S kombinacijo NMR študij in računalniških simulacij molekularne dinamike novih ligand-MurD kompleksov smo dobili vpogled v dinamične lastnosti kompleksov, ki lahko bistveno nadgradi racionalno načrtovanje novih protibakterijskih učinkovin osnovano le na študijah rigidne kristalne strukture. Prepoznali smo konformacijsko fleksibilnost novih ligandov v vezavnem mestu in določili njen vpliv na posamezne ligand-receptor interakcije. Ugotovili smo, da je stopnja fleksibilnosti povezana s specifičnimi elementi molekularne strukture ligandov in z razlikami v njihovi inhibitorni aktivnosti.
COBISS.SI-ID: 4121626
Z NMR konformacijskimi študijami valsartana v topilu in simulacijami molekularne dinamike valsartan - AT1 receptor kompleksa v prisotnosti lipidnih dvoslojev smo raziskali vezavne interakcije valsartana z AT1 receptorjem. Valsartan preko inhibicije AT1 receptorja učinkovito deluje proti visokemu krvnemu pritisku. Ugotovili smo, da membransko okolje poveča vezavne interakcije valsartana z AT1 receptorjem in stabilizira ligand v aktivnem mestu receptorja ter pokazali na pomembno vlogo membranskega okolja v mehanizmu delovanja AT1 antagonistov.
COBISS.SI-ID: 4115994