S pomočjo študija dinamike molekul smo raziskali interakcije med ioni za različne modele vode. Izračunali smo potencial povprečne sile za vse kombinacije soli, ki jih dajo ioni 1. in 7. skupine periodnega sistema. Poleg tega smo izračunali ravnotežne konstante za asociacijo in jih primerjali s poskusi. Iz primerjave potencialov povprečne sile smo ugotovili, da Collinsova hipoteza v našem primeru velja: dva majhna iona (kation in anion) in dva velika iona bosta v vodi z veliko verjetnostjo tvorila kontaktni par, medtem ko dva različno velika iona povezujejo molekule vode.
COBISS.SI-ID: 30430213
V tem delu smo z računalniško simulacijo Monte Carlo in s teorijo, ki je osnovana na Ornstein-Zernike-ovi integralski enačbi, raziskovali prispevek topila k sili med koloidnimi delci. Rezultati so pokazali nihajoč privlačni in odbojni značaj sile s periodo enako velikosti molekul topila. Pokazali smo, da pri dovolj močnih privlačnih interakcijah med molekulami topila postane sila daljnosežna in privlačna pri vseh razdaljah med koloidnimi delci. Ti rezultati so zelo pomembni za razumevanje stabilnosti koloidnih disperzij.
COBISS.SI-ID: 30270469
Giraza, za življenje bakterije nujna topoizomeraza, je tarča različnih antibiotikov in tudi bakterijskega toksina CcdB. Ta z vezavo na girazo prepreči prepisovanje in podvojevanje DNA. Ker so bile molekulske gonilne sile razvitja giraze in njenega vezanja s CcdB nepoznane, smo izvedli podrobno termodinamsko raziskavo teh dveh procesov. Razdelitev dobljenih termodinamskih količin na različne prispevke predvideva, da je prepoznavanje giraze s CcdB spremljano z znatnimi strukturnimi spremembami nekaterih domen giraze, kar je v skladu s predpostavljenim strukturnim modelom vezanja.
COBISS.SI-ID: 30725381
Vpliv gostote naboja na poliionu in vrste protiiona v vodnih raztopinah ionen fluoridov in bromidov smo proučevali s pomočjo dielektrične relaksacijske spektroskopije. Rezultati te raziskave skupaj z prejšnjimi teoretičnimi in eksperimentalnimi dognanji potrjujejo, da fluoridni ion bolj šibko interagira z ioneni kot pa, na primer, bromidni anion.
COBISS.SI-ID: 30525189
S pomočjo Monte Carlo simulacij pri konstantnem tlaku in temperaturi smo študirali trirazsežni MB model vode. Poleg tega smo izpeljali in testirali Wetheimovo Ornstein–Zernike integralsko enačbo in ustrezno perturbacijsko teorijo za ta primer. Oba pristopa sta nekaj velikostnih razredov bolj učinkovita od simulacij. Cilj naših raziskav je razviti statistično–mehansko teorijo, ki bo uspešno (in dovolj učinkovito) napovedala lastnosti orientacijsko odvisnih sistemov molekul kot je voda.
COBISS.SI-ID: 33405957