V članku predstavimo aplikacijo metode simulacije s prilagodljivo resolucijo AdResS za solne raztopine. Večskalna metoda AdResS omogoča dinamično spreminjanje molekularne ločljivosti preko sklopitve atomističnih in grobozrnatih modelov tekočin. V ta namen razvijemo grobozrnate modele soli za uporabo s klasičnimi polji sil in izpeljemo termodinamske sila, ki omogočajo termodinamično ravnovese molekularnih vrst čez simulacijsko škatlo.
COBISS.SI-ID: 5301530
ESPResSo++ (Extensible Simulation Package for Research on Soft matter) je na novo zasnovan prostodostopen simulacijski paket s podporo za vzporedno izvajanje simulacij sistemov mehke snovi. Poleg običajnih simulacijskih metod, ki jih najdemo v obstoječih programskih paketih, ESPResSo++ omogoča tudi poganjanje simulacij z uporabo metode prilagodljive ločljivosti AdResS (Adaptive Resolution Scheme). Pri takih simulacijah spreminjamo opis molekul v odvisnosti od njihovega položaja. Glavno vodilo pri razvoju programskega paketa ESPResSo++ je razširljivost, zato je jedro modularno zasnovano v programskem jeziku C++ in povezano s skriptnim programskim jezikom Python. Na ta način omogočimo enostavno dodajanje novih algoritmov, pripravo simulacij, analizo med tekom simulacije, uporabo zapletenih potekov dela in usmerjanje simulacij. Izjemna prožnost programskega paketa omogoča študijo širokega razpona sistemov. Modularna zasnova omogoča raziskovalcem, da uporabljajo ESPResSo++, kot platformo za njihov lastni metodološki razvoj. S tem se programski paket s časom razvija in prevzema najbolj sodobne metode. ESPResSo++ deluje na različnih arhitekturnih sistemih in je izdan pod GNU General Public Licence.
COBISS.SI-ID: 5164058
Podamo pregled teoretičnih osnov simulacijske metode prilagodljive ločljivosti AdResS. Metoda omogoča spreminjanje molekularne resolucije med samim potekom simulacije s spreminjanjem števila prostostnih stopenj v določenih regijah sistema, kjer potrebujemo višjo ločljivost kot v preostalem sistemu. Poročamo tudi nedavni razširitvi metode v kontinuumski in kvantni režim.
COBISS.SI-ID: 5084186