Za namen optimizacije katalizatorjev stereo-selektivne redukcije prokiralnih ketonov smo študirali gibljivost biotiniranih ligandov v umetnih metalo-encimih. J. Panek in A. Jezierska, ki sta bila podoktorska raziskovalca v našem laboratoriju, sta prispevala k tem raziskavam v času trajanja EU projekta IBAAC, katerega vodilna raziskovalca sva bila tudi T. Ward in M. Novič.
COBISS.SI-ID: 4447002
Na področju sledljivosti hrane smo objavili rezultate raziskav o ugotavljanju geološkega izvora ustekleničenih mineralnih vod, katerih elementne (v sledovih) kemijske analize so bile narejene dostopne v okviru evropskega projekta TRACE. Model omogoča klasifikacijo vzorcev mineralne vode glede na štiri različne geološke izvore.
COBISS.SI-ID: 4072218
Uvedli smo novo matriko razdalj za grafe, ki temelji na interpretaciji stolpcev matrike sosednosti grafa z n ogljišči kot niza točk v n-dimenzionalnem prostoru. Numerične vrednosti za razdalje temeljijo na Evklidski razdalji med n točkami v n-dimenzionalnem prostoru: združili smo tradicionalno predstavitev grafov (2D objekt brez določene geometrije) z njihovo predstavitvijo v n-dimenzionalnem prostoru. Nova matrika razdalj, imenovana tudi naravna matrika razdalj, ponuja nove invariante grafov kot molekulskih deskriptorjev za študije relacij med strukturo in lastnostjo oziroma aktivnostjo.
COBISS.SI-ID: 516139289
Opisana je numerična karakterizacija proteinskih map, ki temelji na delni ureditvi beljakovinskih lis glede na maso in naboj. Diagram delne ureditve je neposredno vključen v 2-D mapo, iz česar je izračunana ustrezna matrika sosednosti. Matrika sosednosti je razširjena s podatkom o intenziteti lis proteinov v gelu kot ustrezno normalizirani diagonalni elementi matrike. Pristop je prikazan na proteinskih mapah, ki temelji na rezultatih poskusa na jetrnih celicah podgan, izpostavljenih štirim peroksizomskih proliferatorjev. Določena je bila stopnja podobnosti med proteinskimi mapami.
COBISS.SI-ID: 4458010
V preglednem članku smo povzeli rezultate večletnih lastnih raziskav in-silico modelov za ocenjevanje spojin, motilcev žlez z notranjim izločanjem, ter rezultate primerjali z drugimi študijami, ki smo jih izbrali po temeljitem literaturnem pregledu. Opisali smo tudi primer in-silico modela (CAESAR) za napovedovanje reproduktivne toksičnosti, ki je pomemben faktor v postopkih registracije kemikalij.
COBISS.SI-ID: 4378138