1.

Cistein-specifična pegilacija rhG-CSF preko selensulfidnih vezi.

V članku opisujemo sintezo in uporabnost novega pegilacijskega reagenta, ki omogoča selektivno modifikacijo prostih tiolnih skupin proteinov. Preizkus na molekuli rekombinantnega človeškega dejavnika spodbujanja granulocitnih kolonij (rhG-CSF) je pokazal primerljive vrednosti s komercialno dostopnimi pegilacijskimi reagenti, obenem pa najvišjo biološko aktivnost z njim pripravljenih konjugatov.

COBISS.SI-ID: 1534556

2.

Za moške zarodne celice specifično izničenje holesterologenega citokroma P450, lanosterol 14[alfa]-demetilaze (Cyp51).

Predhodno smo s študijami "in vitro" pokazali, da imajo encim lanosterol 14[alfa]-demetilaza (Cyp51) in produkti njegovega delovanja pomembno vlogo v uravnavanju mejoze in v reprodukciji. V članku opisujemo poskus "in vivo", za katerega smo opravili pogojno izničenje gena Cyp51 v moških zarodnih celicah miši. Kot prvi smo na modelu "in vivo" pokazali, da "de novo" sinteza mejozo aktivirajočih sterolov (MAS) v moških zarodnih celicah ni ključno pomembna za spermatogenezo in reprodukcijo in da MAS, ki izvirajo iz zarodnih celic celično-avtonomno ne uravnavajo spermatogeneze in plodnosti.

COBISS.SI-ID: 30524121

3.

Inducibilni zgodnji cAMP represor uravnava gen periode 1 pri jetrni in adrenalni uri.

V članku v nasprotju s splošno veljavno paradigmo poročamo o od AMP aktivirane kinaze (AMPK) odvisni aktivaciji energijsko zahtevnih procesov ionskih črpalk. Predpostavljamo, da bi opisana aktivacija lahko predstavljala mehanizem, s katerim metabolni stres vpliva na natrijevo črpalko v skeletni mišici.

COBISS.SI-ID: 30528473

4.

Algoritem "Globalni sekvenčni podpis" (GSC) razkriva strukturno mrežo okoli CDR3 zanke variabilne domene težkoverižnih kamelidnih protiteles (nano-protiteles).

Eksperimentalno pridobljena kot tudi javno objavljena zaporedja hipervariabilnih domen protiteles smo uporabili za razvoj algoritma Global Sequence Signature (GSS) za odkrivanje mehanizmov somatske koevolucije med zanko CDR3 in ogrodjem protitelesa. Algoritem pride v poštev tudi kot pripomoček pri načrtovanju knjižnic rekombinantnih protiteles s postopki proteinskega inženirstva. Odprli smo tudi javno dostopno spletno stran s porgramsko opremo za uporabo omenjenega algoritma v biokemiji, molekularni biologiji in biotehnologiji: KASTELIC Damjana, SOLER Nicolas, KOMEL Radovan, POMPON Denis: Global sequences signature analysis of camelidae VH/VHH sequences. [S. l.: s. n., 2013]. http://gss.mrc-lmb.cam.ac.uk/. [COBISS.SI-ID 30498265]

COBISS.SI-ID: 30498009

5.

Optimizirana izdelava proteinske mikromreže iz DNA, z uporabo "in vitro"ekspresije po tehnologiji "DNA to Protein Array" (DAPA).

Proteinske mikromreže so zaradi neobstojnosti problematične za shranjevanje in uporabo tudi v krajšem časovnem obsegu. Rešitev ponuja tehnologija DAPA, ki temelji na robustnejši in obstojnejši DNA mikromreži, iz katere s postopkom "in vitro" transkripcije in translacije pridobimo ustrezno proteinsko mikromrežo v trenutku potrebe. V članku opisujemo optimizacijo metode, ki bo omogočila uporabo proteinskih mikromrež za osebno usmerjeno diagnostiko in presejevalna testiranja.

COBISS.SI-ID: 30530521