Pokazali smo, da endogeni stefin B tvori manjše, citoplazmatske agregate ter, da inhibicija proteasoma pripelje do povečanja količine endogenega proteina v celici, vendar tudi do večje agregacije stefina B. Z konfokalno mikroskopijo smo ugotovili, da so agregati stefina ko-lokalizirani z markerjema autofagije LC3 in p62. Delno ko-lokalizacijo agregatov stefina B pa smo opazili z ubikvitinom ter podenotami proteasoma S20 in S26, kakor tudi komponentami citoskeleta.
COBISS.SI-ID: 23321639
Identificirali smo interakcijo stefina B z histoni. Pokazali smo, da povečano izražanje stefina B v jedru vpliva na procesiranje CUX 1 transkripcijskega faktorja. Kot posledico manjše cepitve CUX 1, smo v celicah v katerih je bil stefin B še dodatno izražen v jedru, izmerili počasnejši potek celičnega cikla. Z uporabo FRET metode smo potrdili interakcijo stefina B z krajšo varianto katepsina L v jedru živih celic. Stefin B igra torej pomembno vlogo pri regulaciji aktivnosti katepsina L v jedru, ter da lahko ščiti substrate, kot npr. transkripcijski faktorji pred procesiranjem.
COBISS.SI-ID: 23338023
Ob klasični aktivaciji makrofagov je izražanje serpina A3G (SpiA3G) izrazito povišano. Pokazali smo povečano lokalizacijo SpiA3G, ter ko lokalizacijo z katepsinom L v jedercu makrofagov ob klasični, ne pa tudi alternativni aktivaciji makrofagov. Navkljub večjemu izražanju katepsina L v jedru klasično aktiviranih makrofagov, nismo detektirali katepsinske aktivnosti. Ker samo stimulacije z pro-vnetnimi, ne pa tudi proti-vnetnimi citokini privedejo do povečanega izražanja SpiA3G v jedercu, lahko sklepamo, da je translokacija SpiA3G v jederce pomembna pri obrambi organizma pred patogeni.
COBISS.SI-ID: 23524135
Številni mehanizmi, predvsem post translacijske regulacije, lahko vodijo do precejšnjih razlik med izražanjem proteinaz ter njihovo dejansko encimsko aktivnostjo. V članku so predstavljene strukturne značilnosti sond, usmerjenih proti aktivnemu mestu encima, ter uporaba le-teh sond v študijah proteinaz z različnimi tipi katalitskih mehanizmov
COBISS.SI-ID: 22136615
V članku je opisan razvoj in uporabo sond za aktivno mesto proteaz, uporaba teh sond za studij vloge proteaz v patoloških procesih. Bolj natančno smo se osredotočili na uporabo le –teh sond pri odkrivanju biomarkerjev, in vivo prikazovanju ter testiranju zdravil.
COBISS.SI-ID: 20499751