Projekti / Programi
Identifikacija proteinov v prevodnem tkivu hmelja po okužbi s patogeno glivo Verticillium albo-atrum
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.03.00 |
Biotehnika |
Rastlinska produkcija in predelava |
|
Koda |
Veda |
Področje |
B390 |
Biomedicinske vede |
Fitotehnika, hortikultura, zaščita pridelka, fitopatologija |
hmelj, hmeljeva uvelost, rezistenčni geni, žlahtnjenje, proteomika, genomika
Raziskovalci (3)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacij |
1. |
18828 |
dr. Andreja Čerenak |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2005 - 2008 |
403 |
2. |
05994 |
dr. Branka Javornik |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2005 - 2007 |
1.282 |
3. |
20162 |
dr. Sebastjan Radišek |
Rastlinska produkcija in predelava |
Vodja |
2005 - 2008 |
578 |
Organizacije (1)
Povzetek
Hmeljeva uvelost, ki jo povzroča Verticillium albo-atrum Reinke & Berthold ali V. dahliae Klebahn, je ena najpomembnejših bolezni hmelja in lahko resno ogrozi pridelavo hmelja, če hmeljišča niso zasajena z odpornimi sortami. Leta 1997 je bil registriran izbruh letalne oblike hmeljeve uvelosti v slovenskem pridelovalnem območju in v naslednjih šestih letih so opazili nove izbruhe letalne oblike, ki so omejili pridelavo hmelja na okuženih območjih. Da bi ohranili pridelavo hmelja, smo začeli z intenzivnim žlahtniteljskim programom za razvoj odpornih sort primernih za slovenske rastne razmere s pomočjo selekcije z markerji. V predlagani raziskavi nameravamo razviti genske markerje za odpornost na hmeljevo uvelost z uporabo proteomike. Poskusili bomo identificirati znane in nove proteine, ki se tvorijo v različnih genotipih hmelja po okužbi s patotipi Verticillium albo-atrum. Pričakujemo, da bomo identificirali in karakterizirali obrambne proteine specifične za odziv hmelja na V. albo-atrum z 2-D SDS PAGE elektroforezo in masno spektrometrijo. S pomočjo bioinformatike bomo poiskali najbolj podobne/sorodne proteine. Kratke peptidne sekvence nam bodo dale dovolj informacij za identifikacijo DNA sekvenc (genov) odgovornih za odziv na patogene. Razvili bomo specifične začetne oligonukleotide za pozitivne sekvence. Dedovanje bo testirano na Wye Target x 2/1 segregacijski družini. Selekcionirali bomo genske markerje povezane z odpornostjo na hmeljevo uvelost za uporabo s selekcijo z markerji.