Virus vozličastega dermatitisa (LSD) se je leta 2016 hitro razširil v več držav, kar je povzročil resen izziv v zvezi z izvajanjem uspešnega nadzora bolezni in izvajanja cepljenja. Prvi primer LSD v Srbiji je bil laboratorijsko potrjen v občini Bujanovac junija 2016. Virus je bil izoliran v celicah govejih ledvic (MDBK), celoten genom LSD virusa pa je bil določen iz izolata SRB / Bujanovac/2016 z uporabo tehnologije naslednje generacije sekvenciranje, Ion Torrent. Ugotovljeni virus vsebuje 156 odprtih bralnih okvirjev (ORF). Spremembe nukleotidih zamenjav so bile naključno porazdeljene skozi celoten virusni genom. To je prvi celoten genom virusa LSD, določen v Srbiji in tudi na območju Balkana.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 4304506Tehnologija sekvenciranja naslednje generacije (NGS), poznana tudi kot masovno vzporedno sekvenciranje ali sekvenciranje visokih zmogljivosti, postaja vse bolj nepogrešljiva v viroloških laboratorijih po vsem svetu in je eden najnovejših pristopov pri ugotavljanju patogenov, njihovi karakterizaciji in epidemiološkemu nadzoru povzročiteljev kužnih bolezni. Pomembna prednost NGS je, da ni omejen s predhodno poznanim nukleotidnim zaporedjem patogenov in tako omogoča neposredno odkrivanje neznanih patogenov ter hkratno odkrivanje več patogenov v kliničnih vzorcih. Visoka zmogljivost omogoča pridobitev celotnih zaporedij genomov velikega števila sevov v časovno in cenovno sprejemljivem obsegu.
F.06 Razvoj novega izdelka
COBISS.SI-ID: 4387194Na vabljenem predavanju na strokovnem seminarju »Next Generation Sequencing v Mikrobiologiji«, ki ga je organiziralo podjetje Kemomed, so bili predstavljeni rezultati naših projektov s področja raziskav primerjalne genomike bakterije C. difficile ter nekaterih drugih medicinsko pomembnih bakterij, s pristopi NGS.
E.03 Drugo
COBISS.SI-ID: 92616449