Projekti / Programi
Transkriptom plodu oljke ? razvoj oznak izraženih zaporedij (EST) oljčnega plodu za študije tkivno specifičnih metabolnih poti
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.03.01 |
Biotehnika |
Rastlinska produkcija in predelava |
Kmetijske rastline |
Koda |
Veda |
Področje |
4.04 |
Kmetijske vede in veterina |
Kmetijska biotehnologija |
Raziskovalci (10)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacij |
1. |
20038 |
dr. Dunja Bandelj |
Biotehnologija |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
269 |
2. |
28496 |
dr. Tjaša Gril |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2009 |
18 |
3. |
30863 |
dr. Matjaž Hladnik |
Biotehnika |
Mladi raziskovalec |
2009 - 2012 |
85 |
4. |
16379 |
dr. Jernej Jakše |
Rastlinska produkcija in predelava |
Vodja |
2009 - 2012 |
644 |
5. |
05994 |
dr. Branka Javornik |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
1.282 |
6. |
09211 |
dr. Boris Kryštufek |
Biologija |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
958 |
7. |
30862 |
dr. Tjaša Marolt |
Kemija |
Mladi raziskovalec |
2009 - 2012 |
10 |
8. |
27613 |
dr. Maja Podgornik |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
184 |
9. |
15577 |
Nevenka Valič |
Rastlinska produkcija in predelava |
Raziskovalec |
2010 - 2012 |
89 |
10. |
17107 |
dr. Irma Vuk |
Biotehnika |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
90 |
Organizacije (2)
Pomen za razvoj znanosti
Oljka je ena najstarejših gojenih sadnih vrst na območju sredozemskega bazena, kjer jo gojijo v glavnem za pridobivanje oljčnega olja. Pomembna je tudi z zgodovinskega, kulturnega in gospodarskega vidika in ima ključno vlogo pri ohranjanju pokrajine na določenih območjih. Globalno gledano je pridelava oljk na omenjenem območju ena najpomembnejših kmetijskih panog in oljčno olje predstavlja pomemben dejavnik v zdravi mediteranski prehrani. Študija razvoja EST zaporedij oljčnega plodu s tehnologijami naslednjih generacij sekvenciranja (NGS), ki smo jo izvedli v okviru projekta je generirala prvo večjo količino nukleotidnih podatkov oljke, ki so dostopna preko NCBI SRA arhiva. Raziskava ima odmev pri raziskovalnih skupinah, ki delajo na raziskavah oljke, saj smo s francosko raziskovalno inštitucijo INRA Montpellier skupaj razvili mikrosatelitne markerje za genotipizacijo in kartiranje olja. Projektni rezultati so omogočili karakterizacijo večjega števila genov za normalizacijo RT-qPCR študij, obenem pa smo tudi dobili vpogled v ekspresijo nekaterih genov vključenih v sintezo maščobnih kislin pri razvijajočem plodu oljke. Rezultati so tako doprinesli k novim spoznanjem o biokemijskih karakteristikah primarnega (sinteza maščobnih kislin) metabolizma oljčnega plodu. Prav tako bodo rezultati imeli doprinos širše k boljšemu bazičnemu znanju ostalih bioloških procesov pri plodu oljke. Sekundarni metabolizem biofenolov je zelo pomemben in zanimiv zaradi njihovega doprinosa k stabilnosti in trajnosti oljčnega olja, učinkovine pa so tudi zanimive s farmacevtskega stališča. Anotacija transkriptov je pokazala, daje 924 le-teh vključenih v procese sekundarnega metabolizma. Dobljeni bazični rezultati pa bodo vplivali na razvoj stroke oziroma znanosti na tem področju.
Pomen za razvoj Slovenije
Rezultati raziskave imajo vpliv na pridobivanje novega znanja v Sloveniji in posledično na vključevanje tega znanja v nove tehnologije v domačem prostoru ter tudi širše. Osvojili smo bioinformatske obdelave NGS podatkov, projekt je poleg drugih NGS projektov v skupini vplival na razvoj bioinformatike – odločili smo se za vzpostavitev zmogljivega računalniškega serverja s pripadajočo zmogljivo programsko opremo za obdelavo podatkov.
Rastlinska olja predstavljajo 25% kalorij, ki jih dnevno porabijo prebivalci industrijskih držav. Poleg prehranske vrednosti so rastlinska olja tudi glavna kmetijska dobrina s svetovno produkcijo preko 40 milijonov kilogramov in letno vrednostjo tržišča okrog 35 milijard evrov. Velik tržni delež in dejstvo, da vsebnost maščobnih kislin vpliva na fizikalne in prehranske vrednosti olj, sta poglavitna razloga da obstaja veliko zanimaje za možnosti vplivanja na njihovo produkcijo v rastlini in sintezo farmakološko aktivnih molekul (biofenoli in vitamini). Genomski pristopi, ki vključujejo tudi analizo EST z uporabo bioinformatike, sedaj doprinašajo nova znanja o metabolizmu oljnic in regulaciji in izražanju genov, ki vplivajo na kvaliteto in količino olj.
Projekt je pomemben tudi za izobraževanje kadrov. V sklopu projekta se je izobraževala mlada raziskovalka in osvojila veščine bioinformatske obdelave NGS podatkov. Oljka je po obsegu kmetijskih površin na 2. mestu za jablano v Sloveniji in oljčno olje z geografskim poreklom je bilo kot prvi kmetijski proizvod s kakovostno oznako v Sloveniji potrjen s strani Evropske Unije. Posredni pomen projekta za družbo se kaže tudi preko izobraževanja mladih. Izobraževanje je ključnega pomena za spodbujanje inovativnosti in prenos raziskovalnih znanj v podjetništvo. Projektni rezultati so odlična učna platforma za dodiplomske in podiplomske študente za uvajanje v delo z NGS podatki.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Letno poročilo
2009,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
Letno poročilo
2011,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si