Projekti / Programi
Strukturne raziskave inozitol polifosfatnih kinaz
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
P004 |
Naravoslovno-matematične vede |
Biokemija, presnova |
P310 |
Naravoslovno-matematične vede |
Beljakovine, encimologija |
P250 |
Naravoslovno-matematične vede |
Kondenzirane snovi: struktura, termične in mehanske lastnosti, kristalografija, fazno ravnovesje |
T490 |
Tehnološke vede |
Biotehnologija |
inozitol-fosfat, kinaza, kristalna struktura, X-žarkovna kristalografija, fosforilacija, raznolikost encimov, encimska specifičnost
Raziskovalci (5)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
25530 |
dr. Petra Draškovič |
Biokemija in molekularna biologija |
Mladi raziskovalec |
2006 - 2007 |
59 |
2. |
06108 |
dr. Vladimira Gaberc-Porekar |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2004 - 2007 |
220 |
3. |
06135 |
dr. Radovan Komel |
Biokemija in molekularna biologija |
Mentor mlademu raziskovalcu |
2004 - 2007 |
1.054 |
4. |
23123 |
mag. Tatjana Milunović |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2004 - 2007 |
28 |
5. |
12048 |
dr. Marjetka Podobnik |
Biokemija in molekularna biologija |
Vodja |
2004 - 2007 |
316 |
Organizacije (1)
št. |
Evidenčna št. |
Razisk. organizacija |
Kraj |
Matična številka |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
0104 |
Kemijski inštitut |
Ljubljana |
5051592000 |
20.932 |
Povzetek
V živih organizmih obstaja cela paleta inozitolnih fosfatov, ki igrajo pomebno vlogo na različnih področjih celične biologije, kot so fiziologija ionskih kanalov, membranska dinamika in signalizacija v jedru. Za njihovo delovanje je potrebno veliko različnih proteinov, ki bodisi sodelujejo pri presnovi inozitolnih fosfatov ali pa omogočajo njihove intracelularne funkcije. Pred kratkim je bila identeficirana družina inozitol fosfatnih kinaz, katerih člani so ohranjeni vse od kvasovk pa do človeka. Nekatere od teh kinaz imajo zelo visoko substratno specifičnost, na drugi strani pa obstajajo člani te družine z zelo široko substratno specifičnostjo. Kaj je torej strukturna osnova tej kontrastnosti. Tri-dimenzionalne strukture članov družine inozitol fosfatnih kinaz danes še niso znane. Njihova primarna struktura ne kaže nobene podobnosti družinam dobro okarakteriziranih proteinskih kinaz ali pa fosfoinozitidnih kinaz. Namen tu predstavljenega projekta je raziskati raznolikost inozitol fosfatnih kinaz in njihovih substratov s pomočjo X-žarkovne kristalografije kot osnovne tehnike. Kot modelni sistem nam bosta služila inozitol heksakis fosfatna kinaza (InsP6K) in inozitol fosfatna multikinaza (IPMK), sami in v kompleksu s substrati. Pričakujemo, da nam bodo te strukture pomagale razumeti in razložiti kompleksnost presnove inozitolnih fosfatov. Poznavanje strukturne osnove presnove inozitolnih fosfatov pa bo, upamo, prispevalo k razvoju znanja o bioloških funkcijah inozitolnih fosfatov, še posebno inozitolnih pirofosfatov. Z medicinskega stališča je InsP6 izredno zanimiva molekula, zaradi njegove pomebne vloge v prehrani. Prisotna je v velikih količinah v žitaricah, oreških in semenih. Ugotovili so, da ima pozitiven terapevtski učinek; med drugim naj bi preprečeval tudi nastanek ledvičnih kamnov in zaviral razvoj raka črevesja. Spoznanja o procesu njegove presnove bodo uporabna tudi pri načrtovanju prehrane domačih živali.