ClowdFlows je odprta platforma v oblaku za sestavljanje, izvajanje in deljenje interaktivnih delotokov za podatkovno rudarjenje. V tem članku opisujemo razširitev platforme ClowdFlows z zmožnostmi za obdelavo podatkovnih tokov v realnem času. Te zmožnosti smo vključili z razvojem specializiranih tipov delotočnih komponent in programa za rudarjenje podatkovnih tokov, ki delegira izvajanje delotokov v realnem času. Na ta način smo platformo za obdelavo statičnih podatkov spremenili v platformo za obdelavo podatkovnih tokov z intuitivnim uporabniškim vmesnikom.
F.15 Razvoj novega informacijskega sistema/podatkovnih baz
COBISS.SI-ID: 27392039Nada Lavrač je imela vabljeno predavanje z naslovom "Advances in data mining for biomedical research" na mednarodni konferenci "13th European Conference on Computational Biology (ECCB 2014)", 7.-10.9.2014 v Strasbourgu v Franciji (http://eccb.iscb.org/2014/)- konference se je udeležilo okrog 1200 udeležencev. Podobno predavanje je imela tudi na "34th Joint Conference on Medical Informatics JCMI 2014 & 15th Annual Conference of Japan Association for Medical Informatics", 6.-8.11. 2014 v Chiba na Japonskem [COBISS.SI-ID 28099879] (http://www.ho.chiba-u.ac.jp/jcmi2014/Program.html). Predavanje je poslušalo okrog 800 slušateljev od 2000 registriranih udeležencev konference. Nada Lavrač je imela na to temo tudi vabljeno predavanje 16.4.2014 v okviru cikla "Znanstveni večeri", ki ga Univerza v Novi Gorici organizira v dvorcu Lanthieri v Vipavi. [COBISS.SI-ID 27648039]
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 27941159Kljub biološkim raziskavam obrambnega odziva rastlin na virusne okužbe, celovit matematični model tega kompleksnega procesa doslej še ni bil razvit. Ena od ovir pri razvoju dinamičnega modela, ki bi bil hkrati uporaben za simulacijo, je pomanjkanje kinetičnih podatkov iz katerih bi se lahko določili parametri takega modela. Kot rešitev tega problema smo v tej raziskavi predlagali metodologijo za iterativno optimizacijo parametrov modela. Postopek se ponavlja dokler se rezultati simulacije ne približajo pričakovanjem domenskih strokovnjakov (biologov). Ta pričakovanja so formalizirana v obliki omejitev, ki jim morajo zadoščati simulacije modela. V naši raziskavi je model omejitvam zadostil v treh korakih optimizacije. Opisani pristop ima dva glavna rezultata: posamezne simulacije obrambnega odziva in parametre modela. Oboje omogoča globlji vpogled v opazovani biološki sistem. Predlagani omejitveno usmerjeni optimizacijski pristop omogoča učinkovito preučevanje dinamičnega obnašanja bioloških modelov, hkrati pa povečuje njihovo zanesljivost.
F.11 Razvoj nove storitve
COBISS.SI-ID: 27540775Multiformni glioblastom (GBM) je možganski tumor ki sodi med najagresivnejše primarne tumorje z izjemno kratko tipično preživetveno dobo, ki znaša le od 12 do 15 mesecev, brez zdravljenja pa samo 3 mesece. V okviru študije je bila izvedena analiza 734 microRNA molekul 16 zdravih oseb ter 16 pacientov z GBM. Eden od najpomembnejših rezultatov študije je identifikacija skupine desetih microRNA molekul, ki izkazujejo diagnostični kot tudi prognostični potencial. Dve izmed njih, hsa-miR-592 ter hsa-miR-514a-3p, do sedaj še nista bili prepoznani v povezavi z multiformnim glioblastomom in sta zato pomembna potencialna kandidata za selektivna biološka kazalca.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 3453007Nada Lavrač je imela vabljeno predavanje z naslovom "Relacijsko in semantično rudarjenje podatkov" na mednarodni konferenci LPNMR 2015, ki je potekala od 27.-30. septembra v Lexingtonu, KY, ZDA. Konference se je udeležilo okoli 200 udeležencev. [COBISS.SIID: 28943911]
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 28943911