Projekti / Programi
Razvoj novih inhibitorjev giraz in peptidov kot antimikrobnih učinkovin
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
T490 |
Tehnološke vede |
Biotehnologija |
B230 |
Biomedicinske vede |
Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija |
B510 |
Biomedicinske vede |
Infekcije |
antimikrobne učinkovine, molekularno modeliranje, DNA giraze, peptidi, permeabilizacija, NMR spektroskopija, fluorescenca, mikrobna biotehnologija
Raziskovalci (7)
Organizacije (1)
št. |
Evidenčna št. |
Razisk. organizacija |
Kraj |
Matična številka |
Štev. publikacij |
1. |
0104 |
Kemijski inštitut |
Ljubljana |
5051592000 |
20.824 |
Povzetek
Bakterijske infekcije ponovno postajajo pomemben zdravstveni problem zaradi odpornosti patogenih mikroorganizmov na široko uporabljene antibiotike. Zato je potreben razvoj novih antimikrobnih učinkovin ali izboljšanje načina uporabe obstoječih antibiotikov. Sodobno racionalno načrtovanje aktivnih farmacevtskih učinkovin temelji na poznavanju trodimenzionalne strukture in interakcij med učinkovinami in tarčami v patogenih mikroorganizmih. V projektu nameravamo združiti raziskave dveh tipov antimikrobnih učinkovin, ki lahko skupaj delujejo sinergistično. Na osnovi rezultatov prejšnjega projekta smo identificirali kvercetin kot močan inhibitor bakterijske giraze in ugotovili njegov mehanizem delovanja. V nadaljevanju bomo izmerili inhibitorno delovanje serije spojin naravnega izvora, ki spadajo v flavonoidni in katehinski tip, od katerih so mnoge tradicionalno prisotne v prehrani kot npr. sestavine zelenega čaja. S pomočjo SAR analize bomo identificirali funkcionalne skupine, ki najbolj vplivajo na aktivnost. Kot drugo skupino antimikrobnih učinkovin bomo zasnovali in testirali serijo antimikrobnih peptidov, dolgih 6-18 aminokislin, izhajajoč iz zaporedij človeških obrambnih peptidov in proteinov. Na osnovi poznavanja trodimenzionalne strukture peptidov v kompleksih z lipidi, ki jo bomo določili z NMR in izmerjene biološke aktivnosti bomo izboljšali permeabilizacijo bakterijskih celic s peptidi. Izmerili bomo tudi penetracijo peptidov v notranjost bakterij in vezavo peptidov na druge tarče, ki se nahajajo znotraj bakterij. Poiskali bomo kombinacije inhibitorjev giraz in peptidov, ki imajo najboljše sinergistično delovanje. Antimikrobne peptide bomo pripravili v bakterijah v obliki fuzijskih rekombinantnih proteinov kot bolj ekonomičen biotehnološki način proizvodnje.