Projekti / Programi
Razvoj laboratorijske diagnostike bakterije Clostridium difficile pri živalih
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 4.04.00 |
Biotehnika |
Veterina |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| B230 |
Biomedicinske vede |
Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija |
Clostridium difficile, tipizacija, molekularne diagnosticne tehnike, veterinarska mikrobiologija
Raziskovalci (20)
Organizacije (2)
Povzetek
Cilj raziskovalnega projekta je pridobiti novo temeljno znanje o bakteriji Clostridium difficile, ki je že dolgo poznana kot najpogostejši povzročitelj bolnišničnih črevesnih okužb pri človeku. Ker do nedavnega C. difficile ni veljal za pogostega povzročitelja v veterinarski medicini, se diagnostične metode niso uvajale in razvijale, epidemiološke raziskave pa so redke. Z našim raziskovalnim projektom zato želimo predvsem pridobiti novo in razširiti obstoječe znanje o pomembnosti C. difficile pri povzročanju obolenja pri živalih, zlasti pa ugotoviti, ali in v kakšni meri imajo živali vlogo rezervoarja pri prenosu na ljudi. V okviru projekta bomo sekvenirali toksinske gene izoliranih sevov C. difficile in jih primerjali med seboj, kakor tudi s sekvencami pridobljenimi v preliminarnih raziskavah. Poznavanje nukleotidnih zaporedij sevov, izoliranih pri različnih živalskih vrstah, nam bo omogočilo razvoj učinkovitejših metod za detekcijo in tipizacijo. Tako bomo razvili molekularne metode (real time PCR z aparaturama LightCycler in ABIPRISM 7000) za hitrejšo in učinkovitejšo diagnostiko, ki se bodo lahko uporabljale v humani in veterinarski medicini. Poskušali bomo povečati občutljivost nekaj že obstoječih molekularnih metod, ki so sicer že opisane v raziskavah C. difficile v humani medicini, vendar ne zaznajo vseh variantnih oblik.
Z molekularnimi metodami bomo seve tipizirali in primerjali istovetnost bakterijskih populacij pri različnih živalskih gostiteljih in ljudeh, kar bo omogočilo oceno možnosti prenašanja bakterije med različnimi živalskimi vrstami in iz živalskega gostitelja na človeka. Ugotavljali bomo tudi odpornost C. difficile proti antibiotikom, ki je do sedaj za živalske seve slabo dokumentirana, pri ljudeh pa predstavlja velik problem zaradi pojava sevov odpornih proti zdravilu izbire, metronidazolu. Določili bomo pogostost različnih toksinotipov pri živalih in tako razširili temeljno znanje o značilnostih in delovanju variantnih toksinotipov, katerih vloga pri razvoju bolezni še ni znana. Novi podatki o C. difficile in o njegovi prevalenci v živalski populaciji bodo lahko omogočili učinkovite preventivne ukrepov za omejitev širjenja in izbruhov okužb pri živalih ter preprečevanje možnega prenosa na ljudi. Dobili bomo vpogled v ekonomski pomen okužb s C. difficile pri različnih vrstah živali. Projekt bo omogočil tudi vključitev diplomantov in doktorandov v neposredno raziskovalno delo.
