Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Odkrivanje in z vodo povezana epidemiologija porajajočih se tobamovirusov, ki okužujejo kmetijske rastline

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.03.00  Biotehnika  Rastlinska produkcija in predelava   

Koda Veda Področje
4.01  Kmetijske vede in veterina  Kmetijstvo, gozdarstvo in ribištvo 
Ključne besede
tobamovirusi, vode za namakanje, epidemiologija, zanesljiva detekcija
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
3.129,02
A''
619,11
A'
1.667,19
A1/2
2.206,17
CI10
10.861
CImax
1.510
h10
49
A1
11,34
A3
10,32
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 18. julij 2024; A3 za obdobje 2018-2022
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  258  11.191  10.270  39,81 
Scopus  278  12.368  11.345  40,81 
Raziskovalci (18)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  50563  dr. Katarina Bačnik  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  134 
2.  56612  Jakob Brodarič    Tehnični sodelavec  2022 - 2024  63 
3.  23399  dr. Tomaž Curk  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2021 - 2024  254 
4.  56610  Maja Ferle    Tehnični sodelavec  2023 - 2024  22 
5.  27827  dr. Jon Gutierrez Aguirre  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  365 
6.  35424  dr. Tomaž Hočevar  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2021 - 2022  30 
7.  39610  mag. Tina Klepac  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024 
8.  52584  Zala Kogej Zwitter  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2021 - 2024  108 
9.  35384  dr. Denis Kutnjak  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  295 
10.  55123  Živa Lengar    Tehnični sodelavec  2021 - 2024  29 
11.  23610  dr. Nataša Mehle  Biotehnologija  Vodja  2021 - 2024  556 
12.  52096  Amra Omanović  Računalništvo in informatika  Mladi raziskovalec  2021 - 2022 
13.  57702  Neža Pajek Arambašič  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2023 - 2024 
14.  38081  dr. Anja Pecman  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  101 
15.  19626  Rok Štravs  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  18 
16.  30142  dr. Marko Toplak  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2021 - 2022  27 
17.  35216  mag. Martina Vitanc  Varstvo okolja  Raziskovalec  2021 - 2024 
18.  54287  dr. Ana Vučurović  Rastlinska produkcija in predelava  Raziskovalec  2021 - 2024  230 
Organizacije (3)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.468 
2.  0158  BIA podjetje za laboratorijsko in procesno opremo d.o.o. Ljubljana  Ljubljana  5327601  18 
3.  1539  Univerza v Ljubljani, Fakulteta za računalništvo in informatiko  Ljubljana  1627023  16.696 
Povzetek
V zadnjih desetletjih postajajo rastlinska obolenja, povzročena z novimi virusi, vedno pomembnejša tako z vidika njihove pojavnosti kot ekonomskega vpliva. Trenutno je gospodarsko najpomembnejši virus rjave grbančavosti plodov paradižnika oziroma ToBRFV, ki je bil prvič zaznan okoli leta 2014 v Izraelu. Od takrat se izbruhi virusa pojavljajo po vsem svetu, pred kratkim tudi v nekaj državah Evrope, in ogrožajo pridelavo paradižnika in paprike, glavnih gostiteljev virusa ToBRFV. Omenjeni poljščini pa okužujejo tudi drugi tobamovirusi – primer je virus blage lisavosti paradižnika ali ToMMV, ki se je prvič pojavil leta 2013 v Mehiki in se razširil v Severno in Južno Ameriko, Azijo ter Evropo. Sposobnost naglega razširjanja tobamovirusov in njihovega visokega potenciala za povzročitev epidemije izhajata iz njihovih fizikalnih in bioloških lastnosti. Za zmanjšanje tveganja na področju kmetijstva, ki ga ti virusi predstavljajo, sta ključna pridobivanje zadostnega znanja o njihovem izvoru ter razvoj učinkovitih testov za njihovo zaznavanje. V sklopu predlaganega projekta bi člani raziskovalne skupine preko (meta)analize že obstoječih serij podatkov o virusnih zaporedjih iskali možne nepoznane vrste tobamovirusov v različnih rastlinskih gostiteljih in medijih. Pridobljeno znanje bi tako omogočilo globlje razumevanje pojava gospodarsko pomembnih tobamovirusov ter razvoj načinov za preprečevanje in zajezitev njihovega razširjanja. Najpomembnejši način vnosa tobamovirusov v nove države ali regije je preko okuženega semenskega in sadilnega materiala. Ko je virus vnesen v novo okolje, se zaradi visoke stabilnosti preko različnih mehanskih načinov hitro prenese na druge rastline. Študije poročajo, da je virus ToBRFV sposoben dolgotrajnega preživetja na različnih površinah in pod različnimi okoljskimi pogoji, zaradi česar ga je z uporabo že razvitih dezinfekcijskih tehnik izredno težko odstraniti iz pridelovalne verige oziroma sistema. Njegova RNA je bila zaznana tudi v nekaterih vzorcih vode, vendar pa mehanizem virusnega prenosa preko vodnih medijev, predvsem namakalne vode, še ni v celoti razumljiv in bo predmet raziskave predlaganega projekta. S pridobljenimi informacijami bo bolje razumljiva sicer kompleksna epidemiologija virusa ToBRFV, obenem pa bo to omogočilo izvedbo analize tveganja, s katero bomo definirali kritične točke za zajezitev virusa in nadzor nad njim. Podobne raziskave bodo izvedene tudi za virus ToMMV in druge gospodarsko nevarne tobamoviruse. Poleg poglobljenega znanja o mehanizmu in kinetiki razširjanja tobamovirusov so za njihovo obvladovanje pomembne zanesljive in hitre metode njihovega zaznavanja. Trenutno obstajajo številni molekularni testi za identifikacijo virusa ToBRFV v rastlinskem in semenskem materialu, vendar ti še niso validirani za namene nadzorovanja pojavnosti virusa v namakalnih vodah. Potreba po razvoju primernih metod za spremljanje se pojavlja tudi pri drugih tobamovirusih, predvsem pri ToMMV. Znaten delež vsebine predlaganega projekta se nanaša na razvoj zanesljivih diagnostičnih postopkov, tako laboratorijskih kot terenskih, za nadzor nad novimi in že poznanimi tobamovirusi v namakalnih vodah. Izkušena in visoko usposobljena skupina raziskovalcev bo s svojim delom zagotovila uspešno izvedbo študij, vezanih na razumevanje prenosa tobamovirusov preko vodnih medijev in njihovih epidemioloških značilnosti ter postopkov zaznavanja in spremljanja pojavnosti novih in že identificiranih vrst tobamovirusov. Rezultati projekta bodo zagotovili boljše možnosti za zaščito rastlin pred patogenimi virusi, kar zaradi podnebnih sprememb, pojava nepoznanih virusov in obsežnega premikanja rastlin ter njihovih produktov preko globalnega trgovanja postaja vedno pomembnejše.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno