Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Platforma osnovana na sintetičnih biofilmih za preučevanje in razvoj novih proti biofilmskih pristopov

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.05.00  Naravoslovje  Biokemija in molekularna biologija   

Koda Veda Področje
1.06  Naravoslovne vede  Biologija 
Ključne besede
sintetični biofilmi, umetni biofilmi, protimikrobna sredstva, antibiotiki, fiziologija, odstranjevanje biofilmov, antibiofilm, EPS, zunajcelične polimerne snovi
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
3.251,43
A''
666,04
A'
1.367,63
A1/2
2.345,02
CI10
5.562
CImax
275
h10
39
A1
11,61
A3
1,6
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 23. maj 2024; A3 za obdobje 2018-2022
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  236  7.020  6.073  25,73 
Scopus  239  7.442  6.452  27 
Raziskovalci (12)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  58340  Alba Calonge Sanz    Tehnični sodelavec  2023 - 2024 
2.  24407  dr. Iztok Dogša  Biotehnologija  Vodja  2021 - 2024  194 
3.  52167  dr. Andi Erega  Biotehnologija  Raziskovalec  2021  27 
4.  56432  Terezija Jovanovski  Biotehnologija  Raziskovalec  2022 
5.  22492  dr. Barbara Kraigher  Biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  123 
6.  53622  dr. Mojca Krajnc  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  28 
7.  05993  dr. Ines Mandić-Mulec  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  641 
8.  39099  dr. Katja Molan  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  41 
9.  26104  Peter Peršolja  Farmacija  Raziskovalec  2022 - 2024 
10.  13005  dr. David Stopar  Rastlinska produkcija in predelava  Raziskovalec  2021 - 2024  470 
11.  38987  dr. Katarina Šimunović  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  105 
12.  28905  dr. Nace Zidar  Farmacija  Raziskovalec  2021 - 2024  220 
Organizacije (2)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta  Ljubljana  1626914  66.745 
2.  0787  Univerza v Ljubljani, Fakulteta za farmacijo  Ljubljana  1626973  17.240 
Povzetek
Vsesplošno je znano, da bakterije v biofilmih predstavljajo resno grožnjo človeštvu. Pri tem vse več raziskav kaže, da so zunajcelične polimerne snovi (EPS) tista komponenta biofilma, ki celice v biofilmih odločilno ščiti tako pred mehanskimi napadi kot tudi napadi s protimikrobnimi snovmi. Zato je ključno, da razumemo kako različne komponente EPS in njihova strukturiranost prispevajo k protibiofilmski odpornosti. V zadnjem desetletju je sintetična biologija dosegla hiter napredek, kljub temu pa je bilo na področju raziskav biofilmov bore malo inženirstva. Naš predlog je, da kot prvi ustvarimo umetne biofilme, sestavljene iz več naravnih eksopolimernih spojin (EPS), kjer bomo lahko kontrolirano spreminjali EPS sestavo in s tem ugotavljali njeno povezanost tako z mehansko kot biocidno odpornostjo. Velika raznolikost bakterijskega EPS vključuje ß-fruktan polisaharid levan, amiloidni protein TasA, polianion y-poliglutaminska kislina in eDNA. Vse te komponente želimo izolirati in strukturno okarakterizirati. Z mešanjem teh zares različnih polimerov bomo lahko zgradili umetne biofilme s prilagojenimi mehanskimi in difuzibilnimi lastnostmi, ki bodo tvorili raziskovalno platformo, ki trenutno ne obstaja. Sintetični biofilmi z EPS različne sestave bodo vsebovali celice divjega tipa, ki jih bomo vnesli v EPS na dva načina. Prvi način je z razprševanjem večine bakterijskih celic med ali po sestavi matrikska, s čimer se ustvari prostorsko naključna porazdelitev. Drugi pristop bo uporaba optične pincete, ki deluje v načinu več pasti, kjer bodo posamezne celice umeščene v matriks, ki bo predhodno oblikovan v mikrofluidni napravi. ??Tako bomo naredili umetne mikrobiofilme z določeno prostorsko porazdelitvijo. Tako sestavljene sintetične biofilme bomo izpostavili mehanskemu stresu in delovanju protimikrobnih snovi, kar predstavljatrenutne strategije za izkoreninjenje biofilmov Najpomembnejše mehanske lastnosti gelskih struktur, kot je biofilm, so viskoelastični parametri, ki določajo strukturni odziv na zunanjo strižno silo, kar lahko merimo z rotacijsko in mikro reologijo. Viskoelastični parametri so tesno povezani s poroznostjo in difuzijskimi lastnostmi biofilma, kar vpliva na penetracijo antimikrobnih sredstev. Trenutno nimamo jasne slike o tem, kako različne komponente EPS vplivajo na mehanske in difuzijske lastnosti biofilmov in kako je to povezano z učinkovitostjo protibiofilmskih pristopov. Zato naši novo oblikovani sintetični biofilmi z nadzorovanimi mehanskimi in difuzijskimi lastnostmi nudijo edinstveno priložnost za izboljšanje našega razumevanja odpornih, zdravju škodljivih in korozivnih biofilmov. Znanje o šibkih točkah v strukturi biofilma nam bo omogočilo tudi nasprotno- fromiranje super odpornih biofilmov. Sestavili jih bomo iz odpornega EPS in predizbranih odpornih celic. Tako pripravljene biofilmske trdnaje so idelane za testiranje novih protimikrobnih sredstev. Super odporni biofilmi, izdelani po meri, bodo izpostavljeni delovanju konvencionalnih in novih protimikrobnih sredstev - fitokanabinoidov in inhibitorjev DNA giraze, ki so bili nedavno odkriti in se lahko kemično modificirajo, da bi povečali uničenje biofilma. S konfokalno lasersko skenirno mikroskopijo in diferencialnim barvanjem bomo opazovali viabilnost posameznih celic in njihov položaj v biofilmu. Z uporabo fluorescenčnih tehnik (FRAP) bomo določili biofilmske difuzijske lastnosti. Na podlagi analize zbranih podatkov bomo lahko najverjetneje zagotovili nove protimikrobne snovi in ??spoznanja za razrešitev dileme dramatične protimikrobne odpornosti v biofilmih. Zagotovili bomo lahko bistvene smernice za racionalno načrtovanje boljših protimikrobnih zdravil. V tem projektu bomo uveljavili inženirski pristop za dekonstrukcijo naravnega in to nato rekonstruirali na način, ki najbolj ustreza našim potrebam.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno