Vzorce nosnih brisov smo testirali s tremi komercialnimi in eno novo uvedeno laboratorijsko metodo PCR v realnem času na prisotnost nukleinskih kislin desetih različnih patogenov. Prisotnost bakterije Pasteurella multocida smo ugotovili v 58.65% vseh vzorcev, bakterije Mannheimia haemolytica v 15.04%, medtem ko smo bakteriji Mycoplasma bovis in Histophilus somni ugotovili v 9.77% vzorcev. Med iskanimi virusi smo bovini respiratorni sincicialni virus ugotovili v 40.60% vzorcev, bovini koronavirus v 12.03% vzorcev, virus parainfluence 3 v 3%, virus bovine virusne diareje v 1.5% vzorcev; najmanj pogosto smo ugotovili prisotnost bovinega herpes virusa 1 in bovinega adenovirusa (0.75% vseh vzorcev). Izbor vzorcev iz te študije bomo v nadaljevanju uporabili za ugotavljanje respiratornih patogenov z metodo NGS.
COBISS.SI-ID: 4396666
Genom izolata virusa vozličastega dermatitisa SRB/Bujanovac/2016 sestavlja 150.661 nukleotidov in ima 99,95 % identičnost nukleotidnega zaporedja s sevom Neethling Warmbaths LW, ki je bil izolairan v Južni Afriki leta 1999. To je prva določitev celotnega genoma virusa vozličastega dermatitisa v Srbiji in tudi v balkanski regiji.
COBISS.SI-ID: 4374138
V tem plenarnem predavanju na kongresu Slovenskega mikrobiološkega društva je bil predstavljen del rezultatov s področja sekvenciranja črevesne mikrobiote v povezavi s kolonizacijo z bakterijo C. difficile ter del rezultatov s področja raziskav primerjalne genomike bakterije C. difficile.
COBISS.SI-ID: 512767288