Ciklotialidini so zaviralci podenote bakterijske DNA giraze B (GyrB), z delovanjem na ATP vezavnem mestu. Naše in silico virtualno rešetanje smo zastavili na osnovi dosegljivih strukturnih informacij o ciklotialidinu GR122222X, pri čemer smo kombinirali molekulsko sidranje z informacijo o tridimenzionalni farmakofori. Odkrili smo nov razred 2-amino-4-(2,4-dihidroksifenil) tiazolnih zaviralcev z nizko mikromolekularno protigirazno aktivnostjo.
COBISS.SI-ID: 2731377
Naredili smo QSAR študijo na treh različnih nizih strukturno podobnih fluorokinolonov z obsežnih nizom molekulskih deskriptorjev. Z uporabo nelinearne metode protitočne širitve umetne nevronske mreže smo dobili modele z dobro napovedno močjo. Vse modele smo validirali z uporabo navzkrižnega izpuščanja ene molekule . Rezultati (Assay1, R = 0.8108; Assay2, R = 0.8454, and Assay3, R = 0.9212) z uporabo na zunanjem, prej neupoštevanem nizu molekul, kažejo, da ti modeli omogočajo QSAR za 6-fluorokinolone.
COBISS.SI-ID: 4355354
Klasični pristop kombinatorične kemije smo uporabili za generiranje 5590 novih strukturno podobnih analogov 6-fluorokinolonov z ozirom na sintezne poti z izbranimi primarnimi(43) in sekundarnimi amini(130). QSAR študijo na 304 izbranih 6-fluorokinolonih (z filtriranjem glede na podobnost učinkovinam) z neznano aktivnostjo smo naredili s petparametrskim modelom multiple linearne regresije (Rtr = 0.8417, Rtr-cv = 0.7884).
COBISS.SI-ID: 4501786
Pregledni članek povzema uporabo metod računalniške kemije v načrtovanju in iskanju novih spojin vodnic, s poudarkom na uspešnih primerih predvsem slovenskih raziskovalcev
COBISS.SI-ID: 4488218
Z metodo CP -ANN smo pripravili 54 različnih QSAR modelov, in sicer za tri nize fluorokinolonov z znano protituberkulozno aktivnostjo in z uporabo različnih tehničnih parametrov (dimenzije mreže in število učnih epoh) modeli služijo kot zanesljiva baza za razvrščanje z novo metodo, ki je zasnovana na vsoti razlik pri razvrščanju(SRD) in ki omogoča poiskati optimalni model. Za prvi niz smo našli najboljši model, za drugi sta dva modela enakovredna, za tretji niz pa ni bilo možno najti optimalnega modela.
COBISS.SI-ID: 4510490