Naloga rekonstrukcije bioloških omrežij, kot so metabolna in signalna omrežja, je v središču področja sistemske biologije. V članku predstavimo nekaj metod odkrivanja enačb, ki jih lahko uporabimo za rekonstrukcijo strukture omrežij in njihove celotne dinamike. Metode uporabljajo tako merjene podatke o časovnem poteku obnašanja sistema kot tudi obstoječe predznanje o modeliranem omrežju. Metode smo uporabili na nekaj problemih rekonstrukcije znanih in odkrivanja neznanih bioloških omrežjih in njihove dinamike.
COBISS.SI-ID: 21901607
Princip najmanjše opisne dolžine (NOD; angl. minimal description length - MDL) nam omogoča, da poiščemo optimalen kompromis med kompleksnostjo modela in njegovo napovedno napako. Predlagamo NOD shemo za regresijske polinomske enačbe, ki vsebuje shemi za kodiranje polinomov in nijhovih napak na podatkih. Našo izvedeno shemo NOD primerjamo z ad-hoc shemo NOD in pokažemo, da z njo dobimo boljše rezultate. Po točnosti je tako primerljiva z ostalimi regresijskimi metodami kot so modelska drevesa, pri tem pa so zgrajeni modeli veliko bolj preprosti.
COBISS.SI-ID: 21912103