Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Razvoj novih inhibitorjev giraz in peptidov kot antimikrobnih učinkovin

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   

Koda Veda Področje
T490  Tehnološke vede  Biotehnologija 
B230  Biomedicinske vede  Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija 
B510  Biomedicinske vede  Infekcije 
Ključne besede
antimikrobne učinkovine, molekularno modeliranje, DNA giraze, peptidi, permeabilizacija, NMR spektroskopija, fluorescenca, mikrobna biotehnologija
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (7)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  14360  dr. Mojca Benčina  Biotehnologija  Raziskovalec  2007  392 
2.  18675  Robert Bremšak    Tehnični sodelavec  2004 - 2007  11 
3.  17915  dr. Helena Gradišar  Biotehnologija  Raziskovalec  2004 - 2007  130 
4.  23940  dr. Boštjan Japelj  Fizika  Mladi raziskovalec  2004 - 2007  38 
5.  06628  dr. Roman Jerala  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2004 - 2007  1.189 
6.  17917  dr. Andreja Majerle  Biotehnologija  Raziskovalec  2004 - 2007  92 
7.  12060  dr. Primož Pristovšek  Kemija  Raziskovalec  2004 - 2007  135 
Organizacije (1)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  20.942 
Povzetek
Bakterijske infekcije ponovno postajajo pomemben zdravstveni problem zaradi odpornosti patogenih mikroorganizmov na široko uporabljene antibiotike. Zato je potreben razvoj novih antimikrobnih učinkovin ali izboljšanje načina uporabe obstoječih antibiotikov. Sodobno racionalno načrtovanje aktivnih farmacevtskih učinkovin temelji na poznavanju trodimenzionalne strukture in interakcij med učinkovinami in tarčami v patogenih mikroorganizmih. V projektu nameravamo združiti raziskave dveh tipov antimikrobnih učinkovin, ki lahko skupaj delujejo sinergistično. Na osnovi rezultatov prejšnjega projekta smo identificirali kvercetin kot močan inhibitor bakterijske giraze in ugotovili njegov mehanizem delovanja. V nadaljevanju bomo izmerili inhibitorno delovanje serije spojin naravnega izvora, ki spadajo v flavonoidni in katehinski tip, od katerih so mnoge tradicionalno prisotne v prehrani kot npr. sestavine zelenega čaja. S pomočjo SAR analize bomo identificirali funkcionalne skupine, ki najbolj vplivajo na aktivnost. Kot drugo skupino antimikrobnih učinkovin bomo zasnovali in testirali serijo antimikrobnih peptidov, dolgih 6-18 aminokislin, izhajajoč iz zaporedij človeških obrambnih peptidov in proteinov. Na osnovi poznavanja trodimenzionalne strukture peptidov v kompleksih z lipidi, ki jo bomo določili z NMR in izmerjene biološke aktivnosti bomo izboljšali permeabilizacijo bakterijskih celic s peptidi. Izmerili bomo tudi penetracijo peptidov v notranjost bakterij in vezavo peptidov na druge tarče, ki se nahajajo znotraj bakterij. Poiskali bomo kombinacije inhibitorjev giraz in peptidov, ki imajo najboljše sinergistično delovanje. Antimikrobne peptide bomo pripravili v bakterijah v obliki fuzijskih rekombinantnih proteinov kot bolj ekonomičen biotehnološki način proizvodnje.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno