Proučili smo genotoksičnost TiO2 delcev na enocelične migetalkarje, Tetrahymena thermophila, s kometnim testom. Izpostavljenost prostih celic, celic imobiliziranih v gelu ali jeder imobiliziranih v gelu titanovemu oksidu oz. nanodelcem TiO2 je vedno privedla do pozitivnega rezultata kometnega testa, izida pa nismo uspeli potrditi z analizo citotoksičnosti, npr. peroksidacijo lipidov, povišano količino reaktivnih kisikovih vrst ali sestavo celičnih membran. Objavljena poročila navajajo, da do genotoksičnosti titanovega oksida oz. nanodelcev TiO2 v odsotnosti dokazljive citotoksičnosti ne prihaja neposredno. Možna razlaga naših rezultatov je, da so lažno pozitivni rezultati posledica postfestum interakcij med delci in DNK. Predlagamo, da se pred uporabo kometnega testa za analizo genotoksičnosti nanodelcev upošteva možnost postfestum interakcij zaradi izpostavljenosti DNK nanodelcem. Kometni test, ki je opisan v tem poročilu in se izvaja v acelični obliki, se lahko uporabi v ta namen.
COBISS.SI-ID: 2573903
Ruminococcus flavefaciens je pomembna celulolitična bakterija, ki jo najdemo v prebavilih sesalcev. V študiji smo pridobili nove informacije o sestavi in uravnavanju izražanja sestavin zunajceličnega proteoma R. flavefaciens v odvisnosti od vira energije (celobioza, celuloza Avicel, ksilan). Primerjali smo tudi izražanje dveh sevov, od katerih je eden sposoben rasti na bombažu (007C), drugi pa je to sposobnost izgubil (007S). Pri obeh sevih smo ugotovili diferencialno izražanje nekaterih zunajceličnih proteinov v odvisnosti od substrata, pri čemer se ob rasti na celulozi pri sevu 007C najmočneje povečalo izražanje celulosomske hidrolaze GH48, proteina podobnega rubreritrinu (Rub) in proteina, sorodnega pilom tipa IV (Pil). Pri sevu 007S izražanje proteinov Rub in Pil ni bilo povečano, kar nakazuje na njuno potencialno vlogo pri razgradnji bombaža.
COBISS.SI-ID: 3233672
Namen raziskave je bil primerjati priporočila za dopolnitev krme z vitaminom E (VE) in bioaktivnost RRR- (rT) ter all-rac--tokoferola (racT) pri oksidativnem (OKS) stresu in OKS stabilnosti mesa piščancev. Vse skupine (5) so dobivale krmo s 7,5% maščob, ena s palmovim, ostale z lanenim oljem (LO), ki so bile brez (K) ali z dodatkom 85 ali 200 IU racT ali 85 IU rT. OKS stres smo spremljali z merjenjem poškodb DNK, MDA (plazma, jetra, meso) in ACL. Analizirali smo tokoferole v plazmi, jetrih in mesu. OKS stabilnost smo proučevali v svežem, skladiščenem in toplotno obdelanem mesu. LO povzroča poškodbe DNK in nastajanje MDA. Obe obliki in koncentraciji VE zmanjšata poškodbe DNK in MDA v mesu. Na -T v tkivih in plazmi vpliva raven dodatka VE. Za dobro OKS stabilnost mesa je potreben višji dodatek VE. Rezultati potrjujejo, da je razmerje bioaktivnosti med rT in racT 1,39.
COBISS.SI-ID: 2888840
Nukleotidno zaporedje Shine-Dalgarno je bistven element iniciacije translacije pri bakterijah. Bioinformacijska analiza več kot štiridesetih genomov velikega bakterijskega debla Bacteroidetes pa je razkrila, da te sekvence v njih ne najdemo in da so 5' neporevedene regije mRNA zelo revne z GC in zato tam ne nastajajo močne sekundarne strukture mRNK. Poskusi s Prevotella bryantii TC1-1, ki sodi med Bacteroidetes so potrdili, da med iniciacijo translacije po vsej verjetnosti ne pride do nastanka SD interakcije med mRNK in malo ribosomsko podenoto, kar verjetno drži tudi za druge predstavnike Bacteroidetes. Predlagamo, da torej v iniciaciji ključno vlogo igra ribosomski protein S1, ki se veliko bolje veže pred start kodonom, kot znotraj gena zaradi močnejših sekundatnih struktur v njem.
COBISS.SI-ID: 2912136
Nizin je najbolje proučeni bakteriocin mlečnokislinskih bakterij, značilen za vrsto Lactococcus lactis.V prispevku je bila predstavljena dinamika izražanja 11 genov, vpletenih v produkcijo nizina, v Lc. lactis M78 na modelu sira. Prisotnost nizina v modelnem siru smo uspeli potrditi tudi z biološkim testom. Delo je pomembno, ker prikazuje nov pristop (osamitev RNA, RT realtime PCR) za proučevanje bakteriocinov v kompleksnem okolju, kot so hrana ali prebavila, ki ga bo mogoče uporabiti tudi v študijah drugih bakteriocinov.
COBISS.SI-ID: 2799240