Živčni rastni dejavnik (NGF) deluje pri vzdrževanju in rasti populacij nevronov. Kljub natančnemu poznavanju vloge NGF v fiziologiji nevronov še vedno primanjkuje znanje o strukturnih in mehanističnih dejavnikih bioaktivnosti NGF, ki jo modulirajo vitalni endogeni ligandi. Predstavljamo rezultate integriranega strukturnega in naprednega računskega pristopa za karakterizacijo zunajcelične interakcije ATP-NGF. Z NMR smo preiskali interakcijsko površino in orientacijo ATP na NGF. Z uporabo SPR smo odkrili funkcionalno vlogo te interakcije pri vezavi na receptorja TrkA in p75NTR. V povezavi z ATP smo raziskali tudi vlogo dvovalentnih ionov. Naši rezultati opredeljujejo ATP kot verjetni kratkotrajni molekularni modulator signalizacije NGF v zdravem in bolezenskem stanju.
COBISS.SI-ID: 62353155
F. Merzel je vodilni avtor pri članku. Njegov prispebvek k delu je bil razvoj teoretičnega modela za napoved degradacije premaza. Faktor vpliva revije je 33.23 .
COBISS.SI-ID: 6620186
V nasprotju z obsežnimi preiskavami molekularne in kristalne strukture na dihidratu oksalne kisline (C2H2O4 · 2H2O, ?-POX) in njegovih deuteriranih analogih (?-DOX), ni popolne analize vibracijskih spektrov. Takšna analiza je zaželena glede na protonsko dinamiko v kristalih ?-POX. V tem sporočilu poročamo o spektrih IR odbojnosti polarizirane sobne temperature enojnega kristala ?-POX, zabeleženega s kristalne ravnine izmeničnega toka in z ravnine, ki vsebuje os b-kristalografije, s polarizacijo vzdolž osi. Izvedena je bila disperzijska analiza odbojnih spektrov načinov simetrije Bu in Au z uporabo modelne dielektrične in odbojne funkcije, veljavne za monoklinični primer, in obravnavani rezultati. V tem delu so obravnavani tudi nekateri vidiki dobljenih rezultatov prileganja za nekatere spektralne regije in značilna sprememba odbojne funkcije s polarizacijskim kotom. Korelacija med kristalno strukturo in izmerjenimi spektri je skupaj z rezultati izvedene disperzijske analize dala odgovore na nekatere težave, povezane z usmerjenostjo prehodnih dipolnih trenutkov IR aktivnih načinov. Dodelitvi načinov pomagajo izračuni DFT. Drug vidik, zajet v tem delu, je model odbojnih funkcij z uporabo različnih teorij povprečenja, ki so bile uporabljene pri pridobivanju odbojnega spektra polikristalnega vzorca. Nadalje so bili obravnavani rezultati primerjave teh spektrov in zabeleženih odbojnih spektrov iz polikristalnega vzorca.
COBISS.SI-ID: 6594074
Sterol 14a-demetilaza (CYP51) je glavni cilj zdravila za zdravljenje glivičnih okužb. Povečanje incidence oportunističnih glivičnih okužb po vsem svetu in naraščajoča odpornost proti protiglivičnim zdravilom na osnovi azola povečujeta potrebo po razvoju strukturno ločenih in selektivnih glivičnih zaviralcev CYP51. V tem delu smo prvič raziskali vezavo piridiletanolskih (feniletil) aminov na kateri koli glivični CYP51. Primerjava vezave na Candida albicans in človeški CYP51, preučena s spektroskopskimi in modelirnimi metodami, je pokazala, da so deli, ki so odločilni za selektivnost in učinkovitost, povzročili razvoj visoko selektivnih derivatov s pomembno povečano zaviralno močjo. Strukturni vpogled v zahteve po selektivnosti tega novega kemičnega razreda glivičnih zaviralcev CYP51, njihove edinstvene vezivne lastnosti in nizka molekulska masa svinčevih derivatov ponujajo nove usmeritve za ciljni razvoj protiglivičnih kliničnih kandidatov.
COBISS.SI-ID: 37513219
IR spektroskopija je enostavno in nedestruktivno orodje za raziskovanje baterij. Vendar je bila njena uporaba zaradi težav povezanih z ravnanjem z vzorci ex situ in njihovo interpretacijo omejena. V tem članku smo prikazali preprosto operando ATR IR metodo, kjer smo za celico uporabili aluminijasto vrečko z dvema elektrodama in IR propustnim silicijevim oknom. Prednosti in omejitve predstavljene metode smo opisali na primeru reakcijskega mehanizma poliantrakinona v litijevih in magnezijevih organskih baterijah. Pokazali smo, da se med postopkom redukcije tvori tudi vmesni radikalni anion semikinon. Neprekinjeno merjenje IR spektrov omogoča tudi vizualizacijo postopnega nabiranja trdne elektrolitske interfaze na katodi kot posledica praznjenja in polnjenja baterije.
COBISS.SI-ID: 6689050