Projekti / Programi
Avtomatska analiza CT in MR slik hrbtenice
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
7.00.00 |
Interdisciplinarne raziskave |
|
|
Koda |
Veda |
Področje |
2.06 |
Tehniške in tehnološke vede |
Zdravstveni inženiring |
Raziskovalci (11)
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
25608 |
dr. Marko Bukovec |
Računalništvo in informatika |
Raziskovalec |
2009 - 2010 |
14 |
2. |
25528 |
dr. Miran Burmen |
Sistemi in kibernetika |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
112 |
3. |
23597 |
dr. Matevž Gorenšek |
Nevrobiologija |
Raziskovalec |
2010 - 2012 |
76 |
4. |
29559 |
dr. Jaka Katrašnik |
Sistemi in kibernetika |
Mladi raziskovalec |
2009 - 2012 |
16 |
5. |
15678 |
dr. Boštjan Likar |
Sistemi in kibernetika |
Raziskovalec |
2010 - 2012 |
381 |
6. |
27519 |
dr. Primož Markelj |
Sistemi in kibernetika |
Mladi raziskovalec |
2009 - 2010 |
20 |
7. |
31545 |
David Martinčič |
Medicina |
Tehnični sodelavec |
2010 - 2012 |
60 |
8. |
06857 |
dr. Franjo Pernuš |
Sistemi in kibernetika |
Vodja |
2009 - 2012 |
520 |
9. |
28465 |
dr. Žiga Špiclin |
Sistemi in kibernetika |
Raziskovalec |
2009 - 2011 |
140 |
10. |
17904 |
dr. Rok Vengust |
Medicina |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
200 |
11. |
23404 |
dr. Tomaž Vrtovec |
Sistemi in kibernetika |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
203 |
Organizacije (2)
Pomen za razvoj znanosti
Na osnovi rezultatov raziskav tega projekta ter na osnovi preteklih raziskav, se je raziskovalna skupina uveljavila kot ena vodilnih na področju avtomatske analize slik hrbtenice in vretenc. Zato pričakujemo, da bodo rezultati raziskav deležni velikega zanimanja raziskovalcev in bodo prispevali k razvoju znanosti. Najpomembnejše pa bi bilo, če bi raziskovalni rezultati koristili predvsem bolnikom, zdravnikom in družbi.
Raziskovalni rezultati tega projekta se odražajo v 12 izvirnih znanstvenih člankih, ki so bili objavljeni večinoma v revijah iz 1. četrtine revij na področju ter številnih predstavitvah na mednarodnih konferencah. Kakovost revij, v katerih so članki objavljeni, je povezana z večjo prepoznavnostjo v znanstvenem okolju in je odskočna deska za sodelovanje z domačimi ter tujimi znanstvenimi inštitucijami:
1. T. Vrtovec, B. Likar in F. Pernuš. Manual and computerized measurement of coronal vertebral inclination in MR images: a pilot study. Clinical Radiology, 2013. [FV: 1.952 (2011); 2. četrtina]
2. D. Štern, V. Njagulj, B. Likar, F. Pernuš in T. Vrtovec. Quantitative vertebral morphometry based on parametric modeling of vertebral bodies in 3D. Osteoporosis International, 2013. [doi:10.1007/s00198-012-2089-4] [FV: 4.580 (2011); 1. četrtina]
3. T. Vrtovec, M. Janssen, B. Likar, R. Castelein, M. Viergever in Franjo Pernuš. A review of methods for evaluating the quantitative parameters of sagittal pelvic alignment. The Spine Journal, 12(5):433-446, 2012. [doi:10.1016/j.spinee.2012.02.013] [FV: 3.290 (2011); 1. četrtina]
4. T. Vrtovec, M. Janssen, F. Pernuš, R. Castelein in M. Viergever. Analysis of pelvic incidence from three-dimensional images of a normal population. Spine, 37(8):E479-E485, 2012. [doi:10.1097/BRS.0b013e31823770af] [FV: 2.078 (2011); 2. četrtina]
5. T. Vrtovec, M. Janssen, F. Pernuš, R. Castelein in M. Viergever. Pelvic incidence: analysis in three dimensions. Journal of Bone and Joint Surgery, British Volume, 94-B(suppl. XLIV):107, 2012. [FV: 2.832 (2011); 1. četrtina]
6. T. Vrtovec, B. Likar in F. Pernuš. Manual and computerized measurement of sagittal vertebral inclination in computed tomography images. Spine, 36(13):E875-E881, 2011. [doi:10.1097/BRS.0b013e3181fe0aab] [FV: 2.078 (2011); 2. četrtina]
7. D. Štern, B. Likar, F. Pernuš in T. Vrtovec. Parametric modelling and segmentation of vertebral bodies in 3D CT and MR spine images. Physics in Medicine and Biology, 56(23):7505-7522, 2011. [doi:10.1088/0031-9155/56/23/011] [FV: 2.829 (2011); 1. četrtina]
8. T. Vrtovec, R. Vengust, B. Likar in F. Pernuš. Analysis of four manual and a computerized method for measuring axial vertebral rotation in computed tomography images. Spine, 35(12):E535-E541, 2010. [doi:10.1097/BRS.0b013e3181cb8d2b] [FV: 2.510 (2010); 1. četrtina]
9. D. Štern, B. Likar, F. Pernuš in T. Vrtovec. Automated detection of spinal centrelines, vertebral bodies and intervertebral discs in CT and MR images of lumbar spine. Physics in Medicine and Biology, 55(1):247-264, 2010. [doi:10.1088/0031-9155/55/1/015] [FV: 3.056 (2010); 1. četrtina]
10. T. Vrtovec, F. Pernuš in B. Likar. Determination of axial vertebral rotation in MR images: comparison of four manual and a computerized method. European Spine Journal, 19(5):774-781, 2010. [doi:10.1007/s00586-010-1340-y] [FV: 1.994 (2010); 2. četrtina]
11. T. Vrtovec, F. Pernuš in B. Likar. A review of methods for quantitative evaluation of axial vertebral rotation. European Spine Journal, 18(8):1079-1090, 2009. [doi:10.1007/s00586-009-0914-z] [FV: 1.956 (2009); 1. četrtina]
12. T. Vrtovec, F. Pernuš in B. Likar. A review of methods for quantitative evaluation of spinal curvature. European Spine Journal, 18(5):593-607, 2009. [doi:10.1007/s00586-009-0913-0] [FV: 1.956 (2009); 1. četrtina]
Pomen za razvoj Slovenije
Po zaključku temeljnega raziskovalnega programa lahko ocenimo, da so rezultati raziskav pomembni za Slovenijo. Koristi za gospodarstvo in družbo so predvsem naslednje:
- Koristi v smislu rezultatov: Rezultati raziskovalnega projekta so pomembno prispevali k napredku znanosti v Sloveniji na področju biomedicinske tehnike. Področje biomedicinske tehnike postaja predvsem zaradi staranja prebivalstva pomembno področje raziskav in razvoja, kar bo zahtevalo tudi ustanovitev študijskih programov biomedicinske tehnike. Glede na velikost projekta je veliko število objav v uglednih revijah ter prispevkov na mednarodno uveljavljenih konferencah pripomoglo k povečani prepoznavnosti Slovenije na znanstveno-raziskovalnem področju. To se neposredno in hitro odraža v članstvu uredniških odborov mednarodnih revij, članstvu v programskih odborih velikih konferenc, predavanjih na tujih univerzah, članstvu v komisijah za oceno in zagovor doktorskih disertacij na tujih uglednih univerzah, zanimanju tujih študentov za doktorski študij v okviru laboratorija (trenutno so v laboratoriju trije tuji študenti), vabilih za skupne projekte, obiskih tujih strokovnjakov, zanimanju velikih podjetij s področja medicinske tehnologije, itn.
- Koristi v smislu klinične uporabnosti: Rezultate raziskovalnega projekta bi potencialno lahko povezali z uporabo v kliničnem okolju. Predlagana standardizirana validacijska metodologija ter predlagani avtomatski postopki za kvantitativno vrednotenje rotacije vretenc so primerni za implementacijo kot namenska programska oprema, ki bi lahko zdravnikom olajšala delo pri vrednotenju rotacije vretenc. Modeliranje vretenčnih teles v 3D na podlagi superkvadrikov se je izkazalo kot metoda, ki je sposobna bolje razlikovati zdrava od deformiranih vretenčnih teles v primerjavi z uveljavljenimi metodami. S pomočjo te metode bi bilo načeloma možno tudi detektirati znake osteoporoze ter nadzirati napredovanje te bolezni, kot tudi napovedati morebitne zlome vretenčnega telesa. Koristi od tega bi imeli tako bolniki, zdravstveno osebje in torej v splošnem tudi družba.
- Tržno zanimivi produkti: Razvita standardizirana validacijska metodologija, avtomatski postopki za kvantitativno vrednotenje rotacije vretenc ter avtomatski postopek za modeliranje oblike vretenčnih teles v 3D se lahko implementirajo in tržijo kot samostojna namenska programska oprema, kot del obstoječih programskih paketov za analizo medicinskih slik ali pa kot del programske opreme naprav za CT in MR zajemanje slik. V tem smislu smo že navezali stike z velikimi proizvajalci programske in strojne medicinske opreme.
- Razvoj kadrov: Rezultati raziskovalnega projekta so nedvomno prispevali k povečanju znanja ter izboljšanju spretnosti raziskovalcev, ki so bili s projektom neposredno ali pa le delno povezani. Zaradi aktualne in zanimive teme projekta, kot tudi zaradi znanja in izkušenj raziskovalne skupine, ki se je povečalo, pričakujemo, da bodo naslednje raziskave privabile nove talentirane raziskovalce.
- Krepitev inštitucijskih zmožnosti: Predlagani raziskovalni projekt je delno omogočil tudi oskrbo z novimi ter izboljšanje oziroma prenovo obstoječih komponent strojne opreme, programske opreme, literature ter administrativnih in upravljavskih sistemov.
- Povečano in učinkovitejše sodelovanje: Na osnovi projekta so se vzpostavila nova (npr. Ortopedska klinika, KCLJ) in okrepila obstoječa sodelovanja (npr. Univerza v Utrechtu, Nizozemska), ki bodo posledično prispevala k učinkovitejšemu sodelovanju v prihodnosti.
- Viri sredstev: Za raziskovalce, kot tudi za organizacijo, kjer so se raziskave odvijale, se bo povečala sposobnost pridobivanja novih finančnih, tehničnih in organizacijskih virov za prihodnje raziskovalne projekte.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Letno poročilo
2009,
2010,
2011,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
Letno poročilo
2009,
2010,
2011,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si