Projekti / Programi
Podrobnejše raziskave novo odkritega virusa na vinski trti
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.03.00 |
Biotehnika |
Rastlinska produkcija in predelava |
|
Koda |
Veda |
Področje |
B006 |
Biomedicinske vede |
Agronomija |
B390 |
Biomedicinske vede |
Fitotehnika, hortikultura, zaščita pridelka, fitopatologija |
RBDV, elektronska mikroskopija, raziskave genoma, vinska trta, sekvenciranje
Raziskovalci (5)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
15489 |
dr. Irena Mavrič Pleško |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2004 - 2007 |
377 |
2. |
08755 |
dr. Mateja Poljšak-Prijatelj |
Mikrobiologija in imunologija |
Raziskovalec |
2004 - 2007 |
234 |
3. |
19143 |
Irena Šest |
|
Tehnični sodelavec |
2004 - 2007 |
10 |
4. |
05672 |
dr. Gregor Urek |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2004 - 2007 |
736 |
5. |
03853 |
dr. Mojca Viršček Marn |
Rastlinska produkcija in predelava |
Vodja |
2004 - 2007 |
419 |
Organizacije (2)
Povzetek
''Raspberry bushy dwarf virus'' (RBDV) je bil leta 2002 najden v Sloveniji na malinah, nekaterih avtohtonih divjih rastlinah iz rodu Rubus in na cepljenkah vinske trte z značilnimi znaki virusne okužbe. To je bila prva najdba naravne okužbe na gostitelju izven rodu Rubus. Virus smo našli na več, v Sloveniji in v svetu pomembnih sortah vinske trte. Ker gre za prvo najdbo virusa na novem gostitelju, je o njem potrebno pridobiti čim več podatkov. V okviru predlagane raziskave nameravamo te podatke dobiti z uporabo transmisijske elektronske mikroskopije (TEM) in metod molekulske biologije. Za razlikovanje med rastlinskimi virusi znotraj rodu in vrste je zelo pomembno poznavanje zaporedja plaščnega proteina (CP). Ker poleg tega na osnovi dosedanjih rezultatov domnevamo, da se razlike med izolatom iz vinske trte in ostalimi izolati verjetno skrivajo tudi v gibalnem proteinu (MP), nameravamo v okviru raziskave ugotoviti najprej celotno zaporedje CP in MP, kasneje pa, v okviru zmožnosti, tudi ostalega dela genoma izolata iz vinske trte. Z uporabo imunske elektronske mikroskopije, predvsem označevanja s protitelesi in predhodne vezave virusov na protitelesa, bomo ugotovili ali je ta metoda primerna za razlikovanje med različki RBDV in uvedli metodo za njihovo detekcijo in identifikacijo. Z uporabo TEM na tkivnih rezinah bomo ugotavljali razlike med rastlinskimi tkivi okuženih in neokuženih rastlin na celičnem nivoju. S protitelesi bomo poskušali označiti viruse v posameznih tkivih in tako prvič na takem nivoju dokazati in lokalizirati RBDV. S tem bi pridobili dodatne podatke o razporeditvi virusa v celicah, in o spremembah, ki se pojavljajo na celičnem nivoju. Pridobljeni podatki bodo osnova za vpeljavo natančnih in izredno občutljivih tehnik za detekcijo RBDV v vinski trti tudi v primeru, ko je koncentracija virusa nizka in za razlikovanje različkov, podatki o razporeditvi virusa predvsem v celicah rastnega vršička pa za izbiro optimalne tehnike eliminacije RBDV iz okuženih trsov.