Dandanes je težko slediti razvoju znanja na področju biomedicine tudi na ožjih strokovnih področjih. Značilen je namreč izjemen porast znanstvenih prispevkov, ki se dnevno objavljajo v revijah. Čeprav so spletni iskalniki in specializirani sistemi za iskanje informacij izrazito napredovali v zadnjih desetletjih, problem natančne avtomatske ekstrakcije znanja iz biomedicinske literature še zdaleč ni rešen. Sistemi za iskanje po navadi vrnejo seznam dokumentov, ki jih je potrebno prebrati, da lahko uporabnik izlušči relevantne informacije. To časovno zahtevno delo pa lahko olajšajo sistemi za odgovarjanje na vprašanja (Question answering systems), katerih cilj je, da uporabniku podajo natančne odgovore na njegova vprašanja. V tem delu podajamo novo metodologijo za odgovarjanje na vprašanja z uporabo semantičnih relacij na biomedicinskem področju. S sistemom za procesiranje jezika SemRep smo pregledali 122.421.765 stavkov iz 21.014.382 bibliografski zapisov iz zbirke MEDLINE (kompleten MEDLINE do leta 2012) in izluščili 58.879.300 semantičnih relacij, ki smo jih organizirali v relacijski bazi podatkov. Aplikacija SemBT, ki išče po omenjeni bazi podatkov, je odprta spletna aplikacija, dostopna na: http://sembt.mf.uni-lj.si. Naredili smo obsežno evalvacijo predlagane metodologije pri kateri je sodelovalo 80 strokovnjakov s področja biomedicine. Skupno so evalvirali 7.510 semantičnih relacij. Natančnost evalvacij je 68%. V tem delu predlagamo in predstavljamo inovativno metodologijo za odgovarjanje na vprašanja v biomedicinskih znanostih. Sistem je implementiran kot spletna aplikacija, ki nam nudi odgovore na različne tipe vprašanj. Odgovor na tipično vprašanje uporabnik prejme v nekaj sekundah. Aplikacija ima določene dodatke, ki so posebej uporabni za DNA mikromreže.
COBISS.SI-ID: 2048297218
Pripravili smo novo dvoplastno medicinsko oblogo za lajšanje bolečin ran iz kombinacije biokompatibilnih polimerov karboksimetilceluloze in polietilen oksida ter dvema zdravilnima učinkovinama iz različnih farmakoterapevtskih skupin proti bolečinam, diklofenaka in lidokaina. Da bi dosegli dvoplastno strukturo, smo uporabili sodobno tehniko elektropredenja in impregnacijo komercialne medicinske obloge Aquacel. Z elektropredenjem pripravljena nanovlakna imajo podobne značilnosti, kot jih ima ekstracelularni matriks (ECM), ki je pomemben sestavni del kože in igra ključno vlogo pri celjenju ran. Drugi sloj temelji na Aquacel, ki predstavlja eno izmed bolj pomembnih medicinskih oblog v trenutni klinični praksi. Ker lahko bolečina drastično zniža celjenj ran in hkrati kvaliteto življenja bolnikov, je lajšanje bolečine s pomočjo protibolečinskih medicinskih oblog zelo zanimiva za aplikacije v oskrbi ran. Za učinkovito zmanjšanje bolečine, smo uporabili dve vrsti zdravil, ki sta primerni za lajšanje bolečine različnega izvora, in sicer tiste, ki je prisotna zaradi rane same ter tiste, ki je povezana s samim zdravljenjem (prevezovanje…). Združene lastnosti vgrajenih ZU za lajšanje bolečin zdravil in omenjenih materialov, so zato zelo zanimive za prihodnje študije sorodnih medicinskih oblog v smeri kliničnega preskušanja možnih prototipnih izdelkov.
COBISS.SI-ID: 19019798
Za preživetje v okolju, živilsko-predelovalni in povzročanje bolezni, Campylobacter jejuni zahteva posebne mehanizme za preživetje, kot so formiranje biofilmov, ki pripomorejo k njegovem prenosu skozi prehranjevalno verigo do humanega gostitelja in predstavljajo kritično obliko odpornosti za različne protimikrobne snovi. Fitokemijska analiza etanolnega izvlečka timijana (TE), njegovega preostanka po hidrodestilaciji (TE-R), in izvlečka oljčnih listov (OE) z uporabo tekočinske kromatografije visoke ločljivosti je pokazala, da so glavne sestavine v TE in TE-R flavonski glukuronidi in derivati rožmarinske kisline ter v OE verbaskozid, luteolin 7-O-glukozid in oleurozid. TE in TE-R sta zmanjšala adhezijo C. jejuni na abiotske površine do 30% pri 0.2-12.5 ug ml-1; TE-R pa je imel še bolj izrazit učinek. OE je v koncentracijskem razponu od 3.125 do 200 mcg ml-1 znižal adhezijo C. jejuni na polistiren s 10-23%. Po drugi strani pa je adhezija C. jejuni na PSI celice bila inhibirana za skoraj 30% znotraj velikega koncentracijskega razpona uporabljenih ekstraktov. Naši rezultati kažejo, da TE, odpadni material agroživilske industirje TE-R in stranski produkt OE predstavljajo vir bioaktivnih fitokemikalij, ki so učinkoviti pri nizkih koncentracijah in se lahko uporabljajo kot terapevtska sredstva za preprečevanje bakterijske adhezije.
COBISS.SI-ID: 4558200
Medicinske obloge, ki lahko lokalno kontrolirano dostavijo nesteroidne protivnetne zdravilne učinkovine (NSAID) direktno v rano, ponujajo veliko možnosti za pospešitev celjenja ran, s čemer prispevajo tudi k povečani kakovosti življenja bolnikov. Lokalna dobava NSAID zmanjša tudi obseg neželenih stranskih učinkov, s katerimi se bolniki srečujejo v primeru njihove sistemske dostave. V tej študiji predstavljamo razvoj štirih funkcionalnih vlaknatih materialov v ta namen, in sicer viskoze, alginata, natrijeve karboksimetilceluloze (Na-CMC) in polietilen tereftalata (PET) z vgrajenim NSAID diklofenakom. Ovrednotili smo njihovo primernost za nadzorovanje hitrosti sproščanja z DCF. S skrbnim pregledom kombinacije materialov z DCF v smislu njihovih fizikalno-kemijskih lastnosti (prepustnost zraka, omočljivost in zadrževanje vode) in strukturnih / morfoloških lastnosti (infrardeča spektroskopija, širokim kotom rentgensko sipanje in vrstično elektronsko mikroskopijo), predlagamo tudi možne aplikacije različnih kombinacij za nego različnih tipov ran. Z izvedbo študij in vitro sproščanja z uporabo avtomatskega sistema Francovih difuzijskih celic, v kombinaciji z UV-Vis absorpcijsko spektroskopijo za določanje profilov sproščanja DCF, smo ovrednotili tudi njihovo delovanje v simuliranem okolju rane. Rezultati so pokazali pomembne razlike v profilih sproščanja med različnimi kombinacijami materialov z DCF, zaradi česar s le te uporabne v različnih aplikacijah za nego ran. Ta študija predstavlja nov stroškovno učinkovit pristop za pripravo kombinacij ZU z medicinskimi oblogami brez znižanja varnosti pacientov.
COBISS.SI-ID: 18922262
Vedno več dokazov nakazuje, da imajo pomembno vlogo za nastanek celikije poleg dednosti tudi drugi okoljski dejavniki, kot je neravnovesje črevesne mikrobiote. Namen naše raziskave je bil ugotoviti vpliv uživanja dveh probiotičnih sevov Bifidobacterium breve BR03 in B. breve B632 na serumsko produkcijo protivnetnega citokina interlevkina 10 (IL-10) in provnetnega citokina dejavnika tumorske nekroze alfa (TNF-α). Raziskava je bila dvojno-slepa, kontrolirana s placebom, v kateri je bilo vključenih 49 otrok s celiakijo na brezglutenski dieti (BGD), ki so bili randomizirani v 2 skupini ter 18 zdravih otrok v kontrolni skupini. Prva skupina (24 otrok s celiakijo) je dnevno 3 mesece uživala B. breve BR03 in B632 2×109 CFU) in druga skupina (25 otrok s celiakijo) je uživala placebo. V prvi skupini so se vrednosti TNF-α 3 mesece po uživanju B.breve značilno znižale. Ob kontroli, 3 mesece po koncu jemanja probiotika, so se vrednosti TNF-α ponovno dvignile. Otroci s celiakijo, ki so bili na BGD pod 1 leto, so imeli podobne izhodiščne vrednosti TNF-α kot otroci s celiakijo na BGD nad 1 leto. Vrednosti IL-10 so bile v vseh skupinah otrok pod mejo detekcije. Uživanje probiotičnih sevov B. breve je imelo pozitivni vpliv na znižanje provnetnega citokina TNF-α pri otrocih s celiakijo na BGD.
COBISS.SI-ID: 512528696