Sev Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 proizvaja pomembno učinkovino rapamicin in ima 12.7 Mb velik genom, kateri vsebuje čez 3 Mb genskih biosinteznih skupin za 48 sekundarnih metabolitov. Po pregledu glavnega ogrodja genoma smo ugotovili 10425 potencialnih protein-kodirajočih genov. Program ClustScan je našel 25 modularnih genskih skupin za sekundarne metabolite, od tega 13 tip I PKS genskih skupin, 5 NRPS genskih skupin in 7 mešanih PKS-NRPS genskih skupin, vključujoč tudi gensko skupino za biosintezo rapamicina. S programom antiSmash smo potrdili teh 25 modularnih skupin in hkrati odkrili še dodatnih 23 genskih skupin drugih tipov za biosintezo sekundarnih metabolitov. Pridobljeno zaporedje genoma je omogočilo bistveno izboljšalo razumevanje rekombinacijskih mehanizmov v sevu Streptomyces rapamycinicus in z njimi povezanih genskih homologov in tako olajšalo izvedbo aktivnosti pri izvedbi projekta.
COBISS.SI-ID: 4278904
Članek opisuje pripravo mutantov naravnega in industrijskega visoko-donosnega seva Saccharopolyspora erythraea z inaktiviranim oziroma čezmerno izraženim regulatornim genom SACE_5599, ki smo jih pripravili na podlagi rezultatov WP3 in boljšega razumevanja homologne rekombinacije, ki smo ga pridobili v okviru tega projekta... Inaktivacija SACE_5599 v industrijskem sevu je zelo znižala donos eritromicina in intenziteto sporulacije. Nasprotno pa je čezzmerno izražanje gena SACE_5599 v divjem tipu NRRL23338 povzročilo povečanje donosa eritromicina za 32%. Po odkritju regulatorja bldD je SACE_5599 je drugi domnevni regulatorni gen, ki je bil odkrit v S. erythraea in ima pozitiven učinek na donos eritromicina. Podobno kot bldD je tudi SACE_5599 vpleten v morfološki razvoj S. erythraea, kar nakazuje zelo tesno povezavo med biosintezo sekundarnih metabolitov in morfološko diferenciacijo pri tem organizmu.
COBISS.SI-ID: 3005775