Napredek v razumevanju nekaterih pomembnih celičnih procesov je precej počasen zaradi pomanjkanja znanja o silah, ki vodijo zvitje G-kvadrupleksnih struktur v z gvanini bogatih zaporedjih DNA. V predstavljenem delu smo izvedli globalno termodinamično analizo kalorimetričnih in spektroskopskih podatkov pridobljenih z opazovanjem zvitja/razvitja človeške telomerne DNA povzročenega s spremembo temperature in/ali koncentracije soli. Pokazali smo, da lahko razvitje človeške telomerne DNA opišemo kot ravnotežen monomolekularen proces, ki vključuje tri termodinamično razločljiva stanja: zvito, vmesno in razvito. Naši rezultati predstavljajo prvo eksperimentalno potrditev mehanizma zvitja človeške telomerne DNA, ki vključuje več stabilnih makroskopskih stanj, predlaganega na osnovi teorijskih raziskav.
COBISS.SI-ID: 36015365
Tu predstavljamo prve simulacije dinamike ionov in vode v raztopinah 3,3- in 6,6-ionenov, nevtraliziranih z fluoridnimi, kloridnimi, bromidnimi in jodidnimi ioni. Za opis molekul vode smo uporabili SPC/E model. Pokazali smo, da se ioni, ki se nahajajo ob oligoionu hitro izmenjujejo s tistimi, ki se nahajajo dlje proč. Frekvenca te izmenjave je odvisna od vrste protiiona in gostote naboja na oligoionu. Izračunali smo povprečni čas (residence time), ki ga neka ionska vrsta preživi v stiku z oligoionom in predlagali model po katerem lahko ione razdelimo na "vezane" in "proste". Rezultate smo obravnavali v luči naših meritev transportnih in termodinamskih količin za te raztopine.
COBISS.SI-ID: 36050437
V tem članku, ki je bil objavljen v reviji Journal of Physical Chemistry B (2012, 116 (21), pp. 6177-6186; [COBISS.SI-ID 36007173]), je predstavljena enostavna analitična teorija hidratacije hidrofobnih topljencev. Rezultati teorije kvalitativno popolnoma pravilno opišejo vse bistvene lastnosti hidrofobnega efekta. Članek se je uvrstil med pet najbolj branih člankov v tej reviji v drugem in v tretjem četrtletju leta 2012. V reviji, ki se s SCI 3,696 uvršča v prvo četrtino revij s področja fizikalne kemije, je letno objavljenih okoli 6000 člankov.
COBISS.SI-ID: 36007173