Člana projektne skupine sta sodelovala v raziskavi, katere namen je bil načrtovati, sintetizirati in testirati biološko aktivnost panela konformacijsko omejenih mimetikov lipida A, ki so osnovani na ogrodju β,α-trehaloze. Pokazali so, da bifosforilirani mimetiki lipida A, ki temeljijo na ogrodju β-GlcN(1↔1)α-GlcN, selektivno onemogočijo vezavo LPS tako na človeški kot tudi na mišji MD-2 ter popolnoma inhibirajo vnetni odziv, ki ga sproži LPS. Ti mimetiki predstavljajo nove kandidate za zdravljenje sepse. Rezultati te študije nakazujejo, da poleg kemijske sestave tudi tridimenzionalna razporeditev diglukozamiskega ogrodja lipida A ob vezavi na MD-2 določa vnetni odziv preko receptorja TLR4. Inhibitorji signalne poti TLR4 so tudi učinoviti inhibitorji prve stopnje aktivacije NLRP3-inflamasoma, kadar ta poteče preko receptorja TLR4, npr. v primeru infekcij z Gram-negativnimi bakterijami.
COBISS.SI-ID: 3262344
Za učinkovit boj proti epidemiji okužb z virusom pridobljene imunske pomanjkljivosti potrebujemo stalen razvoj novih inhibitorjev proteaze HIV. Na osnovi metode FRET smo razvili na HIV-proteazo občutljiv senzor, ki temelji na uporabi para fluorescenčnih proteinov, in sicer mCerulean in mCitrine, ki omogoča rešetanje velikega števila potencialnih inhibitorjev HIV-protaze s pretočno citometrijo. Podoben senzor lahko pripravimo tudi za spremljanje aktivacije inflamasoma, kjer bi spremljali aktivacijo kaspaze-1.
COBISS.SI-ID: 5383706
Elektronskega računalnika vezja, ki vsebujejo veliko število povezanih logičnih vrat istega tipa, kot je NOR stikalo , se lahko enostavno izdeluje in omogoča izvajanje poljubnih logičnih funkcij. V nasprotju z elektroniko pa moramo uporabiti ortogonalne gensko-regulatorne elemente zaradi proste difuzije v celicah. Kombinatorično raznolikost in ortogonalnost lahko zagotovimo z modularnimi DNK-vezalnimi domenami. Uporabili smo represorje na osnovi TAL efektorjev, za gradnjo ortogonalnih funkcijsko polnih NOR vrata za gradnjo logičnih vezij . Pokazali smo izvedbo vseh 16 dvovhodnih logičnih funkcij na osnovi kombinacij istega tipa NOR vrat v človeških HEK293 celicah. Poleg tega smo predstavili genetsko logično vezje, v katerem lahko izberemo izvedbo med AND in OR funkcijo za obdelavo podatkov. Ta dosežek demonstrira potencial modularnih transkripcijskih faktorjev za gradnjo kompleksnih bioloških naprav za obdelavo podatkov.
COBISS.SI-ID: 5408026