Razvoj novih zdravil je dolgotrajen in drag proces, saj celotni postopek od ideje do končnega izdelka običajno zahteva vsaj deset let raziskav in več kot milijardo dolarjev. Z uporabo novih matematičnih pristopov in modernih računalnikov skušamo skrajšati in poceniti predvsem zgodnje faze razvoja, pri čemer nas zanimajo tarčne biološke molekule, ki so vpletene v potek različnih bolezni. V Laboratoriju za molekularno modeliranje na Kemijskem inštitutu v Ljubljani razvijamo nova matematična orodja za uporabo na področju razvoja novih zdravil. Z algoritmi, ki temeljijo na teoriji grafov in metodah simulacije molekulske dinamike, preučujemo tarčne biološke molekule in pridobivamo pomembne podatke za optimiziranje zgodnjih stopenj razvoja novih zdravil.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 5045786Razvili smo tak nov pristop za modeliranje organizacije s pomočjo molekularnega mrežnega pristopa, da bo organizacija postala učeča se organizacija. Uporaba molekularnega mrežnega pristopa omogoča obravnavo učeče se organizacije s pomočjo računalniških simulacij. Nov pristop je osnovani na modelu FUTURE-O®, ki je prvi slovenski celovit model, ki prek sedmih elementov vodi do popolno razvite učeče se organizacije. Z uporabo molekularnega mrežnega pristopa za modeliranje organizacije smo razvili model FUTURE-O®-DYN, novi model in računalniški program za simulacijo učeče se organizacije tako, da smo implementirali model FUTURE-O® v pristope za molekularno modeliranje. S takim pristopom smo razširili model FUTURE-O® in njegovo uporabnost v praksi ter pokazali, da predstavlja model FUTURE-O® model organizacije prihodnosti, ker je taka organizacija prožna kot molekula, ki se je sposobna hitro odzivati na zunanje spremembe.
B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci
COBISS.SI-ID: 5145370Predmet disertacije je bil razvoj in uporaba metod molekularnega modeliranja pri načrtovanju novih inhibitorjev bakterijskih encimov s poudarkom na D-alanil-D-alanin ligazi. V tem delu so združeni različni računalniški pristopi za odkrivanje novih zdravilnih učinkovin: virtualno rešetanje, iskanje inhibitorjev po podobnosti z znanimi aktivnimi spojinami, primerjalno modeliranje, napovedovanje proteinskih vezavnih mest z lokalnim strukturnim prileganjem ter simulacije molekulske dinamike. Istovetnost in čistost ligandov ter njihovo encimsko zaviralno in protimikrobno delovanje je bilo ugotavljano s pomočjo razsikovalnih partnerjev s Fakultete za farmacijo v Ljubljani in z Univerze v Leedsu.
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 262620672Patent : US 7285547 (B1), 2007-10-23. [Alexandria]: United States Patent and Trademark Office, 2007. 20 str., ilustr.
F.32 Mednarodni patent
COBISS.SI-ID: 1919345Janežič, Dušanka (urednik 2001-sedaj).
C.04 Uredništvo mednarodne revije
COBISS.SI-ID: 26533125