Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARRS

Molekularni mehanizmi odgovorni za zmanjšano rast ribjih celic zaradi izpostavljenosti kemikalijam

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   

Koda Veda Področje
2.08  Tehniške in tehnološke vede  Okoljska biotehnologija 
Ključne besede
ekotoksikologija, kemični stres, ribje celične linije, translacija, rast
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
4.424,37
A''
1.407,83
A'
3.059,18
A1/2
3.438,89
CI10
4.526
CImax
210
h10
34
A1
17,09
A3
10,75
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 25. marec 2023; A3 za obdobje 2017-2021
Podatki za razpise ARRS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  225  5.505  4.509  20,04 
Scopus  252  6.406  5.261  20,88 
Raziskovalci (12)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacij
1.  19116  dr. Špela Baebler  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  292 
2.  54569  dr. Carissa Robyn Bleker  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023 
3.  12688  dr. Kristina Gruden  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  931 
4.  51987  Mojca Juteršek  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2021 - 2023  36 
5.  37409  dr. Maja Križnik  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  36 
6.  29617  dr. Marko Petek  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  145 
7.  34502  dr. Živa Ramšak  Biologija  Raziskovalec  2021 - 2023  106 
8.  50566  dr. Špela Tomaž  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2023  22 
9.  36377  dr. Miha Tome  Biotehnologija  Raziskovalec  2022 - 2023  27 
10.  39320  dr. Maja Zagorščak  Interdisciplinarne raziskave  Raziskovalec  2021 - 2023  45 
11.  32446  dr. Jan Zrimec  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2022 - 2023  88 
12.  27522  dr. Anže Županič  Sistemi in kibernetika  Vodja  2021 - 2023  162 
Organizacije (1)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacij
1.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.214 
Povzetek
Ribe so fascinantna in pomembna skupina organizmov, ki naseljuje najrazličnejše habitate, hkrati pa ponujajo številne ekosistemske storitve. Hkrati so ribe občutljive na različne stresorje, vključno s kemičnim onesnaževanjem. Iz teh razlogov imajo ključno vlogo pri oceni kemičnega tveganja za okolje, pri čemer se v laboratorijskih poskusih njihovo preživetje in rast po izpostavitvi kemikalijam meri kot dokaz za zdravje populacije rib. A takšni laboratorijski poskusi na živalih so etično problematični in zelo zahtevni. Partnerji v projektu smo v zadnjih letih za vrsto kemikalij pokazali, da lahko en teden dolg in vitro test, ki temelji na merjenju rasti populacije ribjih celic, napove upočasnitev rasti živih rib po mesečni izpostavljenosti istim kemikalijam. Vendar pa ti rezultati na zelo različnih kemikalijah postavljajo vprašanje: kako lahko kemikalije z zelo različnimi strukturami in domnevno različnimi mehanizmi biološkega delovanja vodijo do enakega splošnega rezultata - zmanjšana populacija celic, ergo zmanjšana rast rib? Če bi lahko odgovorili na to vprašanje, bi prvič omogočili prepoznavanje različnih poti zmanjšane rasti populacije ribjih celic, s čimer bi se izboljšalo znanje o fiziologiji in toksikologiji rib. Poleg tega bi se olajšal prehod z in vivo na in vitro testiranje na podlagi preglednih razmerij med kemijsko strukturo in biološkim mehanizmom ter podrobnim znanjem o širini in mejah uporabe in vitro testa. V tem projektu bomo na to vprašanje odgovorili s sistemsko-toksikološkim pristopom, z uporabo inovativne kombinacije eksperimentalnih in računskih metod: eksperimenti s kemično izpostavljenostjo celic, morfološko in funkcionalno profiliranje celic, transkriptomika in translatomika, bioinformatska analiza in mrežni pristopi, in končno potrditev in vitro rezultatov v in vivo sistemu. Multipleksni fluorescenčni testi, tj. "Slikanje celic", in meritve celične sestave nam bodo dali kemično specifične celične fenotipske profile. Omične meritve bodo zagotovile kemijsko specifične molekularne profile. Sledila bo statistična analiza profilov, tako ločeno kot v kombinaciji, in s tem identifikacija molekularnih in fenotipskih biomarkerjev zmanjšane rasti rib. Pridobljeni nabor podatkov bo vključen tudi v novo razvito na znanju temelječo vzročno biološko mrežo, ki bo vsebovala znane molekularne poti, ki nadzorujejo celično proliferacijo in celično smrt, kar sta dva osnovna vzroka za zmanjšalo celično populacijo. Ta integracija nam bo omogočila kvantitativno napoved kemijskih učinkov in molekularnih mehanizmov, ki stojijo za njimi, zgolj na podlagi molekularnih podatkov. Na koncu bodo identificirani biomarkerji testirani in vivo na cebricah, da se potrdi, da so mehanizmi, na katerih temeljijo zmanjšana rast celične populacije in vitro, aktivni tudi pri živi živali. Na ta način naš projekt ne bo le omogočil vpogled v molekularne mehanizme, na katerih temelji zmanjšana rast rib, temveč tudi povečal zaupanje v in vitro teste na splošno kot nadomestilo za teste na živalih.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno