V raziskavo genetske raznolikosti fižola iz petih republik bivše Jugoslavije (Slovenija, Hrvaška, BiH, Srbija, Makedonija) je bilo vključenih 119 akcesij. V genetski karakterizaciji smo uporabili 13 mikrosatelitnih markerjev, ki so se že v predhodnih študijah izkazali v razločevanju genotipov ter v klasifikaciji fižola na podlagi izvornega genskega sklada. Skupaj je bilo zabeleženih 118 alelov ali v povprečju 9,1 na lokus. Visoke vrednosti izračunanih parametrov, kot so pričakovana heterozigotnost (0.76), Shannonov informacijski indeks (2,44) ter vsebnost polimorfne informacije (angl. polymorphic information content) (0.72) dokazujejo uporabnost izbranih markerjev kot tudi obsežno genetsko raznolikost prisotno v proučevani dednini. Za štiri države (Slovenijo, Hrvaško, BiH in Srbijo) smo ugotovili primerljivo raven raznolikosti, ki smo jo ocenili na podlagi števila alelov, števila efektivnih alelov, Shannonovega informacijskega indeksa ter pričakovane heterozigotnosti. Nekoliko nižjo raven raznolikosti smo zasledili v skupini makedonskih akcesij, kljub temu pa smo v tej skupini zasledili največ privatnih alelov, značilnih samo za to skupino. Analiza molekulske variance (AMOVA) je pokazala, da je pretežni del od skupne genetske raznolikosti skupen vsem petim dedninam. Na podlagi izračuna števila migrantov je mogoče sklepati, da najintenzivnejši tok genov v regiji vodi v oz. izven BiH, najmanj intenziven pa je značilen za Makedonijo. Razlikovanje makedonskih akcesij od ostalih je nakazala tudi klastrska analiza, saj je bilo na UPGMA dendrogramu mogoče opaziti ločeno grupiranje makedonskih akcesij od vseh ostalih. Na dendrogramu so se vse akcesije porazdelile v dve večji skupini, ki sta ustrezali dvema genskima skladoma oz. gencentroma fižola: andskemu in srednjeameriškemu. Ugotovili smo, da v vseh republikah prevladujejo andski genotipi, razen v Makedoniji, kjer sta deleža izenačena. Ti izsledki nakazujejo, da je navadni fižol na območje Zahodnega Balkana vstopil preko zahodne, mediteranske poti. Zmerno razhajanje v vzorcu raznolikosti pri makedonskih akcesijah pa je najverjetneje posledica vpliva geografske umeščenosti. Za makedonski sosedi, Bolgarijo in Grčijo, je namreč značilna bistveno večja zastopanost srednjeameriškega genskega sklada, kar bi lahko vplivalo na okrepljen dotok srednjeameriških genotipov v Makedonijo. Bayesova klastrska analiza, opravljena na podlagi molekulskih podatkov, je nakazala obstoj dodatne raznolikosti znotraj Andskega genskega sklada. V članku so prikazani nekateri možni scenariji njenega izvora.
COBISS.SI-ID: 4823400
Na osnovi testiranj v osmih laboratorijih smo primerjali relativno točnost, diagnostično občutljivost, diagnostično specifičnost, analitično občutljivost in ponovljivost 4 metod za detekcijo pospiviroidov: ANSES 1-2 (par RT-PCR metod), Botermans 1- 2 (par metod RT-PCR v realnem času), Luigi (ena RT-PCR metoda) in Olivier (ena RT-PCR metoda). Vsako metodo smo testirali na 13 vzorcih listov paradižnika in devetih vzorcih semen paradižnika kot tudi na 100-kratnih razredčitvah posameznih ekstraktov RNA. Ovrednotili smo tudi dva različna kompleta za ekstrakcijo RNA in tri kombinacije ekstrakcijskih kompletov in kompletov reagentov za RT-PCR. Na osnovi statistične analize je dala najboljše rezultate metoda ANSES 1-2, zato jo predlagamo kot mednarodno standardno metodo za generično detekcijo pospiviroidov. Med ekstrakcijskima kompletoma kakor tudi med tremi kombinacijami ekstrakcijskih kompletov in kompletov reagentov za RT-PCR nismo potrdili statistično značilnih razlik v točnosti.
COBISS.SI-ID: 4863080
Sekundarni metaboliti seva Micro Cyclospora malicola (Capnodiales) so bili analizirani za ugotavljanje morebitnih novih bioaktivnih naravnih proizvodov. Gliva spada v skupino počasi rastočih sajastih glivic, ki lahko preživijo v plasteh povoščenih rastlinskih povrhnjic, še posebej jabolk, brez povzročanja znatne sadne gnilobe ali rastlinskih bolezni. Biološki poskus je bil voden frakcionirano in kasneje določana struktura, ki je z uporabo spektroskopskih in spektroskopskih metod privedla do identifikacije obionina A in dodatnih derivatov (naftokinon metabolitov), ki kažejo citotoksične učinke in protiglivično delovanje. Spojina, prvotno izolirana iz morskih ascomycet Leptosphaeria obiones, lahko predstavlja antagonizem med M. malicola in drugimi epifitskimi glivami, ki tekmujejo za iste ekološke niše na sadju.
COBISS.SI-ID: 4984424
Kot mnogi patogeni, tudi rastlinsko parazitske ogorčice izločajo efektorje, da spremenijo celične funkcije gostitelja in uspešno napadejo rastlino. Pripravili smo zbirko odprtih bralnih okvirov, ki kodirajo verjetne apoplastične efektorje pri ogorčici Globodera rostochiensis v vektorjih za ekspresijo v rastlina ter klone ovrednotili. Proteini za razgradnjo celične stene so povzročili nekroze in kloroze, kar se sklada z njihovo vlogo pri spremembi usode celic gostitelja in invazijo tkiva. Pokazali smo novo vlogo za apoplastilčni protein podoben ekspanzinu (GrEXPB2): zmanjšanje rastlinskega imunskega odziva, vključno z odzivom znotraj celice (NB-LRR signalizacija v citoplastu). Odziv na GrEXPB2 je različen pri različnih gostiteljih in za proteine z različno primarno strukturo.
COBISS.SI-ID: 4630888
OZADJE: V okviru dvoletne raziskave smo ocenili učinkovitost biotičnega zatiranja koruzne vešče (ECB), Ostrinia nubilalis (Hübner), z optimalnim izpustom Trichogramma brassicae, kot orodjem v okviru integriranega varstva koruze. Poskuse smo izvajali na kmetijah v realnih razmerah pridelave koruze v treh evropskih regijah z neenakimi geoklimatskimi pogoji in pritiskom ECB, ter različnim konvencionalnim varstvom pred ECB (tj uporaba oz. neuporaba insekticidov proti ECB). REZULTATI: Biotično varstvo s parazitoidi Trichogramma (1), je omogočilo varstvo pred ECB primerljivo s konvencionalnim varstvom. (2) V vseh primerih je bila raven mikotoksinov v koruzi pod zakonskim pragom EU za koruzo za živilske proizvode. (3) Ekonomsko je bila strategija sprejemljiva v južni Franciji in severni Italiji, ne pa v Sloveniji, kjer je prišlo do pomembnega zmanjšanja v bruto prihodku, predvsem zaradi stroškov Trichogramma proizvoda. (4) Uporaba parazitoidov Trichogramma je preprečila škodljive okoljske in zdravstvene učinke uporabe insekticidov na osnovi aktivne učinkovine lambda-cihalotrin v severni Italiji. ZAKLJUČEK: Optimalno tempiran izpust parazitoidov T. brassicae se lahko smatra kot trajnostno orodje v okviru integriranega varstva proti ECB v južni Franciji in severni Italiji. Potrebno bi bilo izboljšati sodelovanje regionalnih svetovalnih služb za širjenje in izboljšanje izvajanje biotičnega varstva. Subvencijske sheme bi lahko tudi motivirale kmete, da sprejmejo to IVR orodje in jim nadomestijo izpad prihodka zaradi visokih stroškov Trichogramma izdelka.
COBISS.SI-ID: 4813928