V tem delu smo kritično ovrednotili vlogo lizosomov in lizosomskih katepsinov pri treh poglavitnih tipih celične smrti, apoptozi, nekrozi in avtofagiji. Pri tem velja omeniti, da avtofagija verjetno ni mehanizem celične smrti, ampak preživetveni mehanizem. Članek temelji tudi na naših predhodnih rezultatih.
COBISS.SI-ID: 22640935
Poročila o vlogi inhibitorjev cisteinskih proteaz, človeških cistatinov, na neurodegeneracijo pri Alzheimerjevi bolezni, so si v splošnem nasprotujoča. Študij transgenih živali je nadalje pokazal, da cistatin C veže topno obliko Abeta, torej izboljša stanje transgenih živali, drugi pa so nasprotno opazili, da izbitje genov za cistatine (tako C kot B) poveča amiloidno patologijo. V tem članku pa je podan kritičen pregled vloge cistatinov pri teh procesih.
COBISS.SI-ID: 22609959
Proteini iz naddružine cistatinov so glavni endogeni inhibitorji cisteinskih katepsinov ter legumaina, ki imajo ključno vlogo pri številnih fizioloških procesih, vključno z razgradnjo proteinov in antigensko prezentacijo. S filogenomsko analizo več kot 2000 prokariontskih in evkariontskih genomov, ter številnih transkriptomov in proteomov, smo raziskali in pojasnili nastanek in evolucijo cistatinske naddružine. Naša študija je spremenila uveljavljen pogled na klasifikacijo, nastanek, funkcionalno diverzifikacijo in evolucijo cistatinske naddružine.
COBISS.SI-ID: 23152679
Izredno pomembno je bilo odkritje proteina fascina kot regulatorja aktivnosti proteina Rab35, ki je eden ključnih faktorjev pri vzpostavitvi aktinskih filamentov. Pri raziskavi smo uporabili afinitetno kromatografijo za izolacijo proteinskih vezavnih partnerjev, ki smo jih potem identificirali z masno spektrometrijo. Med njimi smo odkrili tudi fascin, ki je bil potem potrjen kot kritični efektor proteina Rab35. Vpeljava omenjene metode je velikega pomena pri nadaljnjem delu.
COBISS.SI-ID: 22849063
V tem članku smo z različnimi metodami pokazali, da ima prokatepsin B majhno, vendar pomembno katalitsko aktivnost, ki zadošča za sprožitev avtokatalitske aktivacije encima. Na tej osnovi smo predpostavili, da ta model velja za vse cisteinske katepsine in je fiziološko pomemben pri različnih bolezenskih stanjih, vključno z rakom in revmatoidnim artritisom ter artrozo.
COBISS.SI-ID: 22392615