Projekti / Programi
Strukturni pristop k nevtralizaciji endotoksina s peptidi
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 1.09.00 |
Naravoslovje |
Farmacija |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| B470 |
Biomedicinske vede |
Fiziologija |
LPS; imunski odziv, peptidni inhibitorji; molekularno prepoznavanje; racionalno načrtovanje zdravil, l
Raziskovalci (8)
Organizacije (1)
| št. |
Evidenčna št. |
Razisk. organizacija |
Kraj |
Matična številka |
Štev. publikacij |
| 1. |
0104 |
Kemijski inštitut |
Ljubljana |
5051592000 |
20.824 |
Povzetek
Bakterijski lipopolisaharid (LPS) v telesu sproža vrsto obrambnih reakcij, ki lahko vodijo v septični šok, ki je poglavitni vzrok smrti na oddelkih za intenzivno nego in po ocenah v Evropski uniji terja vsako leto okrog 150,000 življenj. Ena pomembnih strategij preprečevanja sepse je usmerjena v nevtralizacijo LPS s specifično vezavo na peptide, ki izhajajo iz naravnih obrambnih proteinov ali peptidov. Kot nadaljevanje naših dosedanjih raziskav, kjer smo določili strukturo vrste peptidov vezanih na LPS, bomo dodatno preučevali strukturne vidike interakcije inhibitornih peptidov z LPS. Peptidne strukture v kompleksu z LPS/lipidom A bomo določali s tehnikami jedrske magnetne resonance (NMR), strukture kompleksov pa z računalniškim modeliranjem. Izpopolnili bomo farmakoforo - motiv vezave peptidov in proteinov na LPS, ki smo ga z dodatkom upoštevanja hidrofobnih interakcij že razširili v predhodnih raziskavah. Delo bo potekalo v ponovljenih ciklih načrtovanja novih, spremenjenih peptidov, njihove sinteze, strukturne analize ter merjenja lastnosti peptidov, kot je vezava na LPS (Kd), nevtralizacija aktivacije celic z LPS in spremljanje morebitnega toksičnega delovanja peptidov na človeške celice. Vso opremo in znanje za izvedbo tako kompleksne naloge imamo na razpolago v raziskovalni skupini. Pričakujemo, da bomo s projektom vzpostavili osnove za racionalno načrtovanje novih peptidnih inhibitorjev delovanja LPS.
