Primarni sklerozirajoči holangitis (PSH) je huda bolezen jeter neznanega izvora, ki vodi do fibroze žolčnih vodov. V končni fazi bolezni je potrebna presaditev jeter. V raziskavi smo primerjali 3789 vzorcev bolnikov evropskega porekla s PSH z 25.079 kontrolnimi vzorci z uporabo Immunochip4. Določili smo 12 novih področij, od teh je 9 na novo določenih, ki so povezani s povečanim tveganjem za nastanek PSH. Vseh področij je zdaj 16. Kljub dejstvu, da je obstajala 27% povezava pojavljanja PSH in kronične vnetne črevesne boezni (KČVB) je 6 od 12 določenih področij pokazalo na bistveno močnejšo povezavo z nastankom PSC kot KVČB, kar kaže na prekrivajočo, a vseeno gentsko ločeno arhitekturo teh dveh boelzni. V nadaljevanju smo analizirali še genetsko sliko 7 bolezni, ki se pojavljajo hkrati s PSH in ugotovil, da obstaja še dodatnih 33plei tropičnih lokusov povezanih s tveganjem za PSH. Te ugotovitve so razširile zemljevid genetskih tveganj za PSH in pojasnile odnos med PSHO in drugimi boleznimi imunskega sistema.
COBISS.SI-ID: 512280376
Princip imuno-genetskega zdravljenja raka temelji na uvedbi nukleinskih kislin, ki kodirajo imunostimulatorne beljakovine npr. interlevkin 12 (IL-12) v somatske celice. S tem se ojači imunski odgovor proti tumorju. Za vnos nukleinskihkislin v celice lahko uporabo manetofekcijo, vnos nukleinskih kislin na magnetne annodelce, ki jih potem izpostavimo zunanjemu magnetnemu polju. V tej raziskavi smo dokazali varnost in učinkovitost nanodelcev SPION-PAA-PEI, ki se jih uporablja kot nosilce za magnetofekcijo tumorjev ter učinkovito protitumorsko aktivnost plazmidne DNA, ki kodira IL-12 in je vezana na nanodelce SPION-PAA-PEI.
COBISS.SI-ID: 1237883
S pomočjo genskih variant izvirajočih iz podatkovne baze 1000 genome project in dodatnih podatkov iz resekvenčnih študij smo s pomočjo gostotne gentipizacije določili 183 ne- HLA lokusov povezanih s tveganjem za imunske bolezni pri 12041 posameznikih s celiakijo in 12228 kontrolnimi preiskovanci. Identificirali smo 13 novih lokusov povezanih s tveganjem za celiakijo. S tem se je število za s celiakijo povezanih lokusov povečalo na 40. Na več kot tretjini lokusov smo našli več neodvisnih signalov, kar klahko pripišemo kombinaciji pogostih in redkih genetskih variant. Rezultati, pridobljeni z našo metodo pridobljeni na večjem vzorcu, so bolj natančni, ker je metoda bolj občutljiva. 29 od 54 označenih signalov je lociranih na posameznem genu, v nekaterih primerih pa le na regulatornih elementih gena. Če povzamemo, smo opredeliti kompleksno genetsko strukturo regij, povezanih s tveganjem za celiakijo innaredili pomemben korak pri odkrivanju vzročnih mehanizmov bolezni.
COBISS.SI-ID: 512172344
V okviru študije smo z metodo sekvenciranje naslednje generacije določili nukleotidno zaporedje 56 genov, ki so se v predhodnih GWAs študijah izkazali najbolj statisično značilno povezani z kronično vnetno črevesno boleznijo (KVČB) in odkrili nove redke mutacije, ki so najverjetneje vzročne za nastanek KVČB in vključujejo gene NOD2/CARD15, IL23R, CARD9, IL18RAP, CUL2, C1orf106, PTPN22 in MUC19. Te redke mutacije smo nato preverili z neodvisno GWA analizo na več kot 12 000 bolnikih z KVČB in več kot 10 000 zdravimi kontrolami. V potrditveni skupini je bilo vključenih tudi 250 slovenskih KVČB bolnikov in 250 slovenskih kontrol. Novo odkrite vzročne mutacije bodo omogočile funkcijske študije in izdelavo napovednih modelov za testiranje genetsko pogojenega tveganja za KVČB.
COBISS.SI-ID: 15421974
Izvedli smo asociacijsko študijo v celotnem genomu pri skupno 75000 bolnikih s kronično vnetno črevesno boleznijo (KVČB) in kontrolami iz 18 različnih populacij in odkrili skupno 163 genov povezanih z boleznijo, od tega 71 novih genov. Ugotovljeno je bilo, da je od že omenjenih 163 identificiranih genov 110 takih, ki so povezani z obema podtipoma bolezni, 30 genov pa je povezanih samo s crohnovo boleznijo in 23 samo z ulceroznim kolitisom. Mnogi geni povezani s KVČB so povezani tudi z ostalimi kroničnimi imunskimi boleznimi, predvsem z ankilozirajočim spondilitisom in luskavico. Z bioinformatsko analizo molekularno-genetskih mrež vzporednega izražanja in razvrščanja genov v hierarhične skupine po funkcijski podobnosti je študija ugotovila, da je večina genov in bioloških poti, po katerih poteka patogeneza te bolezni, enakih tistim, ki jih celice uporabljajo za odziv na okužbo z mikrobi, kar nakazuje, da so na razvoj genetske nagnjenosti za kronično vnetno črevesno bolezen v preteklosti močno vplivale okužbe z mikrobi.
COBISS.SI-ID: 512230968