Predstavljamo nov pristop za študij protonske dinamike v kratkih vodikovih vezeh, ki temelji na posnetkih molekulske dinamike, izračunu protonskih potencialov ter reševanju vibracijske Schrödingerjeve enačbe za vsak posnetek. Izračunana kontura OH valenčnega nihanja se dobro ujema z eksperimentalnim infrardečim spektrom. Profil proste energije ima enojni in širok minimum blizu sredine vodikove vezi, kar omogoča pogosto prehajanje protona z ene strani vodikove vezi na drugo. Predstavljena metodologija je uporabna za proučevanje delovanja encimov.
COBISS.SI-ID: 4420122
In this work we upgraded the kinetic studies of histamine uptake into neonatal rat cultured type 1 astrocytes with quantum chemical calculations of histamine pKa values in conjunction with Langevin dipoles solvation model. Our results indicate that astrocytes transport histamine by at least two carrier mediated processes, a concentration gradient dependent passive and a sodium dependent and ATP-driven active transport. We also demonstrated that histamine protonation states depend on the polarity of the environment.
COBISS.SI-ID: 4319258