Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Odkrivanje dinamike omrežja v interakciji krompirjev virus Y-rastlinska celica

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.03.04  Naravoslovje  Biologija  Rastlinska fiziologija 

Koda Veda Področje
1.06  Naravoslovne vede  Biologija 
Ključne besede
krompir, krompirjev virus Y, interakcija PVY-rastlina, prostorsko-časovna analiza, sistemska biologija, strukturna analiza
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
6.639,53
A''
1.848,26
A'
4.119,63
A1/2
5.047,37
CI10
14.596
CImax
346
h10
55
A1
25,05
A3
14,45
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 13. julij 2024; A3 za obdobje 2018-2022
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  682  19.266  15.875  23,28 
Scopus  724  21.723  17.954  24,8 
Raziskovalci (20)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  55978  Primož Bembič  Biokemija in molekularna biologija  Tehnični sodelavec  2021 - 2024 
2.  24290  dr. Matej Butala  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  237 
3.  34130  dr. Anna Coll Rius  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2020 - 2024  164 
4.  12688  dr. Kristina Gruden  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2024  992 
5.  27827  dr. Jon Gutierrez Aguirre  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2024  364 
6.  53283  Maja Hostnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  19 
7.  51987  dr. Mojca Juteršek  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2020 - 2022  43 
8.  50722  Luka Kavčič    Tehnični sodelavec  2021 - 2024  32 
9.  38255  dr. Andreja Kežar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  46 
10.  35382  dr. Matic Kisovec  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  86 
11.  36323  dr. Tjaša Lukan  Biologija  Raziskovalec  2020 - 2021  127 
12.  55449  Martina Mravinec  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021  11 
13.  39090  dr. Anastasija Panevska  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2020  57 
14.  12048  dr. Marjetka Podobnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  329 
15.  05229  dr. Maja Ravnikar  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2024  1.373 
16.  15328  dr. Kristina Sepčić  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2020 - 2024  741 
17.  29635  Katja Stare  Biologija  Tehnični sodelavec  2020 - 2024  88 
18.  50566  dr. Špela Tomaž  Biotehnologija  Raziskovalec  2020 - 2023  28 
19.  09864  dr. Magda Tušek Žnidarič  Biologija  Tehnični sodelavec  2020 - 2024  416 
20.  27522  dr. Anže Županič  Sistemi in kibernetika  Raziskovalec  2020 - 2024  184 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.454 
2.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  21.237 
3.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  67.219 
Povzetek
Krompirjev virus Y je rastlinski virus, ki povzroča največje ekonomske izgube, saj negativno vpliva na pridelavo krompirja po vsem svetu. Da izpolni svoj infekcijski cikel, ki vključuje vstop v gostiteljsko celico, translacijo, replikacijo, prehajanje med celicami in enkapsidacijo, PVY ugrabi molekularne mehanizme okužene gostiteljske celice. Vsak korak vključuje številne virusne faktorje (nukleinsko kislino in/ali proteine) ter rastlinske proteine, ki prispevajo k razvoju optimalne virusne okužbe. Tako se tekom infekcijskega cikla vzpostavi kompleksno interakcijsko omrežje, ki je dinamično v času in prostoru ter vključuje tako virusne kot rastlinske komponente. Za študij dinamične narave interakcij potrebujemo inovativne in interdisciplinarne pristope, zato bomo v projektu združili strukturne analize ter in planta funkcijske študije na osnovi testov ''pull-down'' in mikroskopije v realnem času. Z naštetimi metodami bomo raziskali interakcijsko omrežje virusnih in gostiteljskih komponent vključenih v različnih stopnjah okužbe s PVY. Pridobljene podatke - novoodkrite molekulske interakcije in kinetične ter strukturne podatke, bomo vnesli v model rastlinske obrambne signalizacije. Predlagani projekt bo prispeval preboj v razumevanju proteinskih interakcij, ki se vzpostavijo med okužbo s PVY. To nam bo omogočilo pojasniti mehanizem delovanja virusa PVY, na podlagi katerega se lahko razvijejo nove strategije obvladovanja virusnih okužb in določijo potencialne tarče za žlahtnjenje poljščin. Poleg tega bo projekt prispeval nova raziskovalna orodja namenjena spremljanju sprememb v interaktomu tudi pri drugih patosistemih. S strokovnimi znanji na področjih interakcije virusa PVY z rastlinami in proteinskih struktur bodo k uspešni izvedbi projekta prispevali vsi partnerji v projektu - Nacionalni inštitut za biologijo, Nacionalni inštitut za kemijo in Biotehniška Fakulteta Univerze v Ljubljani.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno