Projekti / Programi
Uporaba visoko zmogljivih tehnologij za analizo genskega izražanja v interakcijah rastlina-patogen in rastlina-herbivor
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| T490 |
Tehnološke vede |
Biotehnologija |
krompir, koloradski hrošč, virusni patogeni, rasltlinski obrambni mehanizem, izražanje genov, biološka zaščita, genski čipi
Raziskovalci (8)
Organizacije (2)
Povzetek
Rastlinski patogeni in škodljivci povzročajo občutno gospodarsko škodo zaradi zmanjšanja donosa pridelka. Škoda povzročena samo z žuželkami, na primer, je ocenjena na 100 miljard ameriških dolarjev letno, navkljub intenzivni rabi insekticidov. Razumevanje odnosov rastlina-patogen in rastlina-škodljivec je možen pristop za reševanje tega problema. Do sedaj je bilo možno interakcije slediti le na nivoju enega ali nekaj genov hkrati. Analiza genskega izražanja s pomočjo genskih čipov pa omogoča spremljanje več kot tisoč genov hkrati. Na ta način lažje sprevidimo kompleksne fiziološke procese in s tem bolj usmerjeno iščemo potencialne tarče za zaščito rastlin. Analizirali bomo odgovor krompirja na okužbo z virusom PVYNTN. Primerjali bomo reakcije nekaj sort, ki so različno dovzetne za virus. Pripravili bomo knjižnico diferencialno izraženih genov v okuženih in neokuženih listih občutljive sorte. Izražanje 400 naključno izbranih genov bomo analizirali z genskimi čipi. Sliko izražanja genov bomo določili v lokalno okuženem tkivu, sistemsko okuženemu tkivu in v rastlinah, vzgojenih iz okuženih gomoljev. Hkrati bomo pri ličinkah koloradskega hrošča z enakimi metodami preučevali proces adaptacije na rastlinske obrambne molekule. Sledili bomo časovni potek tega procesa. Poleg tega bomo preučili tudi tritrofične odnose med vsemi tremi omenjenimi organizmi. Izbrane gene iz krompirja in iz koloradskega hrošča bomo izolirali in preizkusili njihov potencial za zaščito rastlin z biotesti. Pridobljeno znanje bomo lahko kasneje enostavno uporabili tudi za analizo drugih agronomsko ali industrijsko pomembnih organizmov in s tem pridobili nova, učinkovita in naravnovarsveno usmerjena orodja za varovanje rastlin.
