Projekti / Programi
Molekularno-biološke raziskave mikroorganizmov
01. januar 1999
- 31. december 2003
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
1.05.00 |
Naravoslovje |
Biokemija in molekularna biologija |
|
3.01.00 |
Medicina |
Mikrobiologija in imunologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
B220 |
Biomedicinske vede |
Genetika, citogenetika |
B230 |
Biomedicinske vede |
Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija |
P320 |
Naravoslovno-matematične vede |
Nukleinske kisline, sinteza beljakovin |
P340 |
Naravoslovno-matematične vede |
Lipidi, steroidi, membrane |
Bakterije, horizontalni prenos, rezistenca, virulenca, genetski mehanizmi, antibiotiki, membrana, transport, toksini, plazmidi, biosinteza, transformacija, konjugacija, evolucija
Raziskovalci (15)
Organizacije (1)
Povzetek
Vertikalen prenos genetskega materiala je ustaljen prenos in poteka od materinskih k hčerinskim celicam. Horizontalni prenosi genetskega materiala se odvijajo med sorodstveno neodvisnimi organizmi iste ali druge vrste. Odvijajo se med prokarionti in, kakor kažejo novejše raziskave, tudi med evkarionti. Prenos DNA med organizmi v veliki meri vpliva na evolucijo genomov. Prenosi so zaradi širjenja determinant rezistence in virulence ter nastajanja novih patogenov pomembni pri zdravljenju bakterijskih, rakastih ter virusnih obolenj. Namen raziskovalnega programa je raziskati determinante, ki sodelujejo pri rezistenci in virulenci, s poudarkom na njihovi horizontalni mobilnosti. Mikroorganizmi, ki bodo vključeni v raziskave so Escherichia coli, Clostridium difficile in Bacillus licheniformis, ki so bodisi pomembne patogene bakterije ali pa rezervoar genov za rezistenco proti antibiotikom.Proučevali bomo plazmide pRK100, faktor F in pColV-K30 vrste Escherichia coli. Faktor F nima determinant virulence niti rezistence proti antibiotikom medtem ko sorodna plazmida pRK100 in pColV-K30 imata zapis za sistem prevzema železa, sintezo kolicinov in pRK100 še rezistenci proti tetraciklinu in ampicilinu. V skupino IncFI pa sodijo še nekateri drugi plazmidi s pomembnimi dejavniki virulence, ki v veliki meri prispevajo k patogenosti sevov vrste E. coli. Vsi omenjeni plazmidi so konjugativni in zato pomemben dejavnik v bakterijski virulenci in razvoju novih patogenov.Bakterija Clostridium difficile je pomemben povzročitelj bolnišničnih infekcij. Dejavnika virulence sta dva proteinska toksina, toksin A in toksin B. Glede na razlike v toksinskih genih lahko seve razdelimo v dvanajst skupin, toksinotipov. Raznolikost determinant povezanih z virulenco je pri bakterijah dobro znana, npr. pri beljakovinah, ki tvorijo fimbrije ali pri antigenih, ki jih prepoznava gostiteljev imunski sistem. Variabilnost teh molekul je pomembna za preživetje bakterij v gostitelju. Manj je znanega o raznolikosti toksinskih determinant pri bakterijah. Toksinotipi bakterije C. difficile so eden redkih opisanih primerov variabilnosti genov, ki kodirajo toksine. V okviru raziskovalnega programa želimo preučevati toksinotipe bakterije C.difficile, ugotoviti, kakšna je njihova evolucijska povezanost in ali je pri nastanku posameznih toksinotipov vključen tudi prenos toksinskih genov na mobilnih genetskih elementih.Transporter bacitracina (Bcr) iz bakterije Bacillus licheniformis omogoča široki paleti bakterij rezistenco proti peptidnemu antibiotiku bacitracinu. Za tovrstne transporterje je značilna modularnost njihove zgradbe - deli so zamenljivi in učinkoviti ob prenosih med najrazličnejšimi organizmi. Ti proteini so bodisi specifični za določeno snov (npr. antibiotik) ali pa nespecifični, tim.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
Zaključno poročilo