Postavili smo robustno metodo za določanje možne bioaktivne konformacije linearnih peptidnih analogov mielinskega proteina, ki inducirajo EAE (experimental autoimmune encephalomyelitis) eksperimentalni sistem za študij skleroze multipleks ter njihove konformacijske in vezavne lastnosti primerjali z lastnostmi EAE antagonistov. Pokazali smo specifične strukturne lastnosti EAE agonistov in antagonistov, ki določajo razlike v njihovih interakcijah s T-celičnim receptorjem.
COBISS.SI-ID: 3843610
S kombinacijo vibracijskih in NMR metod smo določali strukturo dipeptidov v vodni raztopini. Pokazali smo, da v svetu uveljavljena potencialna polja sil za proteine ne zmorejo pravilno napovedati niti strukture glavne verige dipeptidov. Razlog je nepopolen teoretičen opis neveznih interakcij v proteinih ali peptidih. Rezultati so pomembni za razvoj novih potencialnih polj za študij strukture, dinamike in interakcij proteinov, vključno ligand-protein interakcij.
COBISS.SI-ID: 3877146