Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Karakterizacija interakcij ligand-receptor

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
1.04.00  Naravoslovje  Kemija   

Koda Veda Področje
P351  Naravoslovno-matematične vede  Strukturna kemija 
Ključne besede
nekovalentne interakcije, NMR spektroskopija, laserska pinceta, rešetanje, metoda fragmentov
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (11)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  09899  dr. Franc Avbelj  Kemija  Raziskovalec  2008 - 2011  72 
2.  16104  dr. Apolonija Bedina Zavec  Biotehnologija  Raziskovalec  2010 - 2011  154 
3.  29492  dr. Martina Glušič  Kemija  Mladi raziskovalec  2008 - 2011 
4.  08329  dr. Simona Golič Grdadolnik  Kemija  Vodja  2008 - 2011  323 
5.  08523  dr. Jože Grdadolnik  Kemija  Raziskovalec  2008 - 2011  258 
6.  26055  dr. Gorazd Hribar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2010 - 2011  49 
7.  23123  mag. Tatjana Milunović  Biotehnologija  Raziskovalec  2010 - 2011  28 
8.  28554  dr. Mihael Simčič  Farmacija  Mladi raziskovalec  2008 - 2011  26 
9.  21557  dr. Tjaša Urbič  Kemija  Mladi raziskovalec  2008 
10.  30852  Vladimir Vajda  Farmacija  Mladi raziskovalec  2009 
11.  06033  Silva Zagorc    Tehnični sodelavec  2009 - 2011 
Organizacije (1)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  0104  Kemijski inštitut  Ljubljana  5051592000  21.306 
Povzetek
Vpeljali in razvili bomo eksperimentalno metodologijo za raziskave ligand-receptor interakcij. Uporabili bomo metode jedrske magnetne resonance (NMR) visoke ločljivosti in "molecular force" spektroskopije. Poseben poudarek bo na reševanju problemov povezanih z veliko molekulsko maso proteinov in slabo topnostjo ligandov v vodni raztopini. Razvoj eksperimentalne metodologije bo usmerjen v določanje eksperimentalnih parametrov, ki omogočajo prepoznavanje vezave ligandov na proteinske tarče in kvantitativno ovrednotenje nekovalentnih interakcij pri tvorbi kompleksov ligand-receptor. Natančno prepoznavanje vezave ligandov je bistveno za učinkovitost metod rešetanja spojin. Poznavanje narave in energetike nekovalentnih interakcij med funkcionalnimi skupinami liganda in receptorja je izredno pomembno za racionalno načrtovanje novih zdravilnih učinkovin in razvoj teoretičnih algoritmov za raziskave kompleksov učinkovin z receptorji.
Pomen za razvoj znanosti
Rezultati projekta prispevajo k razumevanju interakcij ligand-receptor, ki so nujno navzoče v bioloških procesih in imajo tudi pomembne aplikacije v biotehnologiji. Nizkoenergijska raven bioloških procesov izvira iz nekovalentnih interakcij med molekulami. Narava in energetika teh interakcij je slabo poznana. Natančno ovrednotenje interakcij med ligandi in receptorji prispeva k razvoju algoritmov za napovedovanje tridimenzionalnih struktur biomolekularnih sistemov, kot so kompleksi ligand-receptor in substrat-encim, ki bodo izboljšali obstoječo metodologijo za načrtovanje zdravilnih učinkovin. Načrtovanje novih učinkovin je pogosto neuspešno, ker obstoječi algoritmi uporabljajo model delovanja učinkovin "ključ - ključavnica", ki je za mnoge biomolekularne sisteme preveč poenostavljen. Ta model ob vezavi ligandov na proteinske tarče ne upošteva konformacijskih sprememb receptorja, ki ga lahko povzročajo ligand-receptor interakcije. Natančno poznavanje interakcij ligand-receptor je pomembno za razumevanje funkcije in aktivnosti vrste bioloških sistemov in lahko znatno prispeva k raziskavam na drugih področjih kot so biologija, medicina in farmacija.
Pomen za razvoj Slovenije
Projekt sloni na sodelovanju raziskovalcev iz inštituta, univerze in industrije in je usklajen s prioritetami, ki so definirane v Nacionalnem raziskovalnem in razvojnem programu Republike Slovenije. Novi bolj učinkoviti pristopi za odkrivanje zdravilnih učinkovin lahko pospešijo in pocenijo postopke razvoja učinkovin za zdravljenje človeku nevarnih bolezni in so lahko koristni za slovensko farmacevtsko industrijo. Implementirano metodologijo uporabljamo za izvedbo konkretnih industrijskih projektov. Rezultate raziskav objavljamo v najuglednejših mednarodnih znanstvenih revijah, s čimer Slovenijo promoviramo v svetovnih znanstvenih krogih. Pri raziskavah sodelujejo mladi raziskovalci, ki pridobivajo znanje NMR spektroskopije visoke ločljivosti, molekularnega modeliranja in metodologij za racionalno načrtovanje novih učinkovin. Pridobivajo tudi splošno znanje, ki je potrebno za izpeljavo temeljnih raziskovalnih projektov kot tudi razvojnih projektov v farmacevtski industriji. Vključeni so v sodelovanje z raziskovalci iz univerze in industrije in si odpirajo različne možnosti bodoče zaposlitve.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2008, 2009, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2008, 2009, zaključno poročilo, celotno poročilo na dLib.si
Zgodovina ogledov
Priljubljeno