Projekti / Programi
Optimizacija inhibitorjev giraze
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
T490 |
Tehnološke vede |
Biotehnologija |
B740 |
Biomedicinske vede |
Farmakološke vede, farmakognozija, farmacija, toksikologija |
B510 |
Biomedicinske vede |
Infekcije |
B120 |
Biomedicinske vede |
Molekularna biofizika |
B110 |
Biomedicinske vede |
Bioinformatika, medicinska informatika, biomatematika, biometrija |
antimikrobne učinkovine, rekombinantni proteini, molekularno modeliranje, DNA giraze, NMR spektroskopija, mikrobna biotehnologija
Raziskovalci (7)
Organizacije (2)
Povzetek
Rastoča odpornost bakterij na konvencionalne antibiotike zahteva razvoj novih tipov antimikrobnih učinkovin. Poznavanje prostorske strukture bakterijskih proteinov - potencialnih tarč ter knjižnice organskih spojin danes omogočjo ciljano načrtovanje zdravilnih učinkovin. V okviru projekta bomo pripravili nove učinkovine, ki bodo specifično inhibirale bakterijske giraze. Nove učinkovine bomo zasnovali na podlagi molekularnega modeliranja in predvsem razultatov presejalnih testov večjega števila komercialno dostopnih organskih spojin s pomočjo NMR meritev ("SAR z NMR") v prisotnosti izotopsko označenega rekombinantnega fragmenta giraze, kjer bomo identificirali spojine z nizko afiniteto do aktivnega centra in z njihovim kombiniranjem v nove spojine sintetizirali učinkovine z visoko aktivnostjo. Za analizo NMR eksperimentov bomo uporabili v predhodnem projektu pripravljeno asignacijo 24kDa fragmenta giraze B, inhibicijo giraz pa bomo analizirali tudi z drugimi spektroskopskimi in biokemijskimi metodami. Za namen testiranja specifičnosti učinkovin bomo v kvasovkah izrazili in izolirali rekombinantno človeško topoizomerazo II. S pomočjo molekularnega modeliranja vezave spojin na aktivni center giraze ter modela odgovarjajoče domene človeške topoizomeraze II in organske sinteze bomo pripravili nove, bolj selektivne spojine, katerih delovanje bomo testirali tako in vitro na proteinih kakor tudi in vivo na mikroorganizmih.