Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Hierarhično sestavljanje DNA za napredno uporabo v proizvodnji biofarmacevtikov in celični terapiji

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   

Koda Veda Področje
2.09  Tehniške in tehnološke vede  Industrijska biotehnologija 
Ključne besede
sestavljanje DNA, celična terapija, biološka zdravila
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Upoš. tč.
2.380,93
A''
330,59
A'
981,72
A1/2
1.312,63
CI10
4.953
CImax
220
h10
35
A1
8,08
A3
0,86
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 14. julij 2024; A3 za obdobje 2018-2022
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  277  7.963  6.566  23,7 
Scopus  281  8.600  7.150  25,44 
Raziskovalci (15)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  57013  Katja Doberšek  Biotehnologija  Raziskovalec  2022 - 2024 
2.  06416  dr. Marko Dolinar  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2021 - 2024  344 
3.  29152  dr. Barbara Hubad  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  48 
4.  07673  dr. Dušan Kordiš  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  215 
5.  35319  dr. Mojca Ogrizović  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021  36 
6.  20213  dr. Toni Petan  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  179 
7.  20653  dr. Uroš Petrovič  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  294 
8.  32113  dr. Jelka Pohar  Biotehnologija  Raziskovalec  2022 - 2024  101 
9.  04570  dr. Jože Pungerčar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  320 
10.  33201  dr. Anže Smole  Biotehnologija  Raziskovalec  2021 - 2024  80 
11.  29886  dr. Franc Smrekar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  56 
12.  21553  dr. Jernej Šribar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2021 - 2024  110 
13.  51958  dr. Petra Tavčar Verdev  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2022 - 2024  30 
14.  56000  Mia Žganjar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2022 - 2024  13 
15.  54712  Gašper Žun  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2021 - 2024  24 
Organizacije (4)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0103  Univerza v Ljubljani, Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo  Ljubljana  1626990  23.426 
2.  0105  Nacionalni inštitut za biologijo  Ljubljana  5055784  13.454 
3.  0106  Institut "Jožef Stefan"  Ljubljana  5051606000  91.855 
4.  3141  JAFRAL, biotehnološke raziskave in razvoj, d.o.o.  Ljubljana  3891518  135 
Povzetek
Ta predlog projekta je skupna iniciativa industrijskega partnerja (Lek) in treh akademskih partnerjev (IJS, NIB in FKKT). Projektna skupina predlaga razvoj hierarhičnih metod sestavljanja molekul DNA za uporabo v naprednih aplikacijah v proizvodnji bioloških zdravil in celični terapiji. Lek je vodilno slovensko farmacevtsko podjetje, ki proizvaja biološka zdravila, sodelujoča skupina iz NIB-a pa se ukvarja z razvojem naprednih celičnih terapij za zdravljenje rakavih in avtoimunskih bolezni. Obe raziskovalni organizaciji se v svojih raziskovalnih projektih soočata s podobnim problemom, to je priprava kompleksnih molekul DNA, ki vsebujejo zapise za več različnih proteinov. Kljub temu, da je cena sinteze DNA v zadnjem desetletju precej padla, pa trenutno na trgu ni mogoče naročiti storitve priprave kompleksnih DNA-molekul iz krajših sintetiziranih kosov. Raziskovalni laboratoriji so zato odvisni od svojih lastnih znanj o pripravi kompleksnih DNA, ki so potrebne za vnos v žive celice. Pomanjkanje znanj in izkušenj pogosto pomeni, da je priprava DNA draga in časovno zamudna. Zato sta se Lek in NIB v lokalnem okolju povezala z dvema ključnima akademskima inštitucijama (FKKT in IJS), ki imata obe precej znanja s področja priprave kompleksnih DNA-molekul. V postopku proizvodnje bioloških zdravil je potrebno testiranje učinka različnih kodirajočih zaporedij, promotorjev in molekul shRNA, ki bi lahko vplivale na produktivnost proizvodnih celičnih linij. Tudi pri celičnih terapijah je potrebno testirati vpliv številnih variant imunskih receptorjev in dodatnih bioloških molekul z namenom povečanja učinkovitosti in varnosti terapevtskih celic. Zato je naš glavni cilj razviti hierarhično platformo za sestavljanje DNA z namenom hitrejšega razvoja naprednih aplikacij v proizvodnji biofarmacevtikov in celičnih terapij. To bomo dosegli s tremi cilji: (1) razvoj platforme za sestavljanje DNA, (2) validacija in izboljšave že ustvarjenih konstruktov v sesalskih celicah in (3) prikaz uporabnosti platforme z dvema različnima biomedicinskima implementacijama. Načrtovanje imunskih receptorjev se pojavlja kot eden ključnih dejavnikov pri razvoju učinkovitih celičnih izdelkov za imunoterapijo raka in avtoimunskih bolezni. Hierarhično platformo za sestavljanje DNA bomo najprej uporabili za sestavljanje kompleksnih genskih konstruktov, ki bodo vsebovali imunski receptor, pomožni protein in selekcijski marker. Nato bomo s pomočjo platforme, ki omogoča vstavljanje zaporedij shRNA, utišali izražanje T-celičnih receptorjev (TCR). S tem bomo pokazali, da predlagano platformo za hierarhično kloniranje lahko uporabimo za (1) dizajniranje in sestavljanje naprednih genskih konstruktov za celično terapijo in (2) za edinstveno rešitev enega od velikih izzivov pri načrtovanih terapijah s T-celicami, to je znižanje endogenega izražanja površine TCR. In vitro metode za sestavljanje DNA so temelj genskega inženirstva in so večinoma dobro razvite. Kljub temu priprava dolgih molekul DNA in priprava kombinatoričnih knjižnic DNA ostajata velik izziv. V tem projektu nameravamo povezati uporabo in vitro in in vivo metod, ki temeljijo na potencialu homologne rekombinacije v celicah kvasovk Saccharomyces cerevisiae. Takemu pristopu pravimo hierarhično sestavljanje DNA. Pristop sicer ni popolnoma nov, vendar pa potencial tega pristopa po našem mnenju še ni bil dodobra izkoriščen. Glede na naše pretekle izkušnje smo prepričani, da je hierarhično sestavljanje DNA pravilen pristop k reševanju izziva, s katerim se soočata Lek in NIB. Cilj tega projekta je tudi razvoj tehnologije za hierarhično sestavljanje DNA, ki bi jo bilo mogoče patentirati. Predlagatelji smo predvideli komercializacijo tehnologije preko spin-out podjetja, ki bo Leku in drugim strankam na trgu zagotavljalo storitev priprave kompleksnih molekul DNA.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno