V članku je opisana anotacija genskih skupin za biosintezo naravnih spojin, pri katerih sodelujejo modularni biosintezni enicimi poliketid sintaze (PKS) in neribosomske peptid sintetaze (NRPS), v genomu S. tsukubaensis, ki ga je pred kratkim sekvenciral Acies Bio. Analiza teh zelo velikih genov v genomih, pridobljenih s tehniko pirosekvenciranja, je zelo težavna, saj so genske skupine razporejene na več kontigih, napake v sekvenciranju povzročajo navidezne prekinitve bralnih okvirjev, ti geni pa pogosto vsebujejo tudi zelo dolge ponavljajoče regije. Članek opisuje analizo genoma s filogenetskim pristopom in programom ClustScan, ki sta omogočila identifikacijo 4 PKS genskih skupin in 6 NRPS genskih skupin v genomu S. tsukubaensis. Z reakcijo PCR in sekvenciranjem smo popravili navidezne zamike bralnih okvirjev, z RT-PCR pa smo potrdili aktivno transkripcijo ene od identificiranih genskih skupin.
COBISS.SI-ID: 4142456