Ekstrakcija visoko kakovostne DNK je ključna za vsako molekularno analizo. Vendar pa je iz problematičnega rastlinskega tkiva z visoko vsebnostjo fenolnih spojin, kot so listi jabolk le-to težje zagotoviti. Kljub široki ponudbi komercialno dostopnih kitov za izolacijo DNA, doslej še ni bila opravljena nobena študija, ki bi ocenila njihov potencial za jablano. Preizkusili smo šest različnih kitov in primerjali njihovo uspešnost s petimi do desetimi vzorci listov jabolk (Malus X domestica). Genomsko DNA smo izolirali po protokolih proizvajalcev in jo preizkusili v PCR z uporabo 12-ih različnih SSR markerjev. Kakovost DNA in PCR produktov smo primerjali na agaroznem gelu; poleg tega smo izmerili koncentracije DNA s fluorimeterom. Rezultati so pokazali visoko stopnjo variacije koncentracij in čistosti DNA; največji izkoristek (več kot 512 ng / µl) smo dobili z E.Z.N.A. SP rastlinskim kitom(Omega bio-tek), čeprav DNA ni bila popolnoma čista. Najvišjo čistost vzorca DNA smo zagotovili z uporabo kita DNeasy Plant Pro Kit (Qiagen); vendar z najnižjo koncentracijo DNA (13 ng / µl). Kljub velikim razlikam v koncentraciji DNA so vsi kiti zagotovili dobro DNA za nadaljnje pomnoževanje s PCR. Ugotavljamo, da ima izbira primerne metode za ekstrakcijo DNA posameznega vzorca pomembno vlogo pri kakovosti DNA in njenih nadaljnjih aplikacij. Ekstrakcija z DNeasy Plant Pro kitom (Qiagen) je bila najbolj učinkovita, saj smo pridobili najčistejšo DNA.
COBISS.SI-ID: 5602152