Prionske bolezni so usodne nevrodegenerativne bolezni, kjer se prionski protein pretvori iz normalne clične oblike v patološko obliko, katere struktura ni znana. Proces pretvorbe smo analizirali z uvedbo kovalentnih disulfidnih mostičkov s pomočjo katerih smo ugotovili, da pri pretvorbi večina elementov sekundarne strukture ostane ohranjena, mora pa priti do ločitve poddomen, kar omogoči tvorbo dimerov z izmenjanimi domenami.
COBISS.SI-ID: 4602394
Endosomski TLRs igrajo pomembno vlogo pri prirojenegm imunskem odzivu, kot tudi v avtoimunskih procesih. Pri zdravljenju sistemskega eritematoznega lupusa, že dolgo uporabbljamo klorokin, hidroksiklorokin in kvinakrin Ugotovili smo, da klorokin inhibira aktivacijo endosomskih TLRs preko nukleinskih kislin. Nadalje smo ugotovili, da druge spojine, ki vežejo nukleinske kisline, kot so propidijev jodid, prav tako zavirajo aktivacijo endosomskih TLRs in kolokalizirajo z nukleinskimi kislinami v endosomih. Ugotovili smo, da imidazokinolini, ki so TLR7 / 8 agonisti zavirajo TLR9 in TLR3 tudi v odsotnosti TLR7 ali TLR8 in da je njihov mehanizem inhibicije je podoben antimalarikom. V nasprotju z bafilomicinom, nobeden od testiranih antimalariki ni zaviral endosomske proteolize ali povečal endosomskega pH, kar potrjuje, da zaviranje zakisanja pH ni osnovni vzrok za inhibicijo. Sklepamo, da je neposredna vezava inhibitorjev v nukleinskih kislin maskira TLR-vezalni epitop, kar pojasnjuje učinkovitost teh spojin pri zdravljenju avtoimunskih bolezni.
COBISS.SI-ID: 2971761
HIV-1 predstavlja zahtevno tarčo za terapevtske spojin zaradi visoke stopnje mutacije virusa. Ciljna usmerjenost strukturnih vzorcev namesto stalno spreminjajočem poseben 3D strukture lahko predstavlja pristop, ki je manj občutljiv na virusne mutacije. V3 zanka gp120 virusa HIV-1, ki je odgovorna za vezavo virusnega gp120 na CCR5 ali CXCR4 koreceptorjev, je že znana kot učinkovit cilj za zaviranje vstopa virusa. Peptid iz V3 zanke gp120 se veže na LPS, tako kot tudi celoten protein gp120 . Interakcija med LPS in V3 temelji na strukturnem vzorcu, ki predstavlja kombinacijo interakcij hidrofobnih in elektrostatskih interakcij, podobno kot interakcija med antimikrobnimi peptidi in LPS. LPS zavira vezavo gp120 na površini celic ciljnih T. Antagonisti LPS lahko predstavljajo učinkovine za preprečevanje vnosa virusa HIV-1 v celice.
COBISS.SI-ID: 4677402