Projekti / Programi
Odkrivanje in z vodo povezana epidemiologija porajajočih se tobamovirusov, ki okužujejo kmetijske rastline
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 4.03.00 |
Biotehnika |
Rastlinska produkcija in predelava |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| 4.01 |
Kmetijske vede in veterina |
Kmetijstvo, gozdarstvo in ribištvo |
tobamovirusi, vode za namakanje, epidemiologija, zanesljiva detekcija
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan
23. marec 2023;
A3 za obdobje 2017-2021
Podatki za razpise ARRS (
04.04.2019 - Programski razpis,
arhiv
)
| Baza |
Povezani zapisi |
Citati |
Čisti citati |
Povprečje čistih citatov |
| WoS |
241 |
9.729 |
8.882 |
36,85 |
| Scopus |
255 |
10.565 |
9.648 |
37,84 |
Raziskovalci (16)
Organizacije (3)
Povzetek
V zadnjih desetletjih postajajo rastlinska obolenja, povzročena z novimi virusi, vedno pomembnejša tako z vidika njihove pojavnosti kot ekonomskega vpliva. Trenutno je gospodarsko najpomembnejši virus rjave grbančavosti plodov paradižnika oziroma ToBRFV, ki je bil prvič zaznan okoli leta 2014 v Izraelu. Od takrat se izbruhi virusa pojavljajo po vsem svetu, pred kratkim tudi v nekaj državah Evrope, in ogrožajo pridelavo paradižnika in paprike, glavnih gostiteljev virusa ToBRFV. Omenjeni poljščini pa okužujejo tudi drugi tobamovirusi – primer je virus blage lisavosti paradižnika ali ToMMV, ki se je prvič pojavil leta 2013 v Mehiki in se razširil v Severno in Južno Ameriko, Azijo ter Evropo. Sposobnost naglega razširjanja tobamovirusov in njihovega visokega potenciala za povzročitev epidemije izhajata iz njihovih fizikalnih in bioloških lastnosti. Za zmanjšanje tveganja na področju kmetijstva, ki ga ti virusi predstavljajo, sta ključna pridobivanje zadostnega znanja o njihovem izvoru ter razvoj učinkovitih testov za njihovo zaznavanje. V sklopu predlaganega projekta bi člani raziskovalne skupine preko (meta)analize že obstoječih serij podatkov o virusnih zaporedjih iskali možne nepoznane vrste tobamovirusov v različnih rastlinskih gostiteljih in medijih. Pridobljeno znanje bi tako omogočilo globlje razumevanje pojava gospodarsko pomembnih tobamovirusov ter razvoj načinov za preprečevanje in zajezitev njihovega razširjanja. Najpomembnejši način vnosa tobamovirusov v nove države ali regije je preko okuženega semenskega in sadilnega materiala. Ko je virus vnesen v novo okolje, se zaradi visoke stabilnosti preko različnih mehanskih načinov hitro prenese na druge rastline. Študije poročajo, da je virus ToBRFV sposoben dolgotrajnega preživetja na različnih površinah in pod različnimi okoljskimi pogoji, zaradi česar ga je z uporabo že razvitih dezinfekcijskih tehnik izredno težko odstraniti iz pridelovalne verige oziroma sistema. Njegova RNA je bila zaznana tudi v nekaterih vzorcih vode, vendar pa mehanizem virusnega prenosa preko vodnih medijev, predvsem namakalne vode, še ni v celoti razumljiv in bo predmet raziskave predlaganega projekta. S pridobljenimi informacijami bo bolje razumljiva sicer kompleksna epidemiologija virusa ToBRFV, obenem pa bo to omogočilo izvedbo analize tveganja, s katero bomo definirali kritične točke za zajezitev virusa in nadzor nad njim. Podobne raziskave bodo izvedene tudi za virus ToMMV in druge gospodarsko nevarne tobamoviruse. Poleg poglobljenega znanja o mehanizmu in kinetiki razširjanja tobamovirusov so za njihovo obvladovanje pomembne zanesljive in hitre metode njihovega zaznavanja. Trenutno obstajajo številni molekularni testi za identifikacijo virusa ToBRFV v rastlinskem in semenskem materialu, vendar ti še niso validirani za namene nadzorovanja pojavnosti virusa v namakalnih vodah. Potreba po razvoju primernih metod za spremljanje se pojavlja tudi pri drugih tobamovirusih, predvsem pri ToMMV. Znaten delež vsebine predlaganega projekta se nanaša na razvoj zanesljivih diagnostičnih postopkov, tako laboratorijskih kot terenskih, za nadzor nad novimi in že poznanimi tobamovirusi v namakalnih vodah. Izkušena in visoko usposobljena skupina raziskovalcev bo s svojim delom zagotovila uspešno izvedbo študij, vezanih na razumevanje prenosa tobamovirusov preko vodnih medijev in njihovih epidemioloških značilnosti ter postopkov zaznavanja in spremljanja pojavnosti novih in že identificiranih vrst tobamovirusov. Rezultati projekta bodo zagotovili boljše možnosti za zaščito rastlin pred patogenimi virusi, kar zaradi podnebnih sprememb, pojava nepoznanih virusov in obsežnega premikanja rastlin ter njihovih produktov preko globalnega trgovanja postaja vedno pomembnejše.
