drugih patosistemih. S strokovnimi znanji na področjih interakcije virusa PVY z rastlinami in proteinskih struktur bodo k uspešni izvedbi projekta prispevali vsi partnerji v projektu - Nacionalni inštitut za biologijo, Nacionalni inštitut za kemijo in Biotehniška Fakulteta Univerze v Ljubljani.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno