Preučevali smo specifičnost epotilonskih aciltransferaz (AT), ki odločajo o izbiri podaljševalnih enot v času biosinteze poliketidnih spojin in na takšen način bistveno vplivajo na končno strukturo te medicinsko pomembne protirakaste učinkovine. Pokazali smo tudi, da se lahko s pomočjo ciljno specifične (site-directed) mutageneze vpliva na specifičnost AT domen. V tem eksperimentu smo uporabili AT domene iz FKBP12 imunofilinskih ligandov, kot so FK506 in rapamicina. Znanja pridobljena v epotilonskem sistemu nas usmerjajo v pristopih manipulacije PKS sistema, kot je to npr. FK506.
COBISS.SI-ID: 3401080
Izražanje bakterijskih poliketidnih genskih skupin je pogosto regulirano s številnimi različnimi družinami regulatornih proteinov, kot je to primer pri tudi FK506. V tem članku smo izvedli primerjalno bioinformatsko analizo regulatornih genov, ki se nahajajo v oksitetraciklinski genski skupini v Streptomyces rimosus in klortetraciklinski genski skupini v S. aureofaciens, identificirali smo nov regulatorni gen otcG iz družine LAL(luxR), in ga z eksperimenti prekinitve in povečanim izražanjem otcG gena ovrednotili kot pogojno pozitivni regulator.
COBISS.SI-ID: 3608696