P1-0201 — Letno poročilo 2013
1.
Izomere salicilata in micelizacija dodeciltrimetilamonijevega klorida: majhne razlike ­ velik učinek

Z izotermno titracijsko kalorimetrijo, meritvami električne prevodnosti in 1H NMR spektroskopijo smo preučevali smo vpliv natrijevih soli m­ in p­ hidroksibenzojeve kisline (m­HB in p­HB) na agregacijske procese dodeciltrimetilamonijevega klorida (DTAC) ter jih primerjali s že objavljenimi podatki za natrijevo sol o­hidroksibenzojeve kisline (o­HB). Ugotovili smo, da v prisotnosti p­HB DTAC tvori sferične micele, medtem ko je v primeru o­HB možno sklepati na dve različni stanji: v raztopinah z nizko koncentracijo o­HB nastajajo sferične, pri višji koncentraciji pa cilindrične micele. Prehod od cilindričnih do sferičnih oblik se kaže tudi v povečani gibljivosti molekul surfaktanta, ker je jedro cilindričnih micel bolj kompaktno zaradi popolne izključitve vode iz notranjosti micel. m­HB kaže nekako »vmesno« obnašanje. Očitno je, da različna pozicija hidroksilne skupine na aromatskem obroču odločilno vpliva na možnost vključevanja hidrobenzoatnega aniona v agregate DTAC.

COBISS.SI-ID: 36610565
2.
Študij interakcije med trivalentnimi lantanidi in stereoregularnimi polimetakrilati s pomočjo luminiscence, določanjem vezavne izoterme, JMR, in interakcijo s cetil piridinijevim kloridom.

Študirali smo interakcije med izotaktično, sindiotaktično in ataktično polimetakrilno kislino in trivalentnimi lantanidnimi ioni z luminiscenčnimi metodami, NMR meritvami in meritvami izoterm vezanja. Meritve fluorescence so pokazale, da se trivalentni kationi močno vežejo na karboksilatni anion na bidentaten način. Pri tem trivalentni ioni izgubijo 5-6 molekul vode iz hidratnega ovoja. Obnašanje je odvisno od pH in od stereoregularnosti polielektrolita. Vezanje surfaktantov na poliion v prisotnosti lantanidov je nekooperativno.

COBISS.SI-ID: 1656879
3.
Dvo-dimenzionalni model z mehko sredico in vodi podobnimi lastnostmi

Z Monte Carlo simulacijami in teorijo integralskih enačb smo preučevali termodinamične in strukturne lastnosti delcev, ki interagirajo z gladko obliko Stell-Hemmerjevega potenciala. Pokazali smo, da je potencial z dvema karakterističnima dolžinama zadosten pogoj, da lahko opazimo vodi podobne lastnosti in anomalije, med drugim tudi znano gostotno anomalijo. Pokazali smo tudi, da nekatere verzije integralskih enačb popolnoma odpovejo pri opisu, medtem, ko je napoved drugih le kvalitativna.

COBISS.SI-ID: 1647663
4.
Recikliranje uranila iz kontaminirane vode

Številni separacijski procesi so odvisni od obnašanja ionov ob nabitih površinah. S teorijo srednjega polja in kanonično Monte Carlo simulacijo smo obravnavali strukturo raztopine, ki vsebuje uranilove ione, in ki se nahaja v planarni nabiti reži. UO_2^{2+} ion je linearen in ima prostorsko ločen naboj. Rezultati kažejo, da so tik ob nabiti površini ioni orientirani vzporedno z njo, na razdaljah od površine, večjih od polovice dolžine iona, pa naključno. Pri večjih površinskih gostotah naboja na ploščah postane sila med njima privlačna. Rezultati teorije in simulacij se zelo dobro ujemajo med seboj.

COBISS.SI-ID: 4593003
5.
Termodinamika vezanja nativno razvitega proteina sklopljenega z njegovim zvitjem

Članek podaja opis obnašanja proteina brez definirane prostorske strukture v nativnem stanju (intrinsically disordered protein = IDP). Razumevanje mehanizmov delovanja IDPjev je v splošnem interesu, saj je bilo spoznano, da lahko igrajo pomembno vlogo pri mnogih celičnih procesih, tudi pri tistih, ki vodijo do bolezni kot sta Alzheimerjeva ali rak. V članku je pokazano, kako in zakaj se lahko IDP kljub zvitju v dobro definirano strukturo (velika izguba konformacijske prostosti) veže na tarčo z zelo visoko afiniteto. Avtorji sklepajo, da za zvitje IDP ob vezanju velja podobno, kot je za zvitje globularnih proteinov pokazal nobelovec Christian Anfinsen – struktura IDP v vezanem stanju je lahko v veliki meri zapisana v njegovem aminokislinskem zaporedju.

COBISS.SI-ID: 36496133