Projekti / Programi
Hierarhično sestavljanje DNA za napredno uporabo v proizvodnji biofarmacevtikov in celični terapiji
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
2.09 |
Tehniške in tehnološke vede |
Industrijska biotehnologija |
sestavljanje DNA, celična terapija, biološka zdravila
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan
25. april 2024;
A3 za obdobje
2018-2022
Podatki za razpise ARIS (
04.04.2019 - Programski razpis,
arhiv
)
Baza |
Povezani zapisi |
Citati |
Čisti citati |
Povprečje čistih citatov |
WoS |
277 |
7.963 |
6.566 |
23,7 |
Scopus |
281 |
8.600 |
7.150 |
25,44 |
Raziskovalci (15)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
57013 |
Katja Doberšek |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2022 - 2024 |
8 |
2. |
06416 |
dr. Marko Dolinar |
Biokemija in molekularna biologija |
Vodja |
2021 - 2024 |
341 |
3. |
29152 |
dr. Barbara Hubad |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
47 |
4. |
07673 |
dr. Dušan Kordiš |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
215 |
5. |
35319 |
dr. Mojca Ogrizović |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 |
35 |
6. |
20213 |
dr. Toni Petan |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
177 |
7. |
20653 |
dr. Uroš Petrovič |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
292 |
8. |
32113 |
dr. Jelka Pohar |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2022 - 2024 |
97 |
9. |
04570 |
dr. Jože Pungerčar |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
320 |
10. |
33201 |
dr. Anže Smole |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
74 |
11. |
29886 |
dr. Franc Smrekar |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
54 |
12. |
21553 |
dr. Jernej Šribar |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2021 - 2024 |
108 |
13. |
51958 |
dr. Petra Tavčar Verdev |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2022 - 2024 |
30 |
14. |
56000 |
Mia Žganjar |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2022 - 2024 |
11 |
15. |
54712 |
Gašper Žun |
Biokemija in molekularna biologija |
Mladi raziskovalec |
2021 - 2024 |
24 |
Organizacije (4)
Povzetek
Ta predlog projekta je skupna iniciativa industrijskega partnerja (Lek) in treh akademskih partnerjev (IJS, NIB in FKKT). Projektna skupina predlaga razvoj hierarhičnih metod sestavljanja molekul DNA za uporabo v naprednih aplikacijah v proizvodnji bioloških zdravil in celični terapiji. Lek je vodilno slovensko farmacevtsko podjetje, ki proizvaja biološka zdravila, sodelujoča skupina iz NIB-a pa se ukvarja z razvojem naprednih celičnih terapij za zdravljenje rakavih in avtoimunskih bolezni. Obe raziskovalni organizaciji se v svojih raziskovalnih projektih soočata s podobnim problemom, to je priprava kompleksnih molekul DNA, ki vsebujejo zapise za več različnih proteinov. Kljub temu, da je cena sinteze DNA v zadnjem desetletju precej padla, pa trenutno na trgu ni mogoče naročiti storitve priprave kompleksnih DNA-molekul iz krajših sintetiziranih kosov. Raziskovalni laboratoriji so zato odvisni od svojih lastnih znanj o pripravi kompleksnih DNA, ki so potrebne za vnos v žive celice. Pomanjkanje znanj in izkušenj pogosto pomeni, da je priprava DNA draga in časovno zamudna. Zato sta se Lek in NIB v lokalnem okolju povezala z dvema ključnima akademskima inštitucijama (FKKT in IJS), ki imata obe precej znanja s področja priprave kompleksnih DNA-molekul. V postopku proizvodnje bioloških zdravil je potrebno testiranje učinka različnih kodirajočih zaporedij, promotorjev in molekul shRNA, ki bi lahko vplivale na produktivnost proizvodnih celičnih linij. Tudi pri celičnih terapijah je potrebno testirati vpliv številnih variant imunskih receptorjev in dodatnih bioloških molekul z namenom povečanja učinkovitosti in varnosti terapevtskih celic. Zato je naš glavni cilj razviti hierarhično platformo za sestavljanje DNA z namenom hitrejšega razvoja naprednih aplikacij v proizvodnji biofarmacevtikov in celičnih terapij. To bomo dosegli s tremi cilji: (1) razvoj platforme za sestavljanje DNA, (2) validacija in izboljšave že ustvarjenih konstruktov v sesalskih celicah in (3) prikaz uporabnosti platforme z dvema različnima biomedicinskima implementacijama. Načrtovanje imunskih receptorjev se pojavlja kot eden ključnih dejavnikov pri razvoju učinkovitih celičnih izdelkov za imunoterapijo raka in avtoimunskih bolezni. Hierarhično platformo za sestavljanje DNA bomo najprej uporabili za sestavljanje kompleksnih genskih konstruktov, ki bodo vsebovali imunski receptor, pomožni protein in selekcijski marker. Nato bomo s pomočjo platforme, ki omogoča vstavljanje zaporedij shRNA, utišali izražanje T-celičnih receptorjev (TCR). S tem bomo pokazali, da predlagano platformo za hierarhično kloniranje lahko uporabimo za (1) dizajniranje in sestavljanje naprednih genskih konstruktov za celično terapijo in (2) za edinstveno rešitev enega od velikih izzivov pri načrtovanih terapijah s T-celicami, to je znižanje endogenega izražanja površine TCR. In vitro metode za sestavljanje DNA so temelj genskega inženirstva in so večinoma dobro razvite. Kljub temu priprava dolgih molekul DNA in priprava kombinatoričnih knjižnic DNA ostajata velik izziv. V tem projektu nameravamo povezati uporabo in vitro in in vivo metod, ki temeljijo na potencialu homologne rekombinacije v celicah kvasovk Saccharomyces cerevisiae. Takemu pristopu pravimo hierarhično sestavljanje DNA. Pristop sicer ni popolnoma nov, vendar pa potencial tega pristopa po našem mnenju še ni bil dodobra izkoriščen. Glede na naše pretekle izkušnje smo prepričani, da je hierarhično sestavljanje DNA pravilen pristop k reševanju izziva, s katerim se soočata Lek in NIB. Cilj tega projekta je tudi razvoj tehnologije za hierarhično sestavljanje DNA, ki bi jo bilo mogoče patentirati. Predlagatelji smo predvideli komercializacijo tehnologije preko spin-out podjetja, ki bo Leku in drugim strankam na trgu zagotavljalo storitev priprave kompleksnih molekul DNA.