V tem delu smo proučevali apoptozo, izzvano z dejavnikom tumorske nekroze (TNF)-alfa pri dveh tumorskih celičnih linijah, U937 in T98G. Ugotovili smo, da med apotozo pride do destabilizacije lizosomov in sproščanja cisteinskih katepsinov v citosol. Vendar inhibicija cisteinskih katepsinov z inhibitorjem vseh cisteinskih katepsinov E64d ali inhibitorjem katepsina B CA-074Me, ni vplivala na potek apoptoze pri nobeni celični liniji. Zato smo zaključili, da apoptoza, izzvana s TNF-alfa, ni kritično odvisna od cisteinskih katepsinov v teh dveh celičnih modelih.
COBISS.SI-ID: 22717479
Proučevali smo mehanizme oligomerizacije proteinov z uporabo fuzijskih proteinov med rumenim fluorescenčnim proteinom (YFP) in GST, ki so vključevali več kot 20 alaninskih ponovitev. Fuzijski proteini, ki so vsebovali 23 polialaninskih ostankov so sedimentirali na saharoznih gostotnih gradientih, kar kaže na njihovo nestabilnost in dokazuje oligomerizacijo. Poleg tega so bili proteini odporni na razgradnjo s tripsinom. Zaključili smo, da oligomerizirani umetni proteini predstavljajo ustrezen model za proučevanje s polialanini povezanimi boleznimi, med drugim tudi nevrodegenerativnimi obolenji.
COBISS.SI-ID: 22527783