Pretvorba prionskega proteina (PrP) je ključni dogodek pri prionskih boleznih, vendar pa je mehanizem tega procesa še vedno neznan. V študiji smo preučevali, kako na pretvorbo vplivajo patološke mutacije in sprememba pH. Pokazali smo, da patološke mutacije pospešijo pretvorbo. Raziskovali smo tudi vpliv pH in pokazali, da je za pretvorbo PrP ob znižanju pH ključna protonacija histidina 187. Če smo slednjega zamenjali za tirozinski aminokislinski ostanek, smo pretvorbo zelo upočasnili. Načrtali smo tudi dodatne histidinske ostanke, ki so imeli podoben vpliv kot H187 le, kadar so se nahajali na interakcijski površini med poddomenama, ne pa kadar so se nahajali na površini proteina. Opazili smo močno povezavo med stabilnostjo nativne strukture in kinetiko pretvorbe PrP. Naši rezultati demonstrirajo, da patološke mutacije olajšajo ločitev poddomen in nakazujejo, da bi bilo povečanje stabilnosti nativne strukture smiselna strategija pri razvoju novih terapij še neozdravljivih prionskih bolezni.
COBISS.SI-ID: 5610266
Elektronska računalniška vezja, ki vsebujejo veliko število povezanih logičnih vrat istega tipa, kot so vrata NOR, lahko enostavno izdelamo, omogočajo pa izvajanje katerekoli logične operacije. V nasprotju z elektronskimi vezji moramo zaradi proste difuzije v celicah uporabiti ortogonalne genske regulatorne elemente. Kombinatorično raznolikost in ortogonalnost lahko zagotovimo z modularnimi DNA-vezalnimi domenami. Logična vezja smo sestavili na osnovi ortogonalnih NOR vrat, pri čemer smo uporabili represorje na osnovi TAL-efektorjev. Na osnovi kombinacij NOR vrat smo izvedli vseh 16 dvovhodnih logičnih operacij v človeških celicah HEK293 in pokazali, da po enakem principu lahko sestavimo tudi bolj zapleteno logično vezje. Ta dosežek demonstrira potencial modularnih transkripcijskih faktorjev za gradnjo kompleksnih bioloških naprav za obdelavo podatkov.
COBISS.SI-ID: 5408026
Z elektroporacijo povečamo prepustnost celične membrane, vendar lahko na celici povzročimo tudi poškodbe, kot so izguba vsebine citosola, tvorba reaktivnih kisikovih spojin, zatekanje, nekroza ali pa apoptoza. Raziskovali smo ali elektroporacija makrofagov in vitro vodi do aktivacije inflamasoma NLRP3 in zorenja IL-1b. Pokazali smo, da elektroporacija sproži vnetni odziv preko zorenja IL-1b, ki pa je neodvisno od receptorja NLRP3.
COBISS.SI-ID: 10780500